Esta es la aplicación de Windows llamada COGsoft para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como COGsoft.04.19.2012.tgz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada COGsoft para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
COGsoft para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
Software para hacer Clusters of Ortologous Groups (con el nuevo algoritmo EdgeSearch). Última referencia: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Bioinformatics 2010.Caracteristicas
- Una descripción de las fortalezas / debilidades de los diferentes métodos: Kristensen DM, Wolf YI, Mushegian AR, Koonin EV. Métodos computacionales para la inferencia de la ortología genética. Breve Bioinformación. Septiembre de 2011; 12 (5): 379-91. Epub 2011 19 de junio. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21690100
- Referencia de algoritmo: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Un algoritmo de polinomio bajo para ensamblar agrupaciones de grupos ortólogos a partir de mejores coincidencias simétricas intergenómicas. Bioinformática. 2010 de junio de 15; 26 (12): 1481-7. Epub 2010 2 de mayo. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btq229?ijkey=zD7TIWnncGvDGYE&keytype=ref
- Revisión buena / completa de ortólogos / COG: Koonin EV. Ortólogos, parálogos y genómica evolutiva. Annu Rev Genet. 2005; 39: 309-38. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16285863
- Papel original de la COG: Tatusov RL, Koonin EV, Lipman DJ. Una perspectiva genómica de las familias de proteínas. Ciencias. 1997 de octubre de 24; 278 (5338): 631-7. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9381173
- Base de datos COG: Tatusov RL, Galperin MY, Natale DA, Koonin EV. La base de datos del COG: una herramienta para el análisis a escala del genoma de las funciones y la evolución de las proteínas. Ácidos nucleicos Res. 2000 1 de enero; 28 (1): 33-6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10592175
- Sitio de la página web del laboratorio de Koonin: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/groups/koonin/
- Sitio FTP oficial: ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/COGsoft/ (aunque por el momento, el archivo Léame solo apunta a la página de sourceforge)
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
C + +
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/cogtriangles/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
