Esta es la aplicación de Linux llamada TagGraph cuya última versión se puede descargar como WindowsDockerTG.1.8.1.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada TagGraph con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Gráfico de etiquetas
DESCRIPCIÓN
Aunque la espectrometría de masas es adecuada para identificar miles de posibles modificaciones postraduccionales de proteínas (PTM), históricamente se ha sesgado hacia unas pocas. Para medir el conjunto completo de PTM en diversos proteomas, el software debe superar los desafíos duales de cubrir enormes espacios de búsqueda y distinguir entre interpretaciones de espectro correctas e incorrectas. Aquí, describimos TagGraph, una herramienta computacional que supera ambos desafíos con un método de búsqueda sin restricciones basado en cadenas que es hasta 350 veces más rápido que los enfoques existentes, y un modelo de validación probabilística que optimizamos para las asignaciones de PTM. Aplicamos TagGraph a un conjunto de datos proteómicos humanos publicados de 25 millones de espectros de masas y triplicamos las identificaciones de espectro confiables en comparación con su análisis original. Identificamos miles de tipos de modificación en casi 1 millón de sitios del proteoma.Caracteristicas
- Definición de proteomas complejos con cuerda
Público
Educación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Python
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/taggraph/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
