Este es el comando macs2_cmbreps que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
macs2_cmbreps - Análisis basado en modelos para secuenciación de ChIP
DESCRIPCIÓN
uso: macs2 cmbreps [-h] -i IFILE [IFILE ...] [-m {pescador, máx, media}]
[--outdir OUTDIR] -o ACEITE
opcional argumentos:
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
-i ARCHIVO [ARCHIVO...]
Puntuación MACS en bedGraph para cada réplica. Requiere exactamente dos archivos como '-i A
B'. REQUERIDO
-m {pescador, máximo, medio}, --método {pescador, máximo, medio}
Método a utilizar al combinar puntuaciones de réplicas. 1) pescador: Fisher's combinado
prueba de probabilidad. Requiere puntuaciones en forma ppois (-log10 pvalues) de bdgcmp.
Otros tipos de puntajes para este método pueden causar errores inesperados de cmbreps. 2) máximo:
tomar el valor máximo de las réplicas para cada posición genómica. 3) significa: toma el
valor promedio. Tenga en cuenta que, a excepción del método de Fisher, el máximo o la media tomarán las puntuaciones TAL CUAL.
lo que significa que no convertirán las puntuaciones de una escala logarítmica a una escala lineal o viceversa.
--outdir EXTERIOR
Si se especifica, todos los archivos de salida se escribirán en ese directorio. Predeterminado: el
directorio de trabajo actual
-o ACEITE, --archivo ACEITE
Salida BEDGraph nombre de archivo para partituras combinadas.
Utilice macs2_cmbreps en línea utilizando los servicios de onworks.net
