Este es el árbol de presentación de comandos que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
showtree: vea y / o convierta árboles filogenéticos en la terminal.
SINOPSIS
árbol de exposición [OPCIONES] [archivo de árbol]
DESCRIPCIÓN
Ver y / o convertir árboles filogenéticos en la terminal.
archivo de árbol es el nombre de archivo del archivo que contiene árboles en formato PRIME.
OPCIONES
--ayuda Mostrar ayuda (este texto).
-V, --versión
Imprimir versión y salir
-e, --mostrar-edgetimes
Mostrar tiempos de ventaja
-n, -show-nodetimes
Mostrar tiempos de nodo
-b, - mostrar pesos de borde
Mostrar los pesos de los bordes (es decir, la longitud de las ramas)
-x, --show-tot-edgetime
Muestra el tiempo total de borde en lugar del árbol
-y, - show-tot-edgeweight
Mostrar el peso total del borde en lugar del árbol
-c, --leer-veces-borde-después-de-dos puntos
Leer tiempos de borde después de dos puntos
-p, --convertir-y-generar-árbol-en-formato-prime
Convertir y generar el árbol en formato PRIME
-i, --mostrar-id
Mostrar ID (solo válido junto con -p)
-S, --leer-árbol-desde-stdin
Leer árbol de STDIN (no ni necesario)
-f, --formato dibujo asciid | prime | newick | simplenewick
El formato de salida. El valor predeterminado es asciidrawing. Formatos de salida:
newick - convertir y generar el árbol en formato NEWICK
simplenewick: formato newick simple, sin longitudes de rama. Esto también permite leer
de árboles desequilibrados.
prime - formato prime
asciidrawing - un dibujo ascii
-t, --número de árbol
Usa el árbol con este número. Si no se establece, se imprimirán todos los árboles.
-t, --número de árbol
Usa el árbol con este número. Si no se establece, se imprimirán todos los árboles.
SALIR ESTADO
0 Ejecución exitosa del programa.
1 Ocurrió algún error
URL
La página de inicio de prime-phylo: http://prime.sbc.su.se
Use showtree en línea usando los servicios de onworks.net
