Esta es la aplicación de Linux llamada COPEread cuya última versión se puede descargar como cope-v1.2.5.tgz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada COPEread con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
COPEleer
Ad
DESCRIPCIÓN
COPE (Conectar lecturas de pares superpuestos) es un método para alinear y conectar las lecturas de pares de extremos secuenciadas de illumina cuyo tamaño de inserción es menor que la suma de las dos longitudes de lectura. Las lecturas conectadas se pueden utilizar en el ensamblaje del genoma, resecuenciación e investigación de transcriptomas.
La cita completa:
COPE: una herramienta precisa de conexión de lecturas de extremo de par basada en k-mer para facilitar el ensamblaje del genoma
Binghang Liu; Jianying Yuan; Siu-Ming Yiu; Zhenyu Li; Yinlong Xie; Yan Xiang Chen; Yujian Shi; Hao Zhang; Yingrui Li; Tak-Wah Lam; Ruibang Luo
Bioinformática (2012) 28 (22): 2870-2874; doi: 10.1093 / bioinformática / bts563
Caracteristicas
- conectar lectura de pares superpuestos
Lenguaje de programación
C + +
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/coperead/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
