Esta es la aplicación de Linux llamada Subread para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como subread-2.0.1-source.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Subread para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Subread para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
El paquete de software Subread es un juego de herramientas para procesar datos de secuenciación de próxima generación. Incluye alineador Subread, detector de unión exón-exón Subjunc y programa de resumen de lectura featureCounts.El alineador de subpanes se puede utilizar para alinear las lecturas de gDNA-seq y RNA-seq. El alineador subjunc fue diseñado para la detección de la unión exón-exón. Para el mapeo de las lecturas de RNA-seq, Subread realiza alineaciones locales y Subjunc realiza alineaciones globales. Subread y Subjunc se publicaron en el siguiente artículo: Yang Liao, Gordon K Smyth y Wei Shi. "El alineador de Subread: mapeo de lectura rápido, preciso y escalable por semilla y voto", Nucleic Acids Research, 2013, 41 (10): e108
Caracteristicas
- leer alineador
- secuenciación de próxima generación
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
C
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/subread/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
