این دستور wb_command است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
wb_command - برنامه خط فرمان برای انجام انواع وظایف الگوریتمی با استفاده از
حجم، سطح و داده های خاکستری
خلاصه
شرح
-پرونده-افزودن-به-spec یک فایل را به یک فایل مشخصات اضافه کنید
wb_command -پرونده-افزودن-به-spec
- فایل مشخصات برای اضافه کردن - ساختار
فایل اطلاعات - مسیر فایل
فایل مشخصات به دست آمده، فایل مشخصات موجود را بازنویسی می کند.
اگر مشخصات
فایل وجود ندارد، با ابرداده پیش فرض ایجاد شده است.
ساختار
آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
باطن-متوسط-متراکم-روی فرمان پشتیبان DB متصل برای بازگشت سرمایه متوسط CIFTI
wb_command باطن-متوسط-متراکم-روی
- فهرست شاخصهای cifti به میانگین با کاما جدا شده است - فایل
برای نوشتن ردیف متوسط به
این دستور احتمالاً آن چیزی نیست که به دنبال آن هستید، امتحان کنید
-cifti-average-dense-roi. لیست فایل های cifti را برای میانگین گیری از آن می گیرد
ورودی استاندارد، و خروجی آن را به صورت اندیان کوچک، عدد صحیح 32 بیتی اندازه ردیف می نویسد
به دنبال آن ردیف به عنوان شناور 32 بیتی.
-همبستگی-متوسط-روی-باطنی فرمان پشتیبان DB برای بازگشت سرمایه متوسط CIFTI
همبستگی
wb_command -همبستگی-متوسط-روی-باطنی
- فهرست شاخص های cifti با کاما به میانگین و سپس جدا شده است
همبستگی
- فایلی برای نوشتن ردیف متوسط
این دستور احتمالاً آن چیزی نیست که به دنبال آن هستید، امتحان کنید
-cifti-میانگین-roi-همبستگی. لیست فایل های cifti را برای میانگین گیری از آن می گیرد
ورودی استاندارد، و خروجی آن را به صورت اندیان کوچک، عدد صحیح 32 بیتی اندازه ردیف می نویسد
به دنبال آن ردیف به عنوان شناور 32 بیتی.
-مرز-صادرات-رنگ-جدول نام مرزها و رنگ ها را به عنوان متن بنویسید
wb_command -مرز-صادرات-رنگ-جدول
- فایل حاشیه ورودی - خروجی - فایل متنی خروجی
[-class-colors] - از رنگ های کلاس به جای رنگ های نام استفاده کنید
نام ها و رنگ های هر حاشیه را می گیرد و آن را به همان فرمت می نویسد
-metric-label-import انتظار دارد. به طور پیش فرض، حاشیه ها با نام حاشیه رنگ می شوند،
مشخص كردن -کلاس رنگ به جای آن آنها را بر اساس کلاس رنگ کنید. مقادیر کلیدی از 1 شروع می شود
و ترتیب حاشیه ها را در فایل دنبال کنید.
-border-file-export-to-caret5 صادرات فایل BORDER به فرمت فایل CARET5
wb_command -border-file-export-to-caret5
- فایل حاشیه میز کار - پیشوند برای نام
کارت خروجی 5
فایل های border/borderproj/bordercolor
[-سطح] - قابل تکرار - سطح ورودی را مشخص کنید
- یک فایل سطحی برای unprojection مرزها
یک فایل حاشیه Workbench ممکن است حاوی حاشیه هایی برای ساختارها و حاشیه های متعدد باشد
که هم پیش بینی شده و هم پیش بینی نشده است. همچنین شامل یک جدول رنگ برای
مرز ها.
Caret5 دارای هر دو فایل حاشیه (پیشبینی نشده) و پروجکشن مرزی (پروژهشده) است. که در
علاوه بر این، هر فایل حاشیه ای یا حاشیه ای Caret5 معمولا حاوی داده هایی برای
یک ساختار واحد Caret5 همچنین از یک فایل رنگ حاشیه استفاده می کند که رنگ ها را به هم مرتبط می کند
با نام مرزها
این دستور سعی می کند هر دو فایل حاشیه Caret5 و border projection را خروجی دهد.
