Este es el comando gt-encseq-decode que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gt-encseq-decode: decodifica / extrae secuencias codificadas.
SINOPSIS
gt encseq descodificar (archivo_secuencia | nombre de índice)
DESCRIPCIÓN
espejado [si | no]
anexar virtualmente el complemento inverso de cada secuencia (predeterminado: no)
-sin pérdida [si | no]
permitir la recuperación de la secuencia original sin pérdidas (predeterminado: no)
es [cadena]
especificar la dirección de lectura (fwd, cpl, rev, rcl) (predeterminado: fwd)
-caracteres individuales [si | no]
no use un GtEncseqReader, pero acceda a cada carácter de secuencia por separado (predeterminado:
No)
-sec [propuesta de]
extraer secuencia identificada por su número (predeterminado: indefinido)
-seqrango [comienzo final]
extraer varias secuencias consecutivas (predeterminado: indefinido)
-producción [...]
especificar formato de salida (elegir entre fasta | concat) (predeterminado: fasta)
-rango [comienzo final]
rango concatenado para extraer (implica -producción concat) (predeterminado: indefinido)
-sepchar [cadena]
especificar carácter para imprimir como SEPARADOR (predeterminado: |)
-ayuda
mostrar ayuda para opciones básicas y salir
-ayuda +
mostrar ayuda para todas las opciones y salir
-versión
mostrar información de la versión y salir
PRESENTACIÓN DE INFORMES LOCO
Informar errores a[email protected]>.
Use gt-encseq-decode en línea usando los servicios de onworks.net
