Esta es la aplicación de Linux llamada Coincidencia de patrones generalizados cuya última versión se puede descargar como longpattern.exe. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Coincidencia de patrones generalizados con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Coincidencia de patrones generalizados
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DESCRIPCIÓN
Esta herramienta está diseñada para resolver el problema generalizado de coincidencia de patrones, mediante el cual solo encontramos un conjunto de subpatrones, ignorando los espacios entre los subpatrones. Esta herramienta es extremadamente rápida y también tiene buena tolerancia a errores.
Caracteristicas
- coincidencia de patrones en el genoma humano en menos de un minuto
- índice de k-mers basado en disco duro
- siembra dual complementaria
- podado DP en extender
- longitud de semilla corta k tiene buena tolerancia a errores
- Se pueden manejar brechas tanto positivas como negativas.
Público
Usuarios finales avanzados
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
C
Entorno de base de datos
Otra API
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/gpatternmatch/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.