این دستور EDTSurf است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
EDTSurf - ساخت سریع و دقیق سطوح ماکرومولکولی
خلاصه
EDTSurf -i pdbname ...
شرح
EDTSurf یک برنامه منبع باز برای ساخت سطوح مثلثی برای ماکرومولکول ها است. آی تی
سه سطح ماکرومولکولی اصلی ایجاد می کند: سطح واندروالس، قابل دسترسی با حلال
سطح و سطح مولکولی (سطح بدون حلال). EDTsurf همچنین حفره ها را شناسایی می کند
که داخل ماکرومولکول ها هستند.
OPTIONS
-o نام بردن
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-خالص 2-اتمی 3-زنجیره
-p شعاع پروب [0,2.0]
-f ضریب مقیاس (0,20.0]
-h 1-in و out 2-out 3-in
output1: outname.ply
output2: outname.asa
output3: outname-cav.pdb
با استفاده از خدمات onworks.net از EDTSurf آنلاین استفاده کنید
