Este es el comando gt-gff3validator que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gt-gff3validator: valida estrictamente los archivos GFF3 dados.
SINOPSIS
gt validador gff3 [opción ...] [GFF3_file ...]
DESCRIPCIÓN
-comprobación de tipo [cadena]
utilice una ontología proporcionada en un archivo OBO para validar las relaciones entre padres e hijos. Si no
se proporciona el argumento, se utiliza el archivo sofa.obo del directorio gtdata / obo_files. Si
se proporciona un argumento, se utiliza como un nombre de archivo OBO. En el caso de que dicho archivo no
no existe .obo se agrega al argumento y carga el nombre de archivo resultante de la
Se intentó el directorio gtdata / obo_files. (predeterminado: indefinido)
-xrfcheck [cadena]
compruebe los atributos Dbxref y Ontology_term para la sintaxis correcta de acuerdo con un
archivo de definición de abreviaturas. Si no se proporciona ningún argumento, el archivo GO.xrf_abbs del
Se utiliza el directorio gtdata / xrf_abbr. Si se da un argumento, se utiliza como un
nombre de archivo para un archivo de abreviatura. En el caso de que dicho archivo no exista,
.xrf_abbr se agrega al argumento y carga el nombre de archivo resultante de la
Se intentó el directorio gtdata / xrf_abbr. (predeterminado: indefinido)
-ayuda
mostrar ayuda y salir
-versión
mostrar información de la versión y salir
PRESENTACIÓN DE INFORMES LOCO
Informar errores a[email protected]>.
Use gt-gff3validator en línea usando los servicios de onworks.net
