این دستور gmod_fasta2gff3.plp است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
$O - تبدیل FASTA به GFF3 ساده
SYNOPSYS
% $O [گزینه‌ها]
خط فرمان OPTIONS
فهرست --fasta_dir حاوی فایل های fasta است
(پیش‌فرض: ./fasta)
--gfffilename نام فایل GFF3 که باید ایجاد شود
(پیش‌فرض: ./out.gff)
-تایپ SO type برای اختصاص دادن به هر ویژگی
(پیش‌فرض: EST)
متن --source برای نمایش در ستون منبع
(پیش فرض: .)
--attributes جفت های اضافی برچسب=مقدار برای نمایش در ستون 9
-- nosequence بخش ##FASTA را سرکوب کنید (یعنی انجام ندهید
چاپ توالی DNA)
شرح
این اسکریپت به سادگی مجموعه ای از فایل های fasta را می گیرد و آنها را به GFF3 ساده تبدیل می کند
مناسب برای بارگیری در چادو
AUTHORS
اسکات کین[ایمیل محافظت شده]>
حق چاپ (ج) 2006
این کتابخانه نرم افزار رایگان است. شما می توانید آن را دوباره توزیع کنید و/یا آن را تحت همان تغییر دهید
اصطلاحات به عنوان خود پرل.
از gmod_fasta2gff3.plp به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