هر فایل حاشیه/حاشیه خروجی حاوی داده هایی برای یک ساختار خواهد بود
ممکن است فایل های زیادی ایجاد شده باشد. نام ساختار در نام گنجانده شده است
هر فایل حاشیه یا حاشیه ای که ایجاد می شود.
یک فایل رنگی حاشیه Caret5 نیز با این دستور تولید می شود.
ارائه سطح(ها) به عنوان پارامترهای ورودی اختیاری است، اما توصیه می شود. سطوح
ممکن است برای ایجاد مختصات پیش بینی شده و/یا پیش بینی نشده مرزها مورد نیاز باشد.
در صورت عدم تولید مرز خروجی یا طرح مرزی به دلیل a
سطح گم شده با ساختار تطبیق، یک پیام خطا نمایش داده می شود و
برخی از فایل های خروجی ایجاد نمی شوند.
هنگام نوشتن فایل های جدید، این دستور فایلی با همین نام را بازنویسی می کند.
-مرز-ادغام فایل های BORDER را در یک فایل جدید ادغام کنید
wb_command -مرز-ادغام
- خروجی - فایل حاشیه خروجی
[-border] - قابل تکرار - یک فایل حاشیه ورودی را مشخص کنید
- یک فایل حاشیه برای استفاده از مرزها
[-select] - قابل تکرار - یک حاشیه را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام مرز
[-up-to] - از یک محدوده فراگیر از مرزها استفاده کنید
- شماره یا نام آخرین ستونی که باید درج شود
[-reverse] - از محدوده به ترتیب معکوس استفاده کنید
یک یا چند فایل حاشیه را می گیرد و یک فایل حاشیه جدید از حاشیه های موجود می سازد
آنها.
مثال: wb_command -مرز-ادغام خارج از مرز -مرز اول.مرز -انتخاب کنید 1 -مرز
دوم.مرز
این مثال اولین مرز را از first.border و به دنبال آن همه مرزها می گیرد
از second.border، و اینها را به out.border بنویسید.
-border-sample یک فایل BORDER را به مش های مختلف تبدیل کنید
wb_command -border-sample
- فایل حاشیه برای نمونه گیری مجدد - یک سطح کره ای با
مش که متریک است
در حال حاضر روشن
- یک سطح کره ای که با آن ثبت شده است
و دارای مش خروجی مورد نظر می باشد
- خروجی - فایل حاشیه خروجی
با توجه به دو سطح کروی که در رجیستر هستند، یک فایل حاشیه را دوباره نمونه می کند. فقط
مرزهایی که ساختار مشابهی با حوزه جریان دارند مجدداً نمونه برداری می شوند.
مرز به روز ROIS متریک را از مرزها ایجاد کنید
wb_command مرز به روز
- سطحی که مرزها روی آن کشیده شده است - فایل حاشیه
- خروجی - فایل متریک خروجی
[-border] - ROI فقط برای یک حاشیه ایجاد کنید
- نام مرز
[-inverse] - استفاده از انتخاب معکوس (حاشیه بیرونی)
بهطور پیشفرض، ROI را در داخل تمام حاشیههای فایل حاشیه، به عنوان متریک جداگانه ترسیم میکند
ستون ها.
-مرز به رئوس مرزها را به عنوان رئوس در یک فایل متریک رسم کنید
wb_command -مرز به رئوس
- سطحی که مرزها روی آن کشیده شده است - فایل حاشیه
- خروجی - فایل متریک خروجی
[-border] - ROI فقط برای یک حاشیه ایجاد کنید
- نام مرز
یک متریک با 1 در راس هایی که از یک مرز پیروی می کنند و 0s در جاهای دیگر خروجی می دهد. توسط
به طور پیش فرض، یک ستون متریک جداگانه برای هر حاشیه ایجاد می شود.
