این دستور fsl-5.0-core است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
fsl - ابزارهای تجزیه و تحلیل برای تصویربرداری مغز FMRI، MRI و DTI
شرح
FSL یک ابزار جامع برای تجزیه و تحلیل داده های تصویربرداری مغز پزشکی است. آی تی
ابزارهایی برای پیش پردازش داده ها، استخراج مغز، ثبت تصویر و همچنین یک
طیف گسترده ای از تحلیل های آماری FSL یک رابط کاربری گرافیکی آسان برای استفاده فراهم می کند.
FSL به تعدادی متغیر محیطی نیاز دارد که به درستی تنظیم شوند. برای رسیدن به این،
لطفاً اسکریپت پیکربندی را از /etc/fsl/5.0/fsl.sh تهیه کنید. یکی از راه های انجام این کار
به طور خودکار اضافه کردن یک خط حاوی
. /etc/fsl/5.0/fsl.sh
به فایل bashrc. در فهرست اصلی کاربران (یا فایل مربوطه برای پوسته های دیگر
از bash). ممکن است لازم باشد ابتدا چنین فایلی ایجاد کنید.
از طرف دیگر، بسته دبیان، پیوندهای نمادین را برای تمام ابزارهای FSL در آن نصب می کند / usr / bin که
مراقب بارگیری پیکربندی مناسب به صورت خودکار باشید. نام پیوندهای نمادین هستند
با پیشوند مربوطه FSL نسخه برای جلوگیری از تداخل نام فایل و اجازه
چند نسخه برای همزیستی در یک سیستم. به عنوان مثال برش دهنده فرمان است
موجود به عنوان اسلایسر fsl5.0. لطفا توجه داشته باشید که برای استفاده FSL ابزار از طریق این سیملینک ها است
نه برای انجام مراحل راه اندازی که در بالا توضیح داده شد، ضروری است. با این حال، این راحتی
ویژگی مخصوص دبیان است. اسکریپت هایی که از دستورات FSL استفاده می کنند و قرار است به اشتراک گذاشته شوند
با دیگران باید به نام دستورات بدون پیشوند و متغیر محیطی FSL تکیه کنند
برپایی.
La FSL رابط کاربری گاهی اوقات به یک اشاره دارد FSLDIR. در سیستم های دبیان این است
/usr/share/fsl/5.0 برای FSL نسخه 5.0.
FSL اسناد و کمک آنلاین توسط fsl-5.0-doc بسته.
سوالات در مورد استفاده از FSL یا تئوری مرتبط را می توان در سایت قرار داد FSL پستی
فهرست (نگاه کنید به http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
موازی سازی
FSL را می توان به گونه ای پیکربندی کرد که کارها را به یک Sun Gridengine در حال اجرا (SGE) ارسال کند. در حالی که نه همه
عملکرد پیاده‌سازی شده در FSL از این نوع موازی‌سازی پشتیبانی میکند، که بیشترین تقاضا را دارد
ابزارهای پردازش (به عنوان مثال POSSUM و FDT) انجام می دهند.
FSL باید بتواند از SGE استفاده کند حتی اگر متغیر محیطی SGE_ROOT تنظیم نشده باشد
مورد بسته دبیان SGE. برای فعال کردن پردازش دسته ای به سادگی تنظیم کنید
FSLPARALLEL=1
در پوسته ای که FSL در آن اجرا می شود. این را می توان برای همیشه فعال کرد
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
یا به صورت موردی
با استفاده از خدمات onworks.net از fsl-5.0-core آنلاین استفاده کنید
