Esta es la aplicación de Linux llamada MPICorMat cuya última versión se puede descargar como MPICorMat_v3.0.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MPICorMat con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
MPICorMat
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DESCRIPCIÓN
MPICorMat es una herramienta paralela para construir matrices de similitud de correlación como parte del procedimiento para generar redes de coexpresión de genes. Esta herramienta toma como entrada una matriz con los valores de expresión (un valor flotante) para diferentes genes observados de varias muestras. Es una paralelización del primer módulo de la herramienta RMTGenNet (https://github.com/spficklin/RMTGeneNet). Los usuarios de RMTGeneNet pueden intercambiar este módulo CCM por MPICorMat, beneficiarse de su rápido cálculo para generar la similitud
matriz, y luego use la matriz de similitud como entrada para el segundo módulo (RMM) para
construir la red de coexpresión génica final.
Público
Tecnología de la información, Industria de la salud, Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Consola / Terminal, línea de comandos
Lenguaje de programación
C + +
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/mpicormat/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.