Esta es la aplicación de Linux llamada GEPETTO - Priorización de genes en Java cuya última versión se puede descargar como README.txt. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada GEPETTO - Priorización de genes en Java con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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GEPETTO - Priorización de genes en Java
DESCRIPCIÓN
GEPETTO (GEne PrioriTization ExTended TOol) es un marco original de código abierto, distribuido bajo la licencia LGPL, para la selección de genes y la priorización en una computadora de escritorio que garantiza la confidencialidad de los datos personales. Aprovecha las capacidades de integración de datos en SM2PH-Central Framework (KD4v, MSV3d, BIRD, ..), combinado con métodos de priorización de genes desarrollados internamente. Actualmente incorpora seis módulos de priorización, basados en secuencia de genes, interacciones proteína-proteína, expresión génica, probabilidades de causar enfermedades, contexto genómico).
GEPETTO está escrito en Java / Python y es compatible con una arquitectura modular avanzada, lo que significa que el usuario puede modificarlo y ampliarlo fácilmente para incluir métodos de puntuación alternativos y nuevas fuentes de datos. Tenemos la intención de extender el sistema desde el nivel de gen hasta la priorización a nivel de variante, aprovechando los datos de las variantes en la base de datos MSV3D.
Contacto: [email protected] or [email protected]
Audiencia
Ciencia / Investigación, Educación, Desarrolladores
Interfaz de usuario
Basado en web, consola / terminal, línea de comandos
Lenguaje de programación
Python, Java, S / R
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/gepetto/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
