Este es el comando miview que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
miview - Visor de archivos de imágenes médicas
SINOPSIS
mi vista [ opciones ]
DESCRIPCIÓN
miview: visor de archivos de imágenes médicas
Los formatos de archivo se identifican automáticamente por su extensión de archivo.
Alcance opciones:
-explotar: Aumenta el tamaño de la pantalla según este factor (predeterminado = 1)
-brillante: Brillo relativo de la pantalla (predeterminado = 0.0)
-color: Utilice el mapa de colores para mostrar los valores
-contraste: Contraste relativo de la pantalla (predeterminado = 0.0)
-tugurio: Volcar todas las imágenes como archivos de mapa de bits (bmp) y salir, use el prefijo de nombre de archivo dado
-leyenda: Exportar leyenda como mapa de bits a este archivo
-bajo: Límite de ventana inferior: este valor aparecerá en negro en la pantalla
-mapa: Cargar mapa de superposición (vóxeles de colores superpuestos en la imagen) de este archivo
-leyenda del mapa: Exporta la leyenda del mapa como mapa de bits a este archivo
-mapa: Límite de ventana inferior para el mapa de superposición (predeterminado = 0.0)
-maprecto: Tamaño relativo de los rectángulos que representan vóxeles del mapa superpuesto
(predeterminado = 0.60)
-mapupp: Límite de ventana superior para el mapa de superposición (predeterminado = 0.0)
-sin escala: Desactiva la escala en la visualización 2D / 3D
-rec: Registre las coordenadas y los valores en los que se hizo clic en este archivo
-arriba: Límite de ventana superior: este valor aparecerá en blanco en la pantalla
-vale: Guarde el valor de la selección de ROI / puntos en este archivo
-v o para depurar / rastrear todos los componentes o un solo
componente, respectivamente. Los valores posibles para loglevel son: 0 (noLog), 1 (errorLog),
2 (registro de advertencia), 3 (registro de información).
fMRI opciones (Dar at menos -diseño y -fmri a activar):
-bonferr: Utilice la corrección de Bonferroni
-corr: Umbral de probabilidad de error para la correlación (predeterminado = 0.050)
-davg: Suaviza la función de diseño utilizando un filtro de media móvil de ancho N (TR)
(predeterminado = 0)
-diseño: Cargue el diseño de fMRI de este archivo (separados por comas o espacios)
-fmáscara: archivo de máscara fMRI
-fmri: Carga los datos de fMRI de este archivo
-hrf: Convolucionar la función de diseño por la función de respuesta hemodinámica antes de la correlación (ver
Glover NeuroImagen 9, 416-429)
-vecinob: Vecinos próximos mínimos con activación significativa (predeterminado = 1)
curso: Volcar el curso de tiempo de cambio de señal relativa de fMRI a este archivo
-mapa: Volcado del mapa del cambio relativo de la señal de fMRI a este archivo
-zmapa: Volcar el mapa de puntuación z en este archivo
-zpuntuación: umbral de puntuación z para la correlación (predeterminado = 0.0)
Archive read opciones:
-fecha: Fecha de escaneo [aaaammdd] (predeterminado = 20140807aaaammdd)
-fp: FOV en la dirección de fase [mm] (predeterminado = 220.0 mm)
-Fr: FOV en la dirección de lectura [mm] (predeterminado = 220.0 mm)
-fs: FOV en la dirección de corte [mm] (predeterminado = 5.0 mm)
-nº: Número de mediciones consecutivas (predeterminado = 1)
-nx: Número de puntos en la dirección de lectura (predeterminado = 1)
-Nueva York: Número de puntos en la dirección de fase (predeterminado = 1)
-Nueva Zelanda: Número de puntos en la dirección del corte (predeterminado = 1)
-parto: Fecha de nacimiento del paciente [aaaammdd] (predeterminado = 00000000aaaammdd)
-pid: Identificador único del paciente (predeterminado = Desconocido)
-pnombre: Nombre completo del paciente (predeterminado = Desconocido)
-psex: Sexo del paciente (opciones = MFO, predeterminado = O)
-peso: Peso del paciente [kg] (predeterminado = 50.0 kg)
-científico: Nombre del científico (predeterminado = Desconocido)
-Dakota del Sur: Distancia entre cortes (de centro a centro) [mm] (predeterminado = 10.0 mm)
-siervo: Descripción de la serie (predeterminado = Desconocido)
-serno: Número de serie (predeterminado = 1)
-S t: Grosor del corte [mm] (predeterminado = 5.0 mm)
-semental: Descripción del estudio (predeterminado = Desconocido)
-tcname: Nombre de la bobina de transmisión (predeterminado = Desconocido)
-tú: Tiempo de eco de la secuencia [ms] (predeterminado = 80.0 ms)
-hora: Hora de escaneo [hhmmss] (predeterminado = 090951hhmmss)
-tr: Tiempo entre excitaciones consecutivas [ms] (predeterminado = 1000.0 ms)
-cplx: Trate los datos como complejos y extraiga el componente dado (opciones = ninguno abs pha real
imag, predeterminado = ninguno)
-ds: Índice de conjunto de datos para extraer si se leen varios conjuntos de datos
-filtrar: Lea solo aquellos conjuntos de datos cuyo parámetro de protocolo 'clave' contiene la cadena
'valor' (dado en el formato 'clave = valor')
-fmapa: Para reducir el uso de memoria, siga mapeando archivos después de leer datos (sin procesar), pero escribir