-cifti-all-labels-to-rois از همه برچسب ها در نقشه CIFTI LABEL، ROIS درست کنید
wb_command -cifti-all-labels-to-rois
- فایل برچسب cifti ورودی - شماره یا نام نقشه برچسب
برای استفاده - خروجی - فایل cifti خروجی
فایل cifti خروجی دارای یک ستون برای هر برچسب در نقشه ورودی مشخص شده است
از ??? برچسب، که هر کدام حاوی ROI از تمام مغزها هستند
روی برچسب مربوطه تنظیم کنید.
-cifti-میانگین متوسط فایل های CIFTI
wb_command -cifti-میانگین
- خروجی - خروجی فایل cifti
[-exclude-outliers] - موارد پرت را با انحراف استاندارد هر کدام حذف کنید
عنصر در بین فایل ها - تعداد انحرافات استاندارد کمتر از میانگین
به
شامل
- تعداد انحرافات استاندارد بالاتر از میانگین به
شامل
[-cifti] - قابل تکرار - یک فایل ورودی را مشخص کنید
- فایل cifti ورودی
[-weight] - برای این فایل یک وزن بدهید
- وزن مورد استفاده
میانگین فایل های cifti با هم.
فایل های بدون -وزن مشخص شده داده شده است
وزن 1.
If -مستثنیها مشخص شده است، در هر عنصر،
داده ها در تمام فایل ها به عنوان یک مجموعه، میانگین وزن نشده و استاندارد نمونه در نظر گرفته می شود
انحراف یافت می شود، و مقادیر خارج از تعداد مشخص شده انحراف استاندارد
از میانگین وزنی (بالقوه) در آن عنصر حذف می شوند.
-cifti-average-dense-roi متوسط ردیفهای CIFTI در بین موضوعات بر اساس ROI
wb_command -cifti-average-dense-roi
- خروجی - خروجی فایل cifti dscalar
[-cifti-roi] - فایل cifti حاوی اوزان ترکیبی
- فایل roi cifti
[-in-memory] - roi را در حافظه پنهان کنید تا دوباره خوانده نشود
هر سیفتی ورودی
[-left-roi] - وزنه هایی برای استفاده برای کنفکره چپ
- roi سمت چپ به عنوان یک فایل متریک
[-right-roi] - وزنه هایی برای استفاده برای کنفکره راست
- roi مناسب به عنوان یک فایل متریک
[-cerebellum-roi] - وزنه هایی که برای سطح مخچه استفاده می شود
- roi مخچه به عنوان یک فایل متریک
[-vol-roi] - وزن وکسل برای استفاده
- فایل حجم roi
[-left-area-surf] - سطح سمت چپ را برای تصحیح ناحیه راس مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-right-area-surf] - سطح مناسب را برای تصحیح ناحیه راس مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-cerebellum-area-surf] - سطح مخچه را برای ناحیه راس مشخص کنید
تصحیح - پرونده سطح مخچه
[-cifti] - قابل تکرار - یک فایل cifti ورودی را مشخص کنید
- یک فایل cifti به میانگین در سراسر
میانگین ردیفها برای هر نقشه از ROI (ها)، در همه فایلها.
نقشه های ROI هستند
به عنوان توابع وزنی، از جمله مقادیر منفی در نظر گرفته می شود.
برای
کارایی، اطمینان حاصل کنید که هر چیزی که برای استفاده در نظر گرفته نشده است در صفر است
نقشه بازگشت سرمایه اگر -cifti-roi مشخص شده است، چپ-روی, -راست-روی, -مخچه-رویو
-ول-روی نباید مشخص شود اگر چندین فایل ROI غیر cifti مشخص شده باشد،
آنها باید به همان تعداد ستون داشته باشند.
