این دستور bp_oligo_countp است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
bp_oligo_count - تعداد و فراوانی oligo
خلاصه
استفاده: bp_oligo_count [-h/--help] [-l/--length OLIGOLENGTH]
[-f/--قالب SEQFORMAT] [-i/--in/-s/--sequence SEQFILE]
[-o/--out OUTFILE]
شرح
این اسکریپت وقوع و فرکانس را برای همه اولیگونوکلئوتیدهای با طول معین شمارش می کند.
می توان از آن برای تعیین پرایمرهای مفید برای پرایمینگ مکرر اسید نوکلئیک استفاده کرد
برای برچسب زدن تصادفی
توجه داشته باشید که این اسکریپت را می توان با استفاده از برنامه compseq که بخشی از آن است اجرا کرد
EMBOSS.
OPTIONS
فرمت توالی پیش فرض fasta است. اگر هیچ فایلی داده نشود، نتایج چاپ خواهد شد
به استاندارد. همه گزینه های دیگر را می توان به صورت تعاملی وارد کرد.
بازخورد
پستی لیست
بازخورد کاربر بخشی جدایی ناپذیر از تکامل این ماژول و سایر ماژول های Bioperl است. ارسال
نظرات و پیشنهادات شما ترجیحا به لیست پستی Bioperl. مشارکت شما
بسیار قابل تقدیر است.
[ایمیل محافظت شده] - بحث عمومی
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - در مورد لیست های پستی
گزارش اشکالات
اشکالات را به سیستم ردیابی اشکال Bioperl گزارش دهید تا به ما در پیگیری اشکالات و آنها کمک کند
وضوح. گزارش اشکال را می توان از طریق وب ارسال کرد:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
نویسنده - چارلز C. کیم
پست الکترونیک (ایمیل) [ایمیل محافظت شده]
تاریخچه
نوشته شده در 2 ژوئیه 2001
ارسال شده به پروژه اسکریپت bioperl 2001/08/06
>> بهینه سازی سرعت 100 برابر توسط Heikki Lehvaslaiho
از bp_oligo_countp به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
