این دستور gt-gff3validator است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
gt-gff3validator - فایل های GFF3 داده شده را به شدت تأیید کنید.
خلاصه
gt gff3validator [گزینه ...] [GFF3_file ...]
شرح
-بررسی تایپ [رشته]
از یک هستی شناسی ارائه شده در یک فایل OBO برای اعتبارسنجی روابط والد-فرزند استفاده کنید. اگر نه
آرگومان داده شده است، فایل sofa.obo از دایرکتوری gtdata/obo_files استفاده می شود. اگر
یک آرگومان داده شده است، از آن به عنوان نام فایل OBO استفاده می شود. در صورتی که چنین فایلی انجام دهد
وجود ندارد .obo به آرگومان اضافه می شود و نام فایل حاصل از آن بارگیری می شود
دایرکتوری gtdata/obo_files تلاش شده است. (پیش فرض: تعریف نشده)
-xrfcheck [رشته]
ویژگی های Dbxref و Ontology_term را برای نحو صحیح مطابق با a بررسی کنید
فایل تعریف اختصاری اگر هیچ آرگومانی داده نشد، فایل GO.xrf_abbs از
دایرکتوری gtdata/xrf_abbr استفاده می شود. اگر استدلالی داده شود، به عنوان معین استفاده می شود
نام فایل برای یک فایل مخفف. در صورتی که چنین فایلی وجود نداشته باشد،
xrf_abbr به آرگومان اضافه می شود و نام فایل حاصل از آن بارگیری می شود
دایرکتوری gtdata/xrf_abbr تلاش شده است. (پیش فرض: تعریف نشده)
-کمک
نمایش راهنما و خروج
-version
نمایش اطلاعات نسخه و خروج
گزارش نویسی اشکالات
گزارش اشکالات به[ایمیل محافظت شده]>.
از gt-gff3validator به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
