Este es el comando LAshow que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
LAshow: muestra alineaciones locales de archivos .las
SINOPSIS
LAmostrar [-caroUF] [-iint(4)] [-wint(100)][-bint(10)] src1: db | presa [src2: db | presa] alinear: las
[lee: ARCHIVO | lee: rango ...]
DESCRIPCIÓN
LAmostrar produce una lista impresa de las alineaciones locales contenidas en el .las especificado
archivo, de donde provienen las lecturas a y b src1 o desde src1 y src2, respectivamente. Si un
se proporciona un archivo o una lista de rangos de lectura, entonces solo las superposiciones para las que se encuentra la lectura a
se muestra el conjunto especificado por el archivo o la lista. Ver DBmostrar(1) para una explicación de
cómo se interpretan el archivo y la lista de rangos de lectura.
CAMPUS
-F Invertir los roles de las lecturas a y b en la pantalla
-U Use mayúsculas para la secuencia de ADN en lugar de las minúsculas predeterminadas
-isangría
Establezca la sangría para las visualizaciones de dibujos animados y / o alineación si se solicitan.
(predeterminado: 4)
-bnúm_símbolos
Establecer el número de símbolos a cada lado de los segmentos alineados en una alineación
monitor. (predeterminado: 10)
-ww Este parámetro se utiliza para los modos de visualización especificados por -a y -r. (defecto:
100).
-o Solo muestre alineaciones que se superpongan correctamente, es decir, donde termina una secuencia
ocurre en cada extremo de la alineación
DISPLAY MODOS
-c Representación de dibujos animados de la alineación
-a -r Mostrar una alineación de la alineación local
El -a opción pone exactamente w columnas por segmento de la pantalla, mientras que -r opción
pone exactamente w símbolos de lectura en cada segmento de la pantalla. los -r el modo de visualización es
útil cuando uno quiere comparar visualmente dos alineaciones que involucran la misma lectura a. Si un
combinación de la -c, -ay -r las banderas están configuradas, luego la caricatura viene primero, luego la -a
alineación, y por último la -r alineación.
Use LAshow en línea usando los servicios de onworks.net
