Este es el comando fastq-clipper que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fastq-clipper - ea-utils: elimina una o más secuencias de adaptadores del archivo fastq
DESCRIPCIÓN
uso: fastq-clipper [opciones]
Elimina una o más secuencias de adaptadores del archivo fastq. Las secuencias de adaptadores son
delimitado por dos puntos. Las estadísticas van a stderr, a menos que -o está especificado.
CAMPUS
-h Esta ayuda
-o Archivo de salida FIL (estadísticas a stdout)
-p N Porcentaje máximo de diferencia (10)
-m N Longitud mínima de clip (1)
-l N Longitud mínima de secuencia restante (15)
-x [N] Longitud extra de coincidencia más allá de la longitud del adaptador,
N = -1: buscar todo N = 0: buscar solo hasta la longitud del adaptador
-e Fin de línea (predeterminado)
-b Principio de línea (aún no admitido)
Use fastq-clipper en línea usando los servicios de onworks.net
