Este es el comando vcf-merge que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
vcf-merge: fusiona los archivos VCF indexados con tabix y bgzip
SINOPSIS
fusionar-vcf [OPCIONES] archivo1.vcf archivo2.vcf.gz ... > fuera.vcf
DESCRIPCIÓN
Acerca de: Combina los archivos VCF indexados en bgzip y tabix. (Por ejemplo, bgzip file.vcf; tabix -p vcf
archivo.vcf.gz)
OPCIONES
-c, - cromosomas
Igual que -r, a la izquierda por compatibilidad con versiones anteriores. Por favor, no lo use como será
cayó en el futuro.
-d, --eliminar duplicados
Si debe haber dos filas consecutivas con el mismo chr: pos, imprima solo la primera
.
-H, --vcf-encabezado
Usa el encabezado VCF
-h, - ?, --ayuda
Este mensaje de ayuda.
-r, --regiones
Haga solo las regiones dadas (lista separada por comas o una región por línea en un archivo).
-s, --silencio
Trate de ser un poco más silencioso, sin advertencias sobre líneas duplicadas.
Use vcf-merge en línea usando los servicios de onworks.net
