Este es el comando gmt-music-bmrp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gmt music bmr: calcula las coberturas de genes y las tasas de mutación de fondo.
VERSIÓN
Este documento describe gmt music bmr versión 0.04 (2016-01-01 a las 23:10:19)
SINOPSIS
gmt música bmr ...
DESCRIPCIÓN
Estas herramientas forman parte de la suite MuSiC.
SUBCOMANDOS
GENERAL
calc-bmr
Calcula las tasas de mutación dada la cobertura por gen (de "music bmr calc-covg") y un
lista de mutaciones
calc-covg
Utiliza calcRoiCovg.c para contar las bases cubiertas por gen para cada par dado de tumores normales
BAM.
calc-covg-ayudante
Utiliza calcRoiCovg.c para contar las bases cubiertas por gen para un par de BAM normales para el tumor.
calc-peluca-covg
Cuente las bases cubiertas por gen para cada archivo de formato de pista de movimiento dado.
Use gmt-music-bmrp en línea usando los servicios de onworks.net
