Este es el comando genome-music-plot-mutation-Relationsp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
relación de mutación de la trama de la música del genoma: crea tramas para los resultados de la relación de mutación
del IRS
VERSION
Este documento describe la relación de mutación de la trama musical del genoma versión 0.04 (2016-01-01 at
23:10:18)
SINOPSIS
genoma música trama mutación-relación --input-matrix =? --salida-pdf =?
[--skip-zero-mut-samples] [--genes-to-plot =?] [--plot-genes-in-order-enumerados]
REQUERIDOS ARGUMENTOS
matriz de entrada Cordón
Una matriz de gen / muestra generada por la herramienta de relación de mutación
salida-pdf Cordón
Un archivo pdf de salida para dibujar la trama
OPCIONAL ARGUMENTOS
saltar-cero-mut-muestras Boolean
No grafique muestras que no tengan mutaciones en ningún gen que se esté graficando
Valor predeterminado 'verdadero' si no se especifica
noskip-cero-mut-muestras Boolean
Hacer que skip-zero-mut-samples sea 'falso'
genes para trazar Cordón
Lista de genes separados por comas para trazar (ejemplo: DNMT3A, NPM1)
parcela-genes-en-orden-listados Boolean
Trace los genes en el orden en que aparecen. El valor predeterminado es trazarlos en forma descendente
ordenar por número de mutaciones
Valor predeterminado 'falso' (--noplot-genes-in-order-enumerados) si no se especifica
noplot-genes-in-order-enumerados Boolean
Hacer que plot-genes-in-order-enumerados sea 'falso'
DESCRIPCIÓN
Dada una matriz generada usando "relación de mutación de música - archivo de matriz de mutación", esta herramienta
generará una trama que resalte la exclusividad mutua o concurrencia entre los
estado de mutación de un conjunto predefinido de genes.
Utilice genome-music-plot-mutation-Relationsp en línea utilizando los servicios de onworks.net
