Esta es la aplicación de Linux llamada MetaPhat -meta-pheno-association-tracker cuya última versión se puede descargar como meta_phat.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MetaPhat -meta-pheno-association-tracker con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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MetaPhat -meta-feno-asociación-rastreador
DESCRIPCIÓN
MetaPhat es una herramienta activa y de código abierto (licencia MIT) para detectar variantes con asociaciones multivariadas mediante el uso de estadísticas resumidas de estudios univariados de GWAS. La aplicación también realiza la descomposición al encontrar subconjuntos BIC óptimos y rasgos impulsores de valor P para las variantes de prospectos multivariantes. Los resultados de las variantes se rastrean y agrupan para ayudar con la disección de las relaciones fenotipos-genotipo.Consulte nuestra página de inicio de wiki para obtener instrucciones de instalación, formatos de datos GWAS requeridos y entradas de ejemplo con el comando de prueba: https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Ejemplo de alquitrán de fuente / datos de lípidos globales (GLGC, Willer 2013) - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Si tiene problemas o tiene solicitudes de funciones después de probar el ejemplo y leer el tutorial, envíe un correo electrónico a: [email protected]
Copyright <2019> [email protected], [email protected]
Caracteristicas
- análisis multivariado de rasgos de todo el genoma
- Selección de subconjunto de rasgos óptimos basada en el valor p y el BIC
- trazos de trazas de descomposición de rasgos
- archivo de resumen de características del conductor y SNP principal
- grupo de lanceros de rango de rasgo snp-snp
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
