Esta es la aplicación de Linux llamada GenOO-HTS para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada GenOO-HTS para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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GenOO-HTS para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
GenOO-HTS [jee-noo] es un código abierto; Marco de Perl orientado a objetos desarrollado específicamente para el diseño de herramientas de análisis de secuenciación de alto rendimiento (HTS). El objetivo principal de GenOO-HTS es hacer que los análisis HTS simples sean fáciles y los análisis complicados sean posibles. GenOO-HTS modela entidades biológicas en objetos Perl y proporciona atributos y métodos relevantes que permiten la manipulación de datos de secuenciación de alto rendimiento. El uso de GenOO-HTS como módulo de desarrollo central reduce la sobrecarga y la complejidad de administrar los datos y las entidades biológicas disponibles. GenOO-HTS ha sido diseñado para ser flexible, fácilmente ampliable con una estructura modular y requisitos mínimos para herramientas y bibliotecas externas.Caracteristicas
- Organizar entidades biológicas como objetos perl (regiones genómicas, genes, transcripciones, intrones / exones, etc.)
- Organizar entidades de secuenciación como objetos / atributos de Perl (lecturas de secuenciación, alineaciones, etc.)
- Facilite la E / S de formatos de archivo ampliamente utilizados (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Sea consistente y fácilmente ampliable
Audiencia
Ciencia / Investigación, Desarrolladores
Lenguaje de programación
Perl
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/genoo/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
