این دستور correct_abundances است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
correct_abundances - مرحله تصحیح شباهت فراوانی ژنوم را اجرا کنید
خلاصه
صحیح_ فراوانی نامها
شرح
مرحله تصحیح شباهت را اجرا کنید.
نکته: اگرچه امکان اجرای نقشه‌های خوانده شده با دست یا ایجاد شباهت وجود دارد
ماتریس به صورت دستی، ما قویاً توصیه می کنیم از اسکریپت های Python ارائه شده 'run_mappers.py' استفاده کنید
و 'create_similarity_matrix.py'.
OPTIONS
نامها: نام فایل نام فایل; فایل اسامی متنی ساده باید دارای یک نام در هر باشد
خط نام به عنوان شناسه در کل الگوریتم استفاده می شود.
-h, --کمک
این پیام راهنما را نشان داده و خارج شوید
-m SMAT، ماتریس شباهت=SMAT
فایل ماتریس مسیر تشابه. ماتریس تشابه باید با همان ایجاد شود
فایل NAMES. [پیش‌فرض: ./similarity_matrix.npy]
-s SAM ، --samfiles=SAM
الگوی اشاره به فایل های SAM ایجاد شده توسط نقشه بردار. جای جای نام
"%s" است. [پیش‌فرض: ./SAM/%s.sam]
-b چکمه، --bootstrap-samples=BOOT
تعداد نمونه های بوت استرپ را تنظیم کنید. از 1 برای غیرفعال کردن راه‌اندازی استفاده کنید [پیش‌فرض: 100]
-o بیرون ، -- خروجی=OUT
فایل خروجی متن ساده حاوی نتایج. [پیش‌فرض: ./results.txt]
با استفاده از خدمات onworks.net از correct_abundances آنلاین استفاده کنید
