Esta es la aplicación de Linux llamada MDcons (consenso de Molecular Dynamics) para ejecutar en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como mdcons-src-2.0.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MDcons (consenso de dinámica molecular) para ejecutarla en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
Ad
MDcons (consenso de dinámica molecular) para ejecutarse en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
MDcons es una herramienta para analizar los contactos conservados durante las simulaciones de dinámica molecular (MD) de complejos basados en proteínas, ARN, ADN y ligandos. La entrada es una trayectoria de dinámica molecular o un conjunto de instantáneas. La entrada también puede ser una sola instantánea. Las salidas son (1) mapa de los contactos conservados con mayor o menor frecuencia durante la MD (2) una lista de los contactos conservados con mayor o menor frecuencia durante la MD.Caracteristicas
- MDcons se ejecuta en más de 2000 instantáneas MD en menos de 2 minutos
- MDcons maneja complejos de proteínas, ARN y ADN
- MDcons maneja trayectorias / instantáneas con o sin identificador de cadena
- MDcons es compatible con GROMACS
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Consola / Terminal, línea de comandos
Lenguaje de programación
Fortran, pitón
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/mdcons/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.