Esta es la aplicación de Linux llamada ArtificialFastqGenerator cuya última versión se puede descargar como ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ArtificialFastqGenerator con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
GeneradorFastq Artificial
Ad
DESCRIPCIÓN
ArtificialFastqGenerator toma el genoma de referencia (en formato FASTA) como entrada y genera archivos FASTQ artificiales en formato Sanger. Puede aceptar puntajes de calidad base Phred de archivos FASTQ existentes y usarlos para simular errores de secuenciación. Dado que los FASTQ artificiales se derivan del genoma de referencia, el genoma de referencia proporciona un estándar de oro para las variantes de llamada (polimorfismos de nucleótido único (SNP) e inserciones y deleciones (indeles)). Esto permite la evaluación de una tubería de análisis de secuenciación de próxima generación (NGS) que alinea las lecturas con el genoma de referencia y luego llama a las variantes.Público
Industria de la salud, ciencia / investigación, usuarios finales avanzados
Lenguaje de programación
Java
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.