-cifti-میانگین-roi-همبستگی میانگین بازگشت سرمایه را با همه ردیفها و سپس میانگین بازده را با هم مرتبط کنید
فاعل، موضوع
wb_command -cifti-میانگین-roi-همبستگی
- خروجی - خروجی فایل cifti
[-cifti-roi] - فایل cifti حاوی اوزان ترکیبی
- فایل roi cifti
[-in-memory] - roi را در حافظه پنهان کنید تا دوباره خوانده نشود
هر سیفتی ورودی
[-left-roi] - وزنه هایی برای استفاده برای کنفکره چپ
- roi سمت چپ به عنوان یک فایل متریک
[-right-roi] - وزنه هایی برای استفاده برای کنفکره راست
- roi مناسب به عنوان یک فایل متریک
[-cerebellum-roi] - وزنه هایی که برای سطح مخچه استفاده می شود
- roi مخچه به عنوان یک فایل متریک
[-vol-roi] - وزن وکسل برای استفاده
- فایل حجم roi
[-left-area-surf] - سطح سمت چپ را برای تصحیح ناحیه راس مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-right-area-surf] - سطح مناسب را برای تصحیح ناحیه راس مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-cerebellum-area-surf] - سطح مخچه را برای ناحیه راس مشخص کنید
تصحیح - پرونده سطح مخچه
[-cifti] - قابل تکرار - یک فایل cifti ورودی را مشخص کنید
- یک فایل cifti به میانگین در سراسر
میانگین ردیفها برای هر نقشه از ROI، همبستگی میانگین هر ROI
به بقیه سطرها در همان فایل، سپس میانگین نتایج را در همه
فایل ها. ROI همیشه به عنوان توابع وزنی، از جمله مقادیر منفی در نظر گرفته می شود.
برای کارایی، اطمینان حاصل کنید که هر چیزی که قرار نیست استفاده شود، صفر است
نقشه ROI اگر -cifti-roi مشخص شده است، چپ-روی, -راست-روی, -مخچه-روی,
و -ول-روی نباید مشخص شود اگر چندین فایل ROI غیر cifti مشخص شده باشد،
آنها باید به همان تعداد ستون داشته باشند.
-cifti-change-timestep گام زمانی یک فایل CIFTI را تغییر دهید
wb_command -cifti-change-timestep
- فایل cifti برای تغییر
[-row-timestep] - مرحله زمانی را در ردیف ها تنظیم کنید
- ثانیه در هر گام
[-column-timestep] - مرحله زمانی را در کنار ستون ها تنظیم کنید
- ثانیه در هر گام
اگر بعد مشخص شده نقطه زمانی نباشد هشدار می دهد، در غیر این صورت مرحله زمانی را تغییر می دهد،
و در نهایت در صورت تغییر ابعاد، نتیجه را به همان نام فایل می نویسد.
توجه: احتمالاً می خواهید ردیف-گام، همانطور که با .dtseries.nii مطابقت دارد
مشخصات. گزینه دیگر فقط برای کامل بودن در دسترس است.
-تبدیل cifti ماتریس CIFTI را به فرمت های دیگر تخلیه کنید
wb_command -تبدیل cifti
[-to-gifti-ext] - تبدیل به باینری خارجی GIFTI
- فایل cifti ورودی - خروجی - فایل گیتی خروجی
[-from-gifti-ext] - یک GIFTI ساخته شده با این دستور را دوباره به a تبدیل کنید
CIFTI - فایل گیتی ورودی - خروجی - سیفتی خروجی
پرونده
[-reset-timepoints] - نگاشت در امتداد سطرها را به نقاط زمانی بازنشانی کنید.
گرفتن طول از فایل هدیه - زمان مورد نظر بین فریم ها
- افست زمان مورد نظر فریم اولیه
[-واحد] - از واحدی غیر از زمان استفاده کنید
- شناسه واحد (پیشفرض SECOND)
[-reset-scalars] - بازنشانی نقشهبرداری در امتداد ردیفها به اسکالرها، طول میکشد
از فایل گیتی
[-replace-binary] - جایگزینی داده ها با یک فایل باینری
- فایل باینری که حاوی داده های جایگزین است
[-flip-endian] - فایل باینری را بایت تعویض کنید
[-transpose] - انتقال فایل باینری
[-to-nifti] - تبدیل به NIFTI1
- فایل cifti ورودی - خروجی - خروجی فایل nifti
[-from-nifti] - یک فایل NIFTI (1 یا 2) ساخته شده با این دستور را به عقب تبدیل کنید
به CIFTI - فایل nifti ورودی - یک فایل cifti با
بعد(ها) و نقشه برداری(ها)
که باید استفاده شود
- خروجی - فایل cifti خروجی
[-reset-timepoints] - نگاشت در امتداد سطرها را به نقاط زمانی بازنشانی کنید.
