این دستور hmm-assembler.pl است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
hmm-assembler.pl - ماژول اسنپ hmm-assembler.pl
خلاصه
hmm-assembler.pl [-گزینه ها [-گزینه های بیشتر]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
OPTIONS
La پیروی تک شخصیتی گزینه های هستند پذیرفته شده:
با استدلال: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
بولی (بدون آرگومان): -r -o -x -p -t -1
گزینه ها ممکن است با هم ادغام شوند. -- پردازش گزینه ها را متوقف می کند. فضای لازم نیست
بین گزینه ها و استدلال های آنها.
گزینه های ارسال:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] شامل مدل 3'UTR، نیاز دارد -a
-a [] شامل مدل PolyA، نیاز دارد -3
-5 [] شامل 5'UTR moel، نیاز دارد -p
-p شامل مدل پروموتر عمومی، نیاز دارد -5
-r شامل مدل تکرار عمومی
-o شامل مدل ORF معکوس است
-x از مدل اینترون مدت زمان صریح استفاده کنید
-t شامل C.elegans trans-splicing، نیاز دارد -p, -5
-Z مقادیر خاص کلاد (کرم، مگس، گیاه) را تنظیم می کند
-1 مدل تک ژنی
-c
شامل مدل اهداکننده اتصال GC-AG است
از hmm-assembler.pl به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید