این دستور gmx-view است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
gmx-view - یک مسیر را در ترمینال X-Windows مشاهده کنید
خلاصه
نمای gmx [-f [<.xtc/.trr/...>]] [-s [<.tpr>]] [-n [<.ndx>]] [-b ]
[-e ] [-dt ]
شرح
gmx دیدن بیننده مسیر GROMACS است. این برنامه یک فایل مسیر، یک اجرا را می خواند
فایل ورودی و یک فایل فهرست و ساختار سه بعدی مولکول شما را بر روی X استاندارد شما ترسیم می کند
صفحه پنجره. بدون نیاز به یک ایستگاه کاری گرافیکی پیشرفته، حتی روی تک رنگ کار می کند
صفحه نمایش
ویژگی‌های زیر پیاده‌سازی شده‌اند: نمای سه بعدی، چرخش، ترجمه و مقیاس‌بندی
از مولکول(های شما)، برچسب روی اتم ها، انیمیشن مسیرها، کپی چاپی در پست اسکریپت
فرمت، فیلترهای اتم تعریف شده توسط کاربر روی MIT-X (X واقعی) اجرا می شود، پنجره ها و موتیف باز، کاربر
منوهای دوستانه، گزینه حذف تناوب، گزینه نمایش کادر محاسباتی.
برخی از رایج‌ترین گزینه‌های خط فرمان X را می‌توان استفاده کرد: -bg, -fg تغییر رنگ، حتماً
نام فونت فونت را تغییر می دهد
OPTIONS
گزینه هایی برای تعیین فایل های ورودی:
-f [<.xtc/.trr/...>] (traj.xtc)
مسیر حرکت: xtc TRR cpt غروب g96 پی دی بی tng
-s [<.tpr>] (topol.tpr)
فایل ورودی xdr run قابل حمل
-n [<.ndx>] (index.ndx) (اختیاری)
فایل فهرست
گزینه های دیگر:
-b (0)
اولین فریم (ps) برای خواندن از مسیر
-e (0)
آخرین فریم (ps) برای خواندن از مسیر
-dt (0)
فقط زمانی از قاب استفاده کنید که t MOD dt = اولین بار (ps)
شناخته شده مسائل
· گزینه توپ کار نمی کند
· بعضی اوقات بدون دلیل موجه هسته را تخلیه می کند
از gmx-view به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