en la matriz resultará en un bloqueo
-jdx: Si hay varias matrices JDX presentes, seleccione esta
-dialecto: Leer datos usando el dialecto dado del formato. (el valor predeterminado es sin dialecto)
-rf: Formato de lectura, utilícelo para anular la extensión del archivo (opciones = autodetectar 3db analizar asc
coi dat dcm doble flotador gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, predeterminado = autodetección)
-saltar: Omita esta cantidad de bytes antes de leer los datos sin procesar (predeterminado = 0)
Filtros:
-alinear : Alinea los datos con la geometría (ubicaciones de vóxeles) de
un archivo externo
-automáscara : Crea una máscara utilizando un umbral automático basado en histograma
-racimo : Crea grupos de vóxeles adyacentes / próximos vecinos distintos de cero, ordenados por tamaño
-retorcerse <núcleo de convolución (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp), diámetro del grano [mm]>: Convolución en dimensiones espaciales
-detendencia <Número de componentes de baja frecuencia que se eliminarán, media cero del resultado
timecourse>: Elimina la deriva lenta a lo largo del tiempo
-editar <Cadena de posición/rango en el formato (período de tiempo, posslice, posfase, poslectura), nuevo valor
of voxel>: editar valores de un solo voxel
-genmask : Crea una máscara que incluya todos los vóxeles con valor
en un rango dado
-isotropo : hacer que los vóxeles de la imagen sean isótropos mediante interpolación (imagen
la geometría no cambiará)
-paso bajo : Filtrado de paso bajo
-máx : Recortar todos los valores por encima del valor máximo
-máximo : Realiza proyección de máxima intensidad
sobre la dirección dada
-unir : Fusionar conjuntos de datos en un único conjunto de datos expandiendo la dimensión de tiempo
- mín. : Recortar todos los valores por debajo del valor mínimo
-minip : Realizar proyección de intensidad mínima
sobre la dirección dada
-noNaN : Reemplaza cada NaN por el valor dado
-pflip : Voltear datos en dirección de fase
-broma : Seleccione el rango en
dirección de fase
-proyecto : Realiza la proyección media sobre la dada
dirección
-cuantilmask : Crea una máscara que incluya todos los vóxeles por encima de la fracción dada
umbral
-Ejemplo : Cambio de tamaño temporal de los datos de la imagen
-cambiar el tamaño : Cambio de tamaño espacial de los datos de la imagen
-rebanar : vuelve la imagen a un determinado
La orientación
-rflip : Voltear datos en la dirección de lectura
-putrefacción : Rotación en el plano
-organizar : Seleccione el rango en
leer dirección
-escala : Cambiar la escala de los valores de la imagen
-deslizarse : Voltear datos en la dirección del corte
-cambio <leerCambio de dirección [píxel],faseCambio de dirección [píxel],sliceCambio de dirección
[píxel]>: desplaza datos espacialmente
-tiempo de corte : Correcto para
diferentes puntos de tiempo de adquisición de cortes
-empalme : empalma el
imagen en la dirección dada
-rango : Seleccione el rango en
dirección de corte
-intercambiar <[rps] [-], [rps] [-], [rps] [-]>: intercambia / refleja dimensiones especificando una dirección
triple con signo de reflexión opcional adjunto
-loseta : Combina cortes en una imagen 2D cuadrada
-extraño : Seleccione el rango en
dirección del tiempo
-turno : Cambiar datos en el tiempo
-tipomax : Recorta todos los valores por encima del máximo de un tipo de datos específico
-escribiendo : Recorta todos los valores por debajo del mínimo de un tipo de datos específico
-usar mascarilla : Crea un conjunto de datos 1D que incluye todos los valores dentro de la máscara del archivo
Soportado presentar extensiones (formatos):
3db (datos binarios Iris3D)
analizar
(NIFTI / ANALYZE, dialectos: fsl)
asc (ASCII, dialectos: tcourse)
coi (conjuntos de datos JCAMP-DX)
dat (matriz de datos 2D ascii de Matlab)
dcm (DICOM, dialectos: siemens)
double (datos brutos dobles)
float (datos brutos flotantes)
gz (contenedor GNU-Zip para otros formatos)
hdr (Interfile, dialectos: neurostat)
hdr (NIFTI / ANALYZE, dialectos: fsl)
idx (índices 3D de valores distintos de cero en ASCII)
ima (DICOM, dialectos: siemens)
interarchivo
(Interfile, dialectos: neurostat)
jdx (formato de imagen JCAMP-DX)
mag (DICOM, dialectos: siemens)
mhd (MetaImagen)
nii (NIFTI / ANALYZE, dialectos: fsl)
ph (DICOM, dialectos: siemens)
png (Gráficos de red portátiles)
pos (posiciones xy de distintos de cero en ASCII)
pro (protocolos de medición ODIN)
registro (Ansoft HFSS ASCII)
s16bit (datos sin procesar de 16 bits firmados)
s32bit (datos sin procesar de 32 bits firmados)
s8bit (datos sin procesar de 8 bits firmados)
smp (conjuntos de datos JCAMP-DX)
u16bit (datos brutos de 16 bits sin firmar)
u32bit (datos brutos de 32 bits sin firmar)
u8bit (datos brutos de 8 bits sin firmar)
Utilice miview en línea utilizando los servicios de onworks.net