گرفتن طول از فایل nifti - زمان مورد نظر بین فریم ها
- افست زمان مورد نظر فریم اولیه
[-واحد] - از واحدی غیر از زمان استفاده کنید
- شناسه واحد (پیشفرض SECOND)
[-reset-scalars] - بازنشانی نقشهبرداری در امتداد ردیفها به اسکالرها، طول میکشد
از فایل nifti
[-to-text] - تبدیل به یک فایل متنی ساده
- فایل cifti ورودی - خروجی - فایل متنی خروجی
[-col-delim] - رشته را برای قرار دادن بین عناصر در یک ردیف انتخاب کنید
- رشته مورد استفاده (پیش فرض یک کاراکتر برگه است)
[-from-text] - تبدیل از متن ساده به cifti
- فایل متنی ورودی - یک فایل cifti با
بعد(ها) و نقشه برداری(ها)
که باید استفاده شود
- خروجی - فایل cifti خروجی
[-col-delim] - رشته ای را مشخص کنید که بین عناصر در یک ردیف قرار دارد
- رشته مورد استفاده (پیش فرض هر فضای خالی است)
[-reset-timepoints] - نگاشت در امتداد سطرها را به نقاط زمانی بازنشانی کنید.
گرفتن طول از فایل متنی - زمان مورد نظر بین فریم ها
- افست زمان مورد نظر فریم اولیه
[-واحد] - از واحدی غیر از زمان استفاده کنید
- شناسه واحد (پیشفرض SECOND)
[-reset-scalars] - بازنشانی نقشهبرداری در امتداد ردیفها به اسکالرها، طول میکشد
از فایل متنی
این دستور برای تبدیل یک ماتریس کامل CIFTI به/از فرمت هایی که می تواند باشد استفاده می شود
توسط برنامه هایی استفاده می شود که CIFTI را نمی فهمند. اگر می خواهید موجودی بنویسید
فایل CIFTI با نسخه CIFTI متفاوت، نگاه کنید - تبدیل فایل، و آن
-cifti-version-convert گزینه. اگر بخشی از فایل CIFTI را به عنوان معیار میخواهید،
برچسب یا فایل حجمی را ببینید -cifti-جدا کردن. اگر می خواهید یک فایل CIFTI ایجاد کنید
از فایل های متریک و/یا حجم، به -cifti-create-* دستورات شما باید
دقیقا یکی از آنها را مشخص کنید -to-gifti-ext, -from-gifti-ext, -تو نیفتی, -از-نیفتی,
-به متن، یا -از-متن. - جابجایی گزینه ای برای -from-gifti-ext مورد نیاز است اگر
فایل باینری جایگزین به ترتیب ستون اصلی است. در -واحد گزینه ها اینها را می پذیرند
ارزش های:
رادیان هرتز متر دوم
- تبدیل سیفتی به اسکالر یک بعد CIFTI را به نقشه های اسکالار نامگذاری شده تغییر دهید
wb_command - تبدیل سیفتی به اسکالر
- فایل cifti را وارد کنید - کدام نقشه برداری را به نقشه های اسکالر تغییر دهید،
ROW یا COLUMN - خروجی - خروجی فایل cifti
[-name-file] - نام هایی را برای نقشه ها مشخص کنید
- فایل متنی حاوی نام نقشه، یکی در هر خط
یک فایل cifti جدید با همان داده های ورودی، اما با یکی از آنها ایجاد می کند
ابعاد مجموعه شامل رشته هایی است که هر نقشه را مشخص می کند. مشخص کردن ROW خواهد بود
یک فایل dtseries را به یک فایل dscalar تبدیل کنید.
