mincreshape - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

mincreshape - یک هایپر اسلب را از یک فایل minc برش می دهد (با ترتیب مجدد ابعاد)

خلاصه

شکل کوچک [ ] mnc mnc

شرح

Mincreshape's کار اصلی این است که یک Hyperslab را از یک فایل minc جدا کنید و آن را در یک فایل جدید قرار دهید
فایل minc می‌پرسید: «هیپر اسلب چیست؟» این به سادگی یک جعبه چند بعدی مشخص شده است
با یک شاخص شروع (برداری که مختصات وکسل می دهد) و یک بردار شمارش (تعدادی از
وکسل در امتداد هر محور). یک تکه از یک حجم یک ابر اسلب است (با تعداد 1
در جهت برش)، یک بلوک کوچک که از یک حجم بزرگ بیرون کشیده شده است، یک ابر اسلب است، a
حجم تک اکو از مجموعه داده ام آر آی چند اکو یک ابر اسلب است، یک نقطه زمانی از یک
اکتساب پویا یک ابر اسلب است - شما این ایده را دریافت می کنید. بررسی کنید -شروع, -شمردن و
-تغییر دامنه گزینه هایی برای جزئیات بیشتر در مورد نحوه انجام این کار (و به نمونه ها نگاه کنید!). اگر شما
در حال بیرون کشیدن تنها یک نقطه در طول یک بعد، شما می توانید آن را بسازید
بعد ناپدید می شوند، بنابراین شکل کوچک به شما توانایی کاهش ابعاد را می دهد
یک فایل minc همچنین، شما محدود به تعیین یک ابر اسلب که فقط در داخل است نیستید
فایل ورودی، می توانید فراتر از محدوده ابعاد موجود در فایل ورودی، و
علاوه بر این، می‌توانید شمارشی بدهید که داده‌ها را در یک بعد تغییر می‌دهد.

انگار همه اینها کافی نیست، شکل کوچک قابلیت سفارش مجدد ابعاد را دارد. بیشترین
حالت واضح تبدیل تصویر عرضی به تصویر تاجی است. اما می توانید a را تایپ کنید
لیستی از نام ابعاد برای بدست آوردن ترتیب دلخواه ابعاد.

شما بیشتر میخواهید!؟! خوب خوب. شکل کوچک تمام عملیات ICV کتابخانه minc را انجام می دهد
در خط فرمان موجود است. برای کسانی که دوست دارند چیزهایی تعریف شده باشند، ICV یک تصویر است
متغیر تبدیل (از من نپرسید که چرا آن را اینطور نامیدم) که اساساً به شما امکان می دهد آن را بگویید
نشان می دهد که چگونه به نظر می رسد. به عبارت دیگر، یک دسته از تبدیل ها را برای شما انجام می دهد.
این تبدیل ها شامل تغییر نوع، محدوده و عادی سازی مقادیر وکسل است.
گسترش یا انقباض تصاویر (با تکرار وکسل یا میانگین گیری) برای ارائه یک مشخصه
اندازه تصویر و تبدیل تصاویر برداری به اسکالر.

فقط برای اینکه گیج نشوید اجازه دهید اینجا واضح به شما بگویم: شکل کوچک همه را انجام می دهد
ابتدا تبدیل های ICV و سپس موارد فوق اسلب و ترتیب مجدد ابعاد اعمال می شود
نتیجه آن بنابراین اگر می خواهید آنها را با هم مخلوط کنید (مانند -imgsize, -شروع, -شمردن),
اول آن را در ذهن خود روشن کنید

خوب، روی صندلی خود بمانید: در اینجا لیستی از گزینه ها وجود دارد.

OPTIONS

توجه داشته باشید که گزینه ها را می توان به صورت اختصاری (تا زمانی که منحصر به فرد باشند) و
را می توان در هر نقطه از خط فرمان داد.

سوالات عمومی گزینه های

-2 فایل های خروجی با فرمت MINC 2.0 ایجاد کنید.

-کلوبگر
بازنویسی یک فایل موجود

-نوکلوببر
فایل موجود را بازنویسی نکنید (پیش‌فرض).

کلاهبرداری
اطلاعات پیشرفت را برای هر تکه داده کپی شده چاپ کنید (پیش فرض). یک تکه
بسته به اینکه آیا ابعاد را مجدداً سفارش می دهید یا نه، از نظر اندازه متفاوت است
بافر داخلی مجاز است چقدر بزرگ باشد.

