Este es el comando maskAlignedReads que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
maskAlignedReads.py - Máscara de lecturas alineadas en el archivo de regiones
DESCRIPCIÓN
uso: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Use in.cmp.h5 para enmascarar las regiones correspondientes de archivos en in.rgn.h5, escriba la salida en un nuevo
rgn.fofn.
posicional argumentos:
enCmpFile
Un archivo cmp.h5 de entrada.
inRgnFofn
Un campo de archivos de tabla de regiones de entrada.
fueraRgnFofn
Un campo de archivos de tabla de regiones de salida.
opcional argumentos:
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
-v, --versión
mostrar el número de versión del programa y salir
-l ARCHIVO DE REGISTRO, --archivo de registro ARCHIVO DE REGISTRO
Especifique un archivo para iniciar sesión. El valor predeterminado es stderr. (predeterminado: Ninguno)
-d, --depurar
Aumenta la verbosidad del registro (predeterminado: falso)
-i, --información
Mostrar entradas de registro informativas (predeterminado: falso)
Use maskAlignedReads en línea usando los servicios de onworks.net