این دستور gt-eval است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
gt-eval - فایل های حاشیه نویسی را مقایسه کنید و اندازه گیری های دقت را نشان دهید (پیش بینی در مقابل مرجع).
خلاصه
gt ارزیابی مرجع_فایل پیش‌بینی_فایل
شرح
-nuc [بله | نه]
ارزیابی سطح نوکلئوتید (مصرف حافظه متناسب با اندازه فایل ورودی است)
(پیش فرض: بله)
-ltr [بله | نه]
ارزیابی پیش‌بینی رتروترانسپوزون LTR به جای پیش‌بینی ژن (همه
عناصر LTR_retrotransposon دارای یک رشته نامشخص در نظر گرفته می شوند (پیش فرض:
نه)
-ltrdelta [ارزش]
تنظیم دلتای مجاز برای مرزهای LTR که برابر در نظر گرفته شوند (پیش‌فرض: 20)
-v [بله | نه]
پرحرف باشد (پیش‌فرض: خیر)
-o [نام فایل]
تغییر مسیر خروجی به فایل مشخص شده (پیش فرض: تعریف نشده)
-gzip [بله | نه]
نوشتن فایل خروجی فشرده gzip (پیش‌فرض: خیر)
-bzip2 [بله | نه]
فایل خروجی فشرده bzip2 را بنویسید (پیش‌فرض: خیر)
-زور [بله | نه]
نوشتن اجباری در فایل خروجی (پیش‌فرض: خیر)
-کمک
نمایش راهنما و خروج
-version
نمایش اطلاعات نسخه و خروج
این برنامه مقادیر حساسیت و ویژگی را برای انواع خاصی از ویژگی ها نشان می دهد (به عنوان مثال،
ژن، mRNA و اگزون). برای برخی از انواع ویژگی ها تعداد ویژگی های گم شده و اشتباه
آن نوع نیز نشان داده شده است. بنابراین، «غیبت» به معنای تعداد ویژگی‌های آن نوع است
"مرجع" بدون همپوشانی به یک ویژگی از آن نوع از "پیش بینی". معاون
برعکس، "اشتباه" تعداد ویژگی های آن نوع را از "پیش بینی" بدون نشان می دهد
همپوشانی با ویژگی آن نوع از "مرجع".
گزارش نویسی اشکالات
گزارش اشکالات به[ایمیل محافظت شده]>.
با استفاده از خدمات onworks.net از gt-eval آنلاین استفاده کنید