-ساکت اطلاعات پیشرفت را چاپ نکنید.

-max_chunk_size_in_kb اندازه
حداکثر اندازه بافر کپی (به کیلوبایت) را مشخص کنید. پیش فرض 4096 کیلوبایت است
(4 مگ).

تصویر تبدیل گزینه های (پیکسل نوع و دامنه):

پیش فرض برای نوع، علامت و محدوده معتبر استفاده از فایل های ورودی است. اگر نوع است
مشخص شده است، سپس هر دو علامت و محدوده معتبر به طور پیش فرض برای آن نوع تنظیم می شوند. اگر علامت است
مشخص شده، سپس محدوده معتبر برای نوع و علامت روی پیش فرض تنظیم می شود.

-نوع فایل
هیچ گونه تبدیل نوع (پیش فرض) را انجام ندهید.

-بایت وکسل های خروجی را در قالب عدد صحیح 8 بیتی ذخیره کنید.

-کوتاه وکسل های خروجی را در قالب عدد صحیح 16 بیتی ذخیره کنید.

-int وکسل های خروجی را در قالب عدد صحیح 32 بیتی ذخیره کنید.

طولانی جایگزین شده توسط -int.

-شناور وکسل های خروجی را در قالب ممیز شناور 32 بیتی ذخیره کنید.

-دو برابر
وکسل های خروجی را در قالب ممیز شناور 64 بیتی ذخیره کنید.

-امضاء شده
مقادیر را به صورت اعداد صحیح علامت دار بنویسید (پیش فرض برای کوتاه و بلند). نادیده گرفته شده برای
انواع ممیز شناور

-بدون امضا
مقادیر را به صورت اعداد صحیح بدون علامت بنویسید (پیش‌فرض برای بایت). برای شناور بودن نادیده گرفته شد
انواع نقطه

-valid_range دقیقه حداکثر
محدوده معتبر مقادیر وکسل خروجی را در نمایش عدد صحیح آنها مشخص می کند.
پیش فرض محدوده کامل برای نوع و علامت است. این گزینه برای
مقادیر ممیز شناور

-محدوده_تصویر دقیقه حداکثر
تصاویر را به حداقل و حداکثر مقدار واقعی (نه مقدار وکسل) عادی کنید.

-عادی کردن
نرمال کردن تصاویر به حداقل و حداکثر واقعی برای کل فایل ورودی.

- غیر عادی کردن
تصاویر را عادی نکنید (پیش فرض).

-nopixfill
مقادیر خارج از محدوده را در فایل ورودی تبدیل نکنید، فقط آنها را کپی کنید.

-pixfill
مقادیر خارج از محدوده را در فایل ورودی با کوچکترین مقدار ممکن (پیش فرض) جایگزین کنید.

-pixfillvalue ارزش
یک مقدار پیکسل جدید برای جایگزینی مقادیر خارج از محدوده در فایل ورودی مشخص کنید.

تصویر تبدیل گزینه های (بعد، ابعاد، اندازه جهت و اندازه):

-اسکالر
تبدیل تصاویر برداری به تصاویر اسکالر (تصویر برداری یکی با vector_dimension
به عنوان سریعترین بعد متغیر). بعد برداری حذف شده و مقادیر هستند
متوسط

-ناسکالار
تصاویر برداری را به تصاویر اسکالر تبدیل نکنید (پیش فرض).

+ جهت
تصاویر را ورق بزنید تا مقدار گام مثبت برای محورهای فضایی ارائه شود. توجه داشته باشید که تلنگر
از محورهای فضایی فقط برای "ابعاد تصویر" اعمال می شود. این دو سریع ترین هستند
ابعاد مختلف (غیر برداری) در فایل. اگر می خواهید غیر تصویری را ورق بزنید
بعد، می توانید آن را به یک بعد تصویر تبدیل کنید کم رنگ کردن کم رنگ= -1 (
-1 یعنی واقعاً اندازه را تغییر ندهید). نمونه ها را بررسی کنید.

-جهت
تصاویر را ورق بزنید تا مقدار گام منفی را برای محورهای فضایی به دست آورید.

-هر جهتی
تصاویر را روی محورهای فضایی ورق ندهید (پیش‌فرض).

+xdirection
تصاویر را برگردانید تا مقدار xspace:step مثبت (از چپ به راست) به دست آورید.

