Esta es la aplicación de Linux llamada ChIP-RNA-seqPRO para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como cloudclientID.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ChIP-RNA-seqPRO para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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ChIP-RNA-seqPRO para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
ChIP-RNA-seqPRO: una estrategia para identificar regiones de desregulación epigenética asociadas con sitios de edición de ARN y empalme de transcripciones aberrantes. Scripts de Python ejecutables empaquetados junto con bibliotecas de anotaciones personalizadas, entrada de datos de demostración y guía README.9/26: v1.1 Se actualizó MAIN_IV para depurar el error generado por los pandas de Python que ya no admiten 'subconjunto'.
Este código ya no se mantendrá / actualizará activamente aquí. Ahora se encuentra disponible un recurso basado en la nube para el análisis comparativo de conjuntos de datos epigenéticos, de variación de secuencia y de expresión. Visite Cloudomics, proyecto para recursos basados en la nube: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Caracteristicas
- Herramienta para el análisis comparativo de una amplia variedad de conjuntos de datos de muestras emparejadas de secuenciación epigenómica (ChIPseq, MBDseq, etc.) y basada en ARN
- Si utiliza esta herramienta o cualquiera de las bibliotecas de anotaciones, incluya la siguiente referencia: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. y H. Ho T. (2015). Estrategias bioinformáticas para identificar regiones de desregulación epigenética asociadas con el empalme de transcripciones aberrantes y la edición de ARN. En Actas de la Conferencia Internacional sobre Modelos, Métodos y Algoritmos de Bioinformática, páginas 163-170. DOI: 10.5220 / 0005248001630170
Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
Shell de Unix, Pitón
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
