این دستور biomaj است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
biomaj - دانلود و تبدیل بانک های داده های بیولوژیکی راه دور
خلاصه
biomaj [-h]
شرح
BioMAJ (BIOlogie Mise A Jour) یک موتور گردش کار اختصاصی است
به همگام سازی و پردازش داده ها. نرم افزار خودکار می شود
چرخه به روز رسانی و نظارت بر انعکاس محلی
مخزن بانک اطلاعات کاربر برای اجرای biomaj باید حقوق ریشه داشته باشد.
OPTIONS
-h لیستی از دستورات را نمایش می دهد.
نصب
هنگام نصب، BioMAJ برای اجرا به یک پایگاه داده (MySQL) نیاز دارد، ابتدا نصب کننده باید ایجاد کند
یک پایگاه داده (biomaj_log) و یک کاربر پایگاه داده (همان مورد استفاده در نصب نصب).
پیکربندی پایگاه داده برای biomaj را می توان در آن تنظیم یا تغییر داد
/etc/biomaj/db_properties/global.properties.
در صورت عدم موفقیت نصب به دلیل خطای SQL، اسکریپت نصب باید به صورت دستی اجرا شود
ایجاد/ارتقا پایگاه داده:
پرل /usr/share/biomaj/sql/migration/update.pl
اسکریپت پایگاه داده را ایجاد/ ارتقاء می دهد و فایل های پیکربندی را به روز می کند.
مدیر USER
یک کاربر پیش فرض مدیر (admin) توسط اسکریپت ها ایجاد می شود. در صورت استفاده از biomaj-wacher،
رمز عبور پیش فرض (admin) باید فوراً از طریق واسط تماشاگر تغییر کند.
اگر فقط از هسته biomaj استفاده شود، رمز عبور بی فایده است.
.PP
UPGRADE
در مورد ارتقاء بسته، اگر به درستی پیکربندی شود، اسکریپت های مهاجرت خواهند بود
در هنگام نصب به طور خودکار اجرا شد.
امکان اجرای دستی اسکریپت وجود دارد:
.B به perl /usr/share/biomaj/sql/migration/update.pl -h مراجعه کنید.
برای استفاده
داده ها بانک ها
به طور پیش فرض، biomaj پیکربندی شده است (data.dir در global.properties) برای نوشتن بانک ها در
/var/lib/biomaj.
مثال ها
یک بانک را به روز کنید:
biomaj --بروزرسانی genbank
نمایش کنسول
biomaj --به روز رسانی genbank --console
نمایش وضعیت:
biomaj --وضعیت
خروج وضعیت
بایوماج در صورت موفقیت، وضعیت موجود صفر را برمی‌گرداند، به‌روزرسانی بانک را نشان نمی‌دهد
وضعیت.
با استفاده از خدمات onworks.net از biomaj آنلاین استفاده کنید
