این دستور maskfeate است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
maskfeat - دنباله ای با ویژگی های پوشانده بنویسید
خلاصه
maskfeat -توالی seqall [نوع رشته] [-برای کاهش تغییر وضعیت] -ماسکچار رشته -بیرون دنباله رو
maskfeat -کمک
شرح
maskfeat یک برنامه خط فرمان از EMBOSS ("European Molecular Biology Open
بسته نرم افزاری"). این بخشی از گروه(های) فرمان "ویرایش، جداول ویژگی" است.
OPTIONS
ورودی بخش
-توالی seqall
اضافی بخش
نوع رشته
به‌طور پیش‌فرض، هر ویژگی در جدول ویژگی‌ها با نوع شروع «تکرار» پوشانده می‌شود.
می‌توانید این را به گونه‌ای تنظیم کنید که هر نوع ویژگی را که می‌خواهید ماسک کنید باشد. دیدن
http://www.ebi.ac.uk/embl/WebFeat/ برای لیستی از انواع ویژگی های EMBL و ببینید
پیوست A کتابچه راهنمای کاربر Swissprot در http://www.expasy.org/sprot/userman.html
برای لیستی از انواع ویژگی های Swissprot. این نوع ممکن است با استفاده از "*" علامت گذاری شود. اگر
می خواهید بیش از یک نوع را ماسک کنید، نام آنها را با فاصله یا کاما جدا کنید، به عنوان مثال:
* تکرار UTR * مقدار پیش فرض: تکرار*
-برای کاهش تغییر وضعیت
منطقه را می توان با تبدیل کاراکترهای دنباله به حروف کوچک، برخی، "ماسک" کرد
برنامه های غیر EMBOSS به عنوان مثال fasta می توانند این را به عنوان یک منطقه ماسک دار تفسیر کنند. دنباله این است
بدون تغییر به غیر از تغییر مورد. ممکن است دوست داشته باشید که تمام دنباله را تضمین کنید
قبل از پوشاندن مناطق مشخص شده به حروف کوچک با استفاده از حروف بزرگ است
پرچم "شام" مقدار پیش فرض: N
-ماسکچار رشته
کاراکتری برای استفاده در هنگام ماسک کردن. پیش‌فرض برای توالی‌های پروتئین «X»، برای نوکلئیک «N» است
دنباله ها اگر کاراکتر ماسک به صورت کاراکتر SPACE یا نویسه تهی تنظیم شده باشد،
سپس توالی با تغییر آن به حروف کوچک «ماسک» می‌شود، درست مانند مورد
پرچم "-کوچک". مقدار پیش‌فرض: @($(acdprotein)?X:N)
تولید بخش
-بیرون دنباله رو
از maskfeate به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
