Esta es la aplicación de Linux llamada ADOMA cuya última versión se puede descargar como adoma-1.0.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ADOMA con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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ADOMA
DESCRIPCIÓN
ADOMA significa: Visualización alternativa de alineación múltiple. ADOMA puede crear cuatro visualizaciones diferentes de una alineación de secuencia múltiple: una alineación ClustalW en formato HTML, una alineación ClustalW simplificada en formato HTML y / o txt y una alineación ClustalW coloreada en formato HTML. Para ver ejemplos de estos archivos de salida, consulte las capturas de pantalla. ADOMA utiliza ClustalW para crear la alineación múltiple a partir de secuencias de ADN o proteínas y las muestra de forma ligeramente diferente a la salida normal de ClustalW. ADOMA es un programa de línea de comandos que se puede utilizar fácilmente en canalizaciones.
Para obtener más información, consulte el archivo README.md en la sección Archivos.
Cómo citar ADOMA:
Zaal, D. y Nota, B. (2016), ADOMA: una herramienta de línea de comandos para modificar la salida de alineación múltiple de ClustalW. Mol. Inf., 35: 42–44. doi: 10.1002 / minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Shell de Unix, Pitón
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/adoma/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
