miconv - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

miconv - داده های تصویر پزشکی را بین فرمت ها تبدیل می کند.

خلاصه

miconv [گزینه های] []

شرح

miconv: داده های تصویر پزشکی را بین فرمت ها تبدیل می کند.

فرمت های فایل به طور خودکار با پسوند فایلشان شناسایی می شوند. انتظار دارد در
حداقل دو نام فایل / دایرکتوری (برای فایل ورودی و خروجی) در پایان
خط فرمان. یک استثنا گزینه '-l' است که فقط به یک مورد نیاز دارد
نام فایل/دایرکتوری برای فهرست کردن محتوای آن.

سوالات عمومی گزینه ها:
-l: مجموعه ای از پارامترهای پروتکل و خروجی های جدا شده از فضا را فهرست می کند. برای دریافت a از «-l help» استفاده کنید
لیستی از پارامترهای ممکن و '-l all' برای لیست تمام پارامترها. پارامتر
هنگام استفاده از این گزینه، 'output-file' باید حذف شود.

-p: این پروتکل را برای پیش فرض ها بارگیری کنید

پروتکل گزینه ها:
-تاریخ: تاریخ اسکن [yyyymmdd] (default=20140807yyyymmdd)

-fp: FOV در جهت فاز [mm] (پیش‌فرض=220.0mm)

-fr: FOV در جهت خواندن [mm] (پیش‌فرض=220.0mm)

-fs: FOV در جهت برش [mm] (پیش‌فرض=5.0mm)

-شماره: تعداد اندازه گیری های متوالی (پیش فرض = 1)

-nx: تعداد نقاط در جهت خوانده شده (پیش فرض = 128)

-نی: تعداد نقاط در جهت فاز (پیش فرض = 128)

-nz: تعداد نقاط در جهت برش (پیش فرض = 1)

- تولد: تاریخ تولد بیماران [yyyymmdd] (default=00000000yyyymmdd)

-پید: شناسه منحصر به فرد بیمار (پیش فرض=ناشناس)

-pname: نام کامل بیمار (پیش‌فرض=ناشناس)

-psex: جنسیت بیماران (گزینه‌ها=MFO، پیش‌فرض=O)

- وزن: وزن بیماران [کیلوگرم] (پیش‌فرض = 50.0 کیلوگرم)

-دانشمند: نام دانشمند (پیش فرض=ناشناس)

-SD: فاصله بین برش (از مرکز به مرکز) [mm] (پیش‌فرض=10.0mm)

-سرد: توضیحات سری (پیش‌فرض=ناشناس)

-سرنو: شماره سری (پیش‌فرض=1)

-ست: ضخامت برش [mm] (پیش‌فرض=5.0mm)

-گل میخ: شرح مطالعه (پیش‌فرض=ناشناس)

-tcname: نام سیم پیچ انتقال (پیش فرض=ناشناس)

-بله: زمان تا اکو دنباله [ms] (پیش‌فرض = 80.0 میلی‌ثانیه)

-زمان: زمان اسکن [hhmmss] (پیش‌فرض=091009hhmmss)

-tr: زمان بین تحریکات متوالی [ms] (پیش‌فرض=1000.0ms)

پرونده خواندن گزینه ها:
-cplx: داده ها را پیچیده تلقی کنید و جزء داده شده را استخراج کنید (گزینه ها=none abs pha real
تصویر، پیش فرض = هیچ)

-ds: فهرست مجموعه داده برای استخراج اگر مجموعه داده های متعدد خوانده شود

-فیلتر: فقط مجموعه داده هایی را بخوانید که پارامتر پروتکل 'key' حاوی رشته باشد
"ارزش" (در قالب "کلید=مقدار" داده شده است)

-fmap: برای کاهش استفاده از حافظه، پس از خواندن داده ها (خام)، اما نوشتن، نقشه فایل را ادامه دهید
به آرایه منجر به خرابی می شود

-jdx: اگر چندین آرایه JDX وجود دارد، این را انتخاب کنید

-گویش: خواندن داده ها با استفاده از گویش داده شده از قالب. (پیش فرض گویش نیست)

-RF: فرمت را بخوانید، از آن برای لغو پسوند فایل استفاده کنید (options=Autodetect 3db Analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=autodetect)

-پرش: قبل از خواندن داده های خام از این مقدار بایت صرفنظر کنید (پیش فرض = 0)

پرونده نوشتن گزینه ها:
-ضمیمه: فقط برای داده های خام به فایل موجود اضافه شود

-fnamepar: فهرستی از پارامترهای پروتکل جدا شده با فاصله زمانی که باید در هنگام ایجاد یکپارچه گنجانده شود
نام پرونده ها

-بدون مقیاس: هنگام ذخیره اعداد صحیح از تغییر مقیاس مقادیر خودداری کنید

-شکاف: اجباری به تقسیم جفت پروتکل-داده به فایل های جداگانه.

نوع: نوع نمایش تصویر (گزینه ها = شناور خودکار دو برابر s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit، پیش فرض = خودکار)

-والهجه: داده ها را با استفاده از گویش فرمت داده شده بنویسید. (پیش فرض گویش نیست)

-wf: فرمت بنویسید، از آن برای لغو پسوند فایل استفاده کنید (گزینه‌ها=تشخیص خودکار 3db تجزیه و تحلیل صعودی
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=autodetect)

-wp: پروتکل را جداگانه در این فایل ذخیره کنید.

