این دستور glam2scan است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
glam2scan - یک موتیف GLAM2 را در پایگاه داده پیدا می کند
خلاصه
glam2scan [گزینه های] الفبا my_motif.glam2 my_seqs.fa
الفبای غیر از p or n به عنوان نام یک فایل الفبا تفسیر می شود.
شرح
glam2scan در یک پایگاه داده توالی، با یک موتیف که توسط کشف شده مطابقت دارد glam2. هر یک
مسابقه یک امتیاز دریافت می کند که نشان می دهد چقدر با موتیف مطابقت دارد.
OPTIONS (پیش‌فرض تنظیمات)
-h
نمایش همه گزینه ها و تنظیمات پیش فرض آنها.
-o
فایل خروجی (stdout).
-n
تعداد ترازها برای گزارش (25).
-2
هر دو رشته را بررسی کنید - مکمل رو به جلو و معکوس.
-D
حذف شبه شمار (0.1).
-E
شبه شمار بدون حذف (2.0).
-I
درج شبه شمار (0.02).
-J
شبه شمار بدون درج (1.0).
-d
فایل مخلوط دیریکله.
با استفاده از خدمات onworks.net از glam2scan آنلاین استفاده کنید
