Este es el comando kmc_tools-sort que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
kmc_tools-sort - ordena las bases de datos de KMC
SINOPSIS
kmc_herramientas sort [input_params] [output_params]
DESCRIPCIÓN
Convierte la base de datos producida por KMC2.x al formato de base de datos KMC1.x (que contiene k-mers en
orden ordenado)
OPCIONES
Para cada entrada hay parámetros adicionales:
-ci
excluir k-mers que ocurren menos de veces
-cx
excluir k-mers que ocurren más de veces
Para la salida hay parámetros adicionales:
-cs
valor máximo de un contador
EJEMPLO
kmc_tools ordenar wy_kmc2 -ci3 -cx1000 wy_kmc1 -cs255
Use kmc_tools-sort en línea usando los servicios de onworks.net
