Este es el comando stretch que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
camilla - Needleman-Wunsch alineación global rápida de dos secuencias
SINOPSIS
camilla -una secuencia secuencia -bsecuencia secuencia [-archivo de datos matriz] [-brecha entero]
[-gape extender entero] -archivo de salida alinear
camilla -ayuda
DESCRIPCIÓN
camilla es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del grupo (s) de comando "Alineación: Global".
OPCIONES
Entrada .
-una secuencia secuencia
-bsecuencia secuencia
-archivo de datos matriz
Este es el archivo de matriz de puntuación que se utiliza al comparar secuencias. Por defecto es el
archivo 'EBLOSUM62' (para proteínas) o el archivo 'EDNAFULL' (para secuencias nucleicas). Estas
Los archivos se encuentran en el directorio "datos" de la instalación de EMBOSS.
Beneficios adicionales .
-brecha entero
Valor predeterminado: @ ($ (acdprotein)? 12: 16)
-gape extender entero
Valor predeterminado: @ ($ (acdprotein)? 2: 4)
Salida .
-archivo de salida alinear
Use Stretchere en línea usando los servicios de onworks.net
