Esta es la aplicación de Linux llamada MoPAC cuya última versión se puede descargar como MoPAC_0.3.1.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MoPAC con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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MoPAC
DESCRIPCIÓN
Para facilitar la comparación de la esencialidad de genes en dos o más muestras de células, proponemos MoPAC (Modular Pipeline for Analysis of CRISPR screens), una herramienta interactiva impulsada por Shiny para el análisis de esencialidad diferencial en pantallas CRISPR/Cas9.
Para obtener instrucciones de instalación y uso, consulte la página wiki.
Caracteristicas
- Medición imparcial de la esencialidad genética diferencial en pantallas CRISPR.
- Facilidad de uso a través de una interfaz gráfica de usuario interactiva.
- Cifras listas para publicación generadas en cada paso del análisis.
- Tanto los archivos FASTQ como las tablas de recuento de lecturas (antes o después de la normalización) se permiten como entrada.
- Control de calidad basado en categorías genéticas para la detección y el filtrado de valores atípicos.
- Análisis de ontología de genes integrado a través del paquete STRINGdb R.
- Procesamiento rápido a través de la compilación C++ de pasos intensivos en cálculo.
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Basado en la Web
Lenguaje de programación
C ++, S / R
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/mopac/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