-xdirection
تصاویر را ورق بزنید تا مقدار xspace:step منفی (از راست به چپ) بدهید.

-xanydirection
تصاویر را در امتداد محور x برگردانید.

+ydirection
تصاویر را ورق بزنید تا مقدار yspace:step (خلفی به قدامی) مثبت شود.

- جهت
تصاویر را ورق بزنید تا مقدار yspace: step منفی (قدامی به خلفی) بدهید.

-yanydirection
تصاویر را در امتداد محور y برگردانید.

+zdirection
تصاویر را ورق بزنید تا zspace:stap مقدار مثبت (پایین به برتر) بدهید.

zdirection
تصاویر را ورق بزنید تا zspace:step مقدار منفی (برتر به پایین) بدهید.

-zanydirection
تصاویر را در امتداد محور z نچرخانید.

-نگهداری
هنگام تغییر اندازه تصاویر نسبت تصویر را حفظ کنید. این بدان معنی است که وکسل ها تکرار می شوند
(یا به طور میانگین) به همان تعداد بار در طول هر بعد تصویر.

-nokeepaspect
هنگام تغییر اندازه تصاویر (پیش‌فرض) نسبت تصویر را مجبور نکنید.

-imgsize اندازه
اندازه تصویر مورد نظر را مشخص کنید (استفاده می شود اگر -اندازه ردیف or -کلاسیز داده نشده).

-اندازه ردیف اندازه
تعداد ردیف های مورد نظر را در تصویر مشخص کنید.

-کلاسیز اندازه
تعداد ستون مورد نظر را در تصویر مشخص کنید.

کم رنگ کردن بعد=اندازه
اندازه یک بعد نامگذاری شده را مشخص کنید (بعد=اندازه). توجه داشته باشید که فقط تغییر اندازه
برای "ابعاد تصویر" اعمال می شود - معمولاً دو مورد که سریعترین تغییر را دارند (غیر برداری)
ابعاد برای انجام تغییر اندازه، همه ابعاد با سریعترین تغییر تا
بعد نامگذاری شده به ابعاد تصویر تبدیل می شود و سپس این ابعاد تحت تأثیر قرار می گیرند
گزینه های جهت نام ابعاد و اندازه باید در یک خط فرمان باشد
استدلال، بنابراین اگر از فاصله ها استفاده می کنید (که اشکالی ندارد)، به یاد داشته باشید که از نقل قول ها برای پنهان کردن آنها استفاده کنید
از پوسته

تغییر شکل گزینه ها:

- عرضی
برش های عرضی را بنویسید.

- ساژیتال
برش های ساژیتال را بنویسید.

-تاج گل
برش های تاج را بنویسید.

-اختلال تیره 1,تیره 2,تیره 3، ...
ترتیب ابعاد را مشخص کنید، کجا اذعان؟ نام ابعاد هستند. تو میتونی بدی
ابعاد کمتر از آنچه در فایل وجود دارد: فرض می شود که آنها سریعترین تغییر هستند
ابعاد در فایل خروجی (بنابراین - عرضی دقیقا معادل است -اختلال
zspace، yspace، xspace). باز هم، فاصله بین نام ها مجاز است، اما به یاد داشته باشید
آنها را با نقل قول از پوسته پنهان کنید.

-تغییر دامنه خورشید=شروع[,تعداد دفعات مشاهده]
محدوده زیرنویس های بعد را برای بعد مشخص کنید خورشید. اگر تعداد دفعات مشاهده گم شده یا
0، سپس به معنای 1 در نظر گرفته می شود، اما بعد را از فایل خروجی حذف کنید (a
شمارش 1 ابعاد اندازه 1 را حفظ می کند). یک منفی تعداد دفعات مشاهده یعنی داده ها را برگردانید
در امتداد آن بعد - در این مورد شروع بالاترین مختصات وکسل را مشخص می کند
برای بعد (-تغییر دامنه xspace=3,-3 یک نسخه برگردانده می دهد
-تغییر دامنه xspace=1,3). گزینه ها -شروع و -شمردن یک راه جایگزین برای
همان اطلاعات را مشخص کنید.

-شروع coord0,coord1,coord2، ...

