Esta es la aplicación de Linux llamada GIIRA cuya última versión se puede descargar como GIIRA_01_3.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada GIIRA con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
GIRA
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DESCRIPCIÓN
GIIRA es un método de predicción de genes que identifica regiones codificantes potenciales basándose exclusivamente en el mapeo de lecturas de un experimento de RNA-Seq.Fue diseñado principalmente para la predicción de genes procarióticos y es capaz de resolver genes dentro de la región expresada de un operón. Sin embargo, también es aplicable a eucariotas y predice estructuras de intrones de exón, así como isoformas alternativas.
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/giira/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.