-cifti-copy-mapping نگاشت را در یک فایل CIFTI جایگزین کنید
wb_command -cifti-copy-mapping
- فایل cifti برای استفاده از داده ها - کدام جهت
بر برای جایگزینی نقشه برداری - یک فایل cifti حاوی
نقشه برداری مورد نظر - در کدام جهت برای استفاده از
نقشه برداری
از جانب
- خروجی - فایل cifti خروجی
باید در جهت جایگزینی همان طول داشته باشد
در امتداد جهت قالب دارد. هر استدلال جهت باید باشد
ROW یا COLUMN.
-cifti-همبستگی ایجاد همبستگی ردیف ها در یک فایل CIFTI
wb_command -cifti-همبستگی
- فایل cifti را وارد کنید - خروجی - خروجی فایل cifti
[-roi-override] - همبستگی را از زیر مجموعه ای از ردیف ها به همه ردیف ها انجام می دهد
[-left-roi] - از یک roi برای کنفکره چپ استفاده کنید
- roi سمت چپ به عنوان یک فایل متریک
[-right-roi] - از یک roi برای کنف راست استفاده کنید
- roi مناسب به عنوان یک فایل متریک
[-cerebellum-roi] - برای مخچه از roi استفاده کنید
- roi مخچه به عنوان یک فایل متریک
[-vol-roi] - از roi برای حجم استفاده کنید
- فایل حجمی roi
[-cifti-roi] - از یک فایل cifti برای rois ترکیبی استفاده کنید
- فایل cifti roi
[-weights] - وزن ستون را مشخص کنید
- فایل متنی حاوی یک وزن در هر ستون
[-fisher-z] - تبدیل فیشر کوچک z (یعنی artanh) را به همبستگی اعمال کنید
[-no-demean] - به جای همبستگی، حاصل ضرب نقطه سطرها را انجام دهید، سپس
نرمال کردن توسط قطر
[-کوواریانس] - محاسبه کوواریانس به جای همبستگی
[-mem-limit] - استفاده از حافظه را محدود کنید
- محدودیت حافظه در گیگابایت
برای هر ردیف (یا هر ردیف داخل یک roi if -روی نادیده گرفتن مشخص شده است)، همبستگی
به تمام ردیف های دیگر در -cifti-roi گزینه فرعی به -روی نادیده گرفتن ممکن است مشخص نشود
با هر زیرگزینه دیگری -*-roi، اما میتوانید زیرگزینههای -*-roi دیگر را مشخص کنید.
با هم.
هنگام استفاده از -fisher-z گزینه، خروجی یک امتیاز Z نیست، آن را artanh(r)، به است
ریاضیات بیشتری را روی این خروجی انجام دهید، استفاده را در نظر بگیرید -cifti-math.
محدود کردن استفاده از حافظه باعث می شود که خروجی را به صورت تکه ای محاسبه کند و اگر
اندازه فایل ورودی بیش از 70٪ از محدودیت حافظه است، همچنین خوانده می شود
فایل ورودی به عنوان ردیف مورد نیاز است که در نتیجه چندین عبور از ورودی انجام می شود
فایل (یک بار در هر قطعه). نیازی نیست محدودیت حافظه یک عدد صحیح باشد، شما نیز ممکن است
0 را برای محاسبه یک ردیف خروجی در یک زمان مشخص کنید (ممکن است بسیار کند باشد).