فیلترها:
-تراز کردن : داده ها را با هندسه (مکان های وکسل) تراز کنید
یک فایل خارجی

-ماسک خودکار : با استفاده از آستانه خودکار مبتنی بر هیستوگرام ماسک ایجاد کنید

-خوشه : ایجاد خوشه هایی از وکسل های غیر صفر مجاور/همسایه های بعدی، مرتب شده بر اساس اندازه

-در هم بپیچید هسته کانولوشن (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ), قطر هسته [mm]> : پیچیدگی در ابعاد فضایی

-کاهش <تعداد اجزای فرکانس پایین برای حذف، صفر میانگین حاصل
timecourse> : به مرور زمان دریفت آهسته را حذف کنید

-ویرایش <رشته موقعیت/محدوده در قالب (تایم فریم، slicepos،phasepos،readpos)، مقدار جدید
of voxel> : مقادیر تک وکسل را ویرایش کنید

-ماسک : ایجاد ماسک شامل تمام وکسل های دارای مقدار
در محدوده داده شده

-ایزوتروپ : وکسل های تصویر را از طریق درون یابی (تصویر
هندسه تغییر نخواهد کرد)

-پایین گذار : فیلتر پایین گذر

-حداکثر : همه مقادیر بالاتر از حداکثر مقدار را برش دهید

-maxip : نمایش حداکثر شدت را انجام دهید
بیش از جهت داده شده

-ادغام : مجموعه داده ها را با گسترش بعد زمان در یک مجموعه داده ادغام کنید

-من : همه مقادیر زیر مقدار حداقل را برش دهید

-مینیپ : نمایش حداقل شدت را انجام دهید
بیش از جهت داده شده

-noNaN : هر NaN را با مقدار داده شده جایگزین می کند

-pflip : داده ها را در جهت فاز برگردانید

-پرنج : انتخاب محدوده در
جهت فاز

-پروژ : انجام پیش بینی میانگین بر روی داده شده
جهت

-ماسک کوانتیل : ایجاد ماسک شامل تمام وکسل های بالاتر از کسری داده شده
آستانه

-نمونه مجدد : تغییر اندازه موقت داده های تصویر

-بزرگ : تغییر اندازه فضایی داده های تصویر

-لبه : تصویر را به یک داده تبدیل می کند
گرایش

-rflip : داده ها را در جهت خواندن برگردانید

-پوسیدگی : چرخش درون صفحه

-محدوده : انتخاب محدوده در
جهت را بخوانید

مقیاس : مقیاس مجدد مقادیر تصویر

-لغزش : داده ها را در جهت برش برگردانید

-تغییر مکان <readDirection shift [pixel],phaseDirection shift [pixel],sliceDirection shift
[pixel]> : داده ها را به صورت مکانی جابجا کنید

- زمان برش : درست برای
نقاط زمانی مختلف اکتساب برش ها

-پیچیدن : به هم متصل می شود
تصویر در جهت داده شده

-Srange : انتخاب محدوده در
جهت برش

-swapdim <[rps][-]،[rps][-]،[rps][-]> : با تعیین جهت، ابعاد را عوض کنید/انعکاس دهید
سه گانه با علامت بازتاب اختیاری ضمیمه شده است

کاشی : برش ها را در یک تصویر دو بعدی مربعی ترکیب کنید

-trange : انتخاب محدوده در
جهت زمانی

-tshift : داده ها را در زمان جابجا کنید

-typemax : همه مقادیر بالاتر از حداکثر یک نوع داده خاص را برش دهید

-typemin : همه مقادیر زیر حداقل یک نوع داده خاص را برش دهید

ماسک استفاده : مجموعه داده 1 بعدی شامل تمام مقادیر درون ماسک از فایل ایجاد کنید

دیگر گزینه ها:
-v یا برای اشکال زدایی/ردیابی همه اجزا یا یک واحد
جزء، به ترتیب. مقادیر ممکن برای loglevel عبارتند از: 0 (noLog)، 1 (errorLog)،
2 (warningLog)، 3 (infoLog).

-h, --کمک, -کمک, - نسخه : متن راهنما یا اطلاعات نسخه را چاپ کنید

پشتیبانی پرونده پسوندها (فرمت ها):
3db (داده های باینری Iris3D)

تحلیل
(NIFTI/ANALYZE، لهجه‌ها: fsl)

asc (ASCII، لهجه‌ها: tcourse)

کوی (مجموعه داده های JCAMP-DX)

dat (ماتریس داده دوبعدی Matlab ascii)

dcm (DICOM، گویش: زیمنس)

دو برابر (داده خام دو برابر)

شناور (شناور داده های خام)

gz (محفظ GNU-Zip برای فرمت های دیگر)

hdr (اینترفایل، گویش: neurostat)

hdr (NIFTI/ANALYZE، لهجه‌ها: fsl)

idx (شاخص‌های سه بعدی غیرصفر در ASCII)

ima (DICOM، گویش: زیمنس)

میان فایل
(اینترفایل، گویش ها: neurostat)

jdx (فرمت تصویر JCAMP-DX)

mag (DICOM، گویش: زیمنس)

mhd (MetaImage)

nii (NIFTI/ANALYZE، لهجه‌ها: fsl)

ph (DICOM، گویش: زیمنس)

png (گرافیک شبکه قابل حمل)

pos (موقعیت xy غیر صفرها در ASCII)

حرفه ای (پروتکل های اندازه گیری ODIN)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (داده خام 16 بیتی امضا شده)

s32bit (داده خام 32 بیتی امضا شده)

s8bit (داده خام 8 بیتی امضا شده)

smp (مجموعه داده های JCAMP-DX)

u16bit (داده خام 16 بیتی بدون علامت)

u32bit (داده خام 32 بیتی بدون علامت)

u8bit (داده خام 8 بیتی بدون علامت)

با استفاده از خدمات onworks.net از miconv به صورت آنلاین استفاده کنید