این دستور fastaq-to_perfect_reads است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
fastaq_to_perfect_reads - خواندنهای جفتی کامل را از مرجع انجام دهید
شرح
استفاده: fastaq_to_perfect_reads [گزینه ها]
انحراف>
با اندازههای درج نمونهبرداری شده از فایلهای دنبالهای، خواندنهای سریع جفت شده کامل را انجام میدهد
توزیع نرمال جهت خواندن ایننی است. خروجی یک فایل FASTQ به هم پیوسته است.
موقعیتی استدلال ها:
infile نام فایل ورودی
مجموعه
نام فایل خروجی
اندازه درج متوسط
میانگین اندازه درج جفت های خوانده شده
درج انحراف std
انحراف استاندارد اندازه درج
پوشش متوسط
میانگین پوشش مطالب خوانده شده
طول خواندن
طول هر خوانده شده
اختیاری استدلال ها:
-h, --کمک
این پیام راهنما را نشان داده و خارج شوید
-- قطعات نام فایل
دنباله های FASTA از قطعات را بنویسید (یعنی خواندن جفت ها به علاوه دنباله های بین آنها)
به نام فایل داده شده
--غیر اجازه ندهید N یا n کاراکتر در خواندن ها وجود داشته باشد
-- دانه INT
بذر برای مولد اعداد تصادفی. پیش فرض استفاده از پیش فرض پایتون است
با استفاده از خدمات onworks.net از fastaq-to_perfect_reads به صورت آنلاین استفاده کنید