-cifti-correlation-gradient ردیف های CIFTI را با هم مرتبط کنید و گرادیان بگیرید
wb_command -cifti-correlation-gradient
- سیفتی ورودی - خروجی - سیفتی خروجی
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-left-corrected-areas] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه
آنها را از سطح چپ - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-right-corrected-areas] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه
آنها را از سطح سمت راست - نواحی راس اصلاح شده، به عنوان یک متریک
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
[-مخچه-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای
محاسبه آنها از سطح مخچه - راس تصحیح شده
مناطق، به عنوان یک متریک
[-سطح-پیش صاف] - قبل از محاسبه بر روی سطح صاف می شود
شیب - سیگما برای صاف کردن سطح گاوسی
هسته، بر حسب میلی متر
[-volume-presmooth] - قبل از محاسبه گرادیان، حجم را صاف کنید
- سیگما برای هسته صاف کننده حجم گاوسی،
در میلی متر
[-undo-fisher-z] - تبدیل z کوچک فیشر معکوس را به آن اعمال کنید
ورودی
[-fisher-z] - تبدیل فیشر کوچک z را به همبستگی ها اعمال کنید
قبل از گرفتن گرادیان
[-surface-exclude] - حذف رئوس نزدیک به هر رأس دانه از
محاسبه - فاصله ژئودزیکی از رأس بذر برای حذف
منطقه، بر حسب میلی متر
[-volume-exclude] - وکسل های نزدیک به هر وکسل دانه را از محاسبه حذف کنید
- فاصله از وکسل دانه برای منطقه محرومیت، برحسب میلی متر
[-کوواریانس] - محاسبه کوواریانس به جای همبستگی
[-mem-limit] - استفاده از حافظه را محدود کنید
- محدودیت حافظه در گیگابایت
برای هر ساختار، همبستگی ردیفهای ساختار را محاسبه کرده و بگیرید
گرادیان ردیف های به دست آمده، سپس آنها را به طور میانگین. محدودیت حافظه لازم نیست
برای اینکه یک عدد صحیح باشد، می توانید 0 را نیز تعیین کنید تا از حافظه کمتری که ممکن است استفاده شود (این
ممکن است بسیار کند باشد).
-cifti-create-densse-from-template CIFTI را با نقشه متراکم منطبق ایجاد کنید
wb_command -cifti-create-densse-from-template
- فایل برای مطابقت با مغزهای - خروجی -
خروجی فایل cifti
[-series] - یک فایل dtseries به جای dscalar بسازید
- افزایش بین نقاط سری - مقدار شروع سری
[-واحد] - انتخاب واحد برای سری (پیشفرض SECOND)
- شناسه واحد
[-volume-all] - یک فایل حجم ورودی برای همه داده های voxel مشخص کنید
- فایل حجم ورودی
[-from-cropped] - ورودی به اندازه داده های وکسل بریده می شود
در فایل قالب
[-cifti] - قابل تکرار - از داده های ورودی از یک فایل cifti استفاده کنید
- فایل cifti حاوی داده های ورودی
[-metric] - قابل تکرار - از داده های ورودی از یک فایل متریک استفاده کنید
- فایل متریک را در کدام ساختار قرار دهید - ورودی
فایل متریک
[-label] - قابل تکرار - استفاده از داده های ورودی از فایل های برچسب سطح
- فایل برچسب را در کدام ساختار قرار دهید - برچسب ورودی
پرونده
[-volume] - قابل تکرار - از یک فایل حجمی برای یک جلد استفاده کنید
داده های ساختار - فایل حجم را در کدام ساختار قرار دهید
- فایل حجم ورودی
[-from-cropped] - ورودی به اندازه حجم برش داده می شود
ساختار
این دستور به شما کمک می کند تا یک فایل dscalar، dtseries یا dlabel cifti جدید بسازید که
با فضای مغزی مورد استفاده در یک فایل cifti دیگر مطابقت دارد. فایل قالب باید
در نقشه برداری در امتداد جهت ستون (برای
dtseries، dscalar، dlabel و dconn متقارن همیشه همینطور است). همه ورودی
فایلهای cifti باید دارای نگاشت مدلهای مغز در امتداد ستون باشند و از همان حجم استفاده کنند
فضا و/یا رأس سطح بهعنوان الگوی ساختارهای موجود در آنها بهشمار میآیند.
اگر هر فایل ورودی حاوی دادههای برچسب باشد، فایلهای ورودی با دادههای بدون برچسب نیستند
مجاز، و -سلسله ممکن است از گزینه استفاده نشود
هر ساختاری که توسط ورودی پوشانده نشده باشد با صفر یا بدون برچسب پر می شود
کلیدی
در استدلال از متریک, -برچسب or -جلد باید یکی از
زیر است:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
استدلال به -واحد باید یکی از موارد زیر باشد:
رادیان هرتز متر دوم
-cifti-create-dense-scalar یک فایل اسکالار CIFTI DENSE ایجاد کنید
wb_command -cifti-create-dense-scalar
- خروجی - فایل cifti خروجی
[-volume] - جزء حجم
- فایل حجمی حاوی تمام داده های وکسل برای تمام حجم ها
ساختار
- فایل حجم برچسب حاوی برچسبهایی برای cifti
ساختار
[-left-metric] - متریک برای سطح چپ
- فایل متریک
[-roi-left] - roi رئوس برای استفاده از سطح چپ
- ROI به عنوان یک فایل متریک
[-right-metric] - متریک برای سطح چپ
- فایل متریک
[-roi-right] - roi رئوس برای استفاده از سطح راست
- ROI به عنوان یک فایل متریک
[-مخچه-متریک] - متریک برای مخچه
- فایل متریک
[-roi-cerebellum] - roi رئوس برای استفاده از سطح راست
- ROI به عنوان یک فایل متریک
همه فایل های ورودی باید تعداد ستون ها/زیرجلدهای یکسانی داشته باشند.
تنها
اجزای مشخص شده در سیفتی خروجی قرار خواهند گرفت.
نام نقشه ها خواهد بود
از یکی از فایل های ورودی گرفته شده است.
حداقل یک جزء باید باشد
مشخص شده.
جلد برچسب باید برخی از نامهای برچسب را داشته باشد
در این لیست، همه نامهای برچسب دیگر نادیده گرفته میشوند:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
-cifti-create-dense-series یک سری زمانی متراکم CIFTI ایجاد کنید
wb_command -cifti-create-dense-series
- خروجی - فایل cifti خروجی
[-volume] - جزء حجم
- فایل حجمی حاوی تمام داده های وکسل برای تمام حجم ها
ساختار
- فایل حجم برچسب حاوی برچسبهایی برای cifti
ساختار
[-left-metric] - متریک برای سطح چپ
- فایل متریک
[-roi-left] - roi رئوس برای استفاده از سطح چپ
- ROI به عنوان یک فایل متریک
[-right-metric] - متریک برای سطح چپ
- فایل متریک
[-roi-right] - roi رئوس برای استفاده از سطح راست
- ROI به عنوان یک فایل متریک
[-مخچه-متریک] - متریک برای مخچه
- فایل متریک
[-roi-cerebellum] - roi رئوس برای استفاده از سطح راست
- ROI به عنوان یک فایل متریک
[-timestep] - مرحله زمانی را تنظیم کنید
- مرحله زمانی، در ثانیه (پیشفرض 1.0)
[-timestart] - زمان شروع را تنظیم کنید
- زمان در اولین فریم، بر حسب ثانیه (پیشفرض 0.0)
[-واحد] - از واحدی غیر از زمان استفاده کنید
- شناسه واحد (پیشفرض SECOND)
همه فایل های ورودی باید تعداد ستون ها/زیرجلدهای یکسانی داشته باشند.
تنها
اجزای مشخص شده در سیفتی خروجی قرار خواهند گرفت.
حداقل یکی
جزء باید مشخص شود.
حجم برچسب باید مقداری از آن را داشته باشد
نامهای برچسب از این لیست، همه نامهای برچسب دیگر نادیده گرفته میشوند:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
La -واحد گزینه این مقادیر را می پذیرد:
رادیان هرتز متر دوم
-cifti-create-label یک فایل CIFTI LABEL ایجاد کنید
wb_command -cifti-create-label
- خروجی - فایل cifti خروجی
[-volume] - جزