Esta es la aplicación de Linux llamada DeNovoCheck cuya última versión se puede descargar como DeNovoCheck_270113.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada DeNovoCheck con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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DeNovoCheck
DESCRIPCIÓN
DeNovoCheck está destinado a ser utilizado para el análisis de herencia en datos tio NGS. Para las enfermedades mendelianas dominantes raras, a menudo se utilizan tríos de padres y pacientes para reducir el número de variantes candidatas. El algoritmo basa la predicción de la herencia en los datos disponibles en los archivos BAM parentales y permite una selección rápida y confiable de posibles variantes de novo.
Caracteristicas
- Identificar variantes de novo en los datos del trío de NGS
- Parámetros de línea de comando
- Configuración del archivo de propiedades
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Java
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/denovocheck/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
