Esta es la aplicación de Linux llamada Autoprime cuya última versión se puede descargar como autoprime.2.1.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Autoprime con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Cebado automático
DESCRIPCIÓN
AutoPrime permite diseñar rápidamente cebadores para la medición por PCR en tiempo real de la expresión eucariota.
Al conectarse a la base de datos EnsEMBL, la información de la estructura genética se utiliza para encontrar cebadores que atraviesan los bordes del exón. De esta forma solo se capturan las secuencias expresadas. Además, se puede evitar la imprimación incorrecta en regiones repetitivas utilizando información de RepBase.
Caracteristicas
- Diseño de imprimación automatizado
- Control de calidad a través de configuraciones detalladas
- Utilizando fuentes conocidas: Primer3, EnsEMBL, RepBase
- Creando sus imprimaciones desde 2003
- Sitio web funcionando como servicio
- Código Perl disponible para ejecución local
Público
Ciencia / Investigación, Usuarios finales avanzados
Interfaz de usuario
Línea de comandos basada en web
Lenguaje de programación
Perl
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/autoprime/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.