Esta es la aplicación de Windows llamada Covidex cuya última versión se puede descargar como Covidex_2021_11_27.rar. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Covidex con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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covidex
DESCRIPCIÓN
Los subtipos o clados virales representan agrupaciones entre aislamientos de la población global de una especie definida. La subtipificación es relevante para estudios sobre epidemiología, evolución y patogenia de virus. En este sentido, Covidex se desarrolló como una herramienta de subtipificación de aprendizaje automático sin alineación de código abierto. Es una aplicación brillante que permite una clasificación rápida y precisa de genomas virales en grupos predefinidos. Si se cargan más de 1000 secuencias, la herramienta se ejecutará en modo multiproceso. Capaz de clasificar 16000 secuencias del genoma en menos de un minuto (procesador AMD Ryzen 7 1700 de 8 núcleos a 3 GHz)
Para obtener una versión web de la aplicación (solo para conjuntos de datos pequeños: 100 segundos como máximo), vaya a
http://covidex.unlu.edu.ar
Si usa Covidex, considere citar la siguiente preimpresión:
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.08.21.261347v1
Si crees que mi trabajo es útil, ¡puedes invitarme a un café! https://www.buymeacoffee.com/mcacciabue
Caracteristicas
- Subtipado de secuencias
- Interfaz de usuario amigable
- Gráficos de resumen
- Versión portátil para Windows (no necesita instalación)
- Modo multiproceso
Público
Ciencia / Investigación, Usuarios finales / Escritorio
Lenguaje de programación
R
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/covidex/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