گوشه شروع ابر اسلب را مشخص می کند (مختصات از آهسته ترین متغیر می روند
بعد به سریعترین). اگر مختصات کمتری نسبت به ابعاد موجود در آن داده شود
سپس فرض می‌شود که برای کندترین ابعاد و ابعاد مختلف اعمال می‌شوند
مختصات باقی مانده روی 0 تنظیم شده است -تغییر دامنه برای جزئیات بیشتر هر دو -شروع و
-شمردن بردارهایی را که با ابعاد فایل ورودی بعد از تصویر مطابقت دارند، ارائه دهید
گزینه های تبدیل (ICV) اعمال شده است.

-شمردن اندازه 0,اندازه 1,اندازه 2، ...
طول لبه هایپراسلب را برای خواندن مشخص می کند (مختصات از آهسته ترین متغیر می روند
بعد به سریعترین). اگر اندازه های کمتری نسبت به ابعاد موجود در فایل داده شود،
سپس فرض بر این است که آنها برای کندترین ابعاد متغیر و بقیه اعمال می شوند
اندازه ها به اندازه کامل ابعاد تنظیم می شوند. دیدن -تغییر دامنه برای جزئیات بیشتر.
هر دو -شروع و -شمردن بردارهایی را بدهید که با ابعاد فایل ورودی مطابقت دارند
گزینه های تبدیل تصویر (ICV) اعمال شده است.

گم داده ها گزینه ها:

-نوفیل
از مقدار صفر برای نقاط خارج از حجم ورودی (پیش‌فرض) استفاده کنید.

پر کنید از یک مقدار پر برای نقاط خارج از حجم ورودی (حداقل مقدار ممکن) استفاده کنید.

ارزش پر کردن ارزش
یک مقدار پر را برای نقاط خارج از حجم ورودی مشخص کنید (این یک مقدار واقعی است،
یک مقدار پیکسل نیست).

عمومی گزینه های برای تمام دستورات:

-کمک خلاصه گزینه های خط فرمان را چاپ کنید و از آن خارج شوید.

-version
شماره نسخه برنامه را چاپ کرده و خارج شوید.

مثال ها:

فرض کنید حجمی با ابعاد zspace، yspace، xspace داریم (که عرضی است)
و سایزهای 128، 256، 256. اگر بخواهیم برش 40 را بگیریم (با حفظ مختصات)
اطلاعات مربوط به بعد zspace)، سپس می توانیم استفاده کنیم

mincreshape original.mnc new.mnc -dimrange zspace=40,1

روش دیگر، ما می توانیم استفاده کنیم

mincreshape original.mnc new.mnc -شروع 40,0,0 - تعداد 1,256,256

یا به سادگی

mincreshape original.mnc new.mnc -شروع 40 - تعداد 1

اگر می خواستیم از بعد zspace خلاص شویم، می توانیم استفاده کنیم

mincreshape original.mnc new.mnc -dimrange zspace=40,0

بیایید یک بلوک از وسط برداریم و آن را در امتداد xspace برگردانیم:

mincreshape original.mnc new.mnc \
-شروع 40,10,240،1,200،200 - تعداد XNUMX-XNUMX

اما چرا باید خود را مهار کنیم؟ بیایید از محدوده خارج شویم:

mincreshape original.mnc new.mnc \
-شروع 40،-100,340،1,200 - شمارش 200-XNUMX

اگر حجم ساژیتال می خواهید، از این استفاده کنید:

mincreshape original.mnc new.mnc -sagittal

در مورد برخی از سرهای جانبی - x و y را برگردانید. و تبدیل به بایت برای صرفه جویی در فضا در حالی که
ما در آن هستیم:

mincreshape original.mnc new.mnc -dimorder xspace,yspace -byte

شما دوست دارید حجم ها را به ترتیب x، y، z ذخیره کنید (که z سریعتر تغییر می کند! من افرادی را می شناسم که
انجام دهید!)؟ باشه.

mincreshape original.mnc new.mnc -dimorder xspace,yspace,zspace

اما شما یک مینیمالیست هستید (و بدتان نمی‌آید که از فرصت استفاده کنید). در اینجا همان چیزی است (اما آن
ممکن است برای فایل دیگری خراب شود):

mincreshape original.mnc new.mnc -dimorder zspace

بیایید مطمئن شویم که همه ابعاد دارای ویژگی گام منفی هستند (به گزینه +direction مراجعه کنید
برای برخی جزئیات):

mincreshape original.mnc new.mnc -direction -dimsize zspace=-1

از mincreshape آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید