Esta es la aplicación de Windows llamada UniPyRange cuya última versión se puede descargar como UniPyRangeSuite.py. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada UniPyRange con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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UniPyRango
DESCRIPCIÓN
Secuencia de comandos de Python muy simple que le ahorra las molestias de contar los aminoácidos / bases de ADN en archivos fasta de la base de datos Uniprot y NCBI RefSeq (1, 2).
Supongamos que desea la secuencia de aminoácidos en el rango 128-387 de una proteína de 1000 aminoácidos; este script lo ayudará a evitar errores de conteo con solo mostrarle la secuencia especificada en aminoácidos y codificar pares de bases de ADN (ideal para el diseño de cebadores de amplificación ) de un ID de Uniprot especificado.
- Requiere BioPython (3) y Paquete de Bioservicios (4)
(1)
El Consorcio UniProt
UniProt: un centro de información sobre proteínas
Ácidos nucleicos Res. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: una actualización sobre las secuencias de referencia de mamíferos. Ácidos nucleicos Res. 2014 1 de enero; 42 (1): D756-63.
(3)
Cock PJ y col. Bioinformática (2009)
(4)
Cokelaer et al, Bioinformática (2013)
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
