این فرمان loadPulses است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
loadPulses - اطلاعات پالس توالی بار
خلاصه
loadPulses basFilename cmpFilename [گزینه های]
شرح
loadPulses بارهای توالی اطلاعات پالس مانند فاصله بین پالس یا کیفیت
اطلاعات در فایل cmp.h5. این به فرد امکان می دهد تا سینتیک و کیفیت را تجزیه و تحلیل کند
اطلاعات بر اساس ستون تراز
OPTIONS
basFilename
ورودی {bas,pls}.h5 یا input.fofn.
cmpFilename
فایل cmp.h5 برای بارگیری اطلاعات پالس در.
-معیارهای ارزش
فهرستی از معیارهای جدا شده با کاما (بدون فاصله).
گزینه های معتبر عبارتند از:
WhenStarted، QualityValue، InsertionQV، MergeQV، DeletionQV، DeletionTag،
SubstitutionTag، SubstitutionQV، PreBaseFrames، IPD، StartFrame، PulseWidth،
WidthInFrames، Light، pkmid، ClassifierQV، PulseIndex
گزینه های پیش فرض عبارتند از:
QualityValue، ClassifierQV، StartFrame، PulseWidth، WidthInFrames، pkmid،
IPD
-failOnMissingData
اگر فیلدهای داده ای در ورودی bas.h5 یا pls.h5 وجود ندارد، خارج شوید
برای بارگیری یک متریک لازم است. پیش فرض یک هشدار است.
-byread
اطلاعات پالس را با خواندن به جای بافر کردن معیارها بارگیری کنید.
-بایمتری
بارگذاری اطلاعات پالس با متریک به جای خواندن. این از حافظه بیشتر استفاده می کند
-byread، اما می تواند سریعتر باشد.
-maxElements ارزش
برای بافر کردن فایل pls/bas محدودیتی تعیین کنید -بایمتری (مقدار پیش فرض:
حداکثر بین المللی). استفاده کنید -byread در صورت تجاوز از حد مجاز
-maxMemory ارزش
محدودیتی (به گیگابایت) روی حافظه برای بافر کردن داده ها تعیین کنید -بایمتری (مقدار پیش فرض: 4
گیگابایت). استفاده کنید -byread در صورت تجاوز از حد مجاز
- عناصر متا ارزش
تعداد عناصر را در حافظه پنهان متا داده برای خواندن فایل bas/bax/pls.h5 تنظیم کنید.
عناصر خامارزش
تعداد عناصر را در کش داده های خام برای خواندن فایل bas/bax/pls.h5 تنظیم کنید.
-rawChunkSize ارزش
اندازه تکه حافظه پنهان داده خام را برای خواندن فایل bas/bax/pls.h5 تنظیم کنید.
از loadPulses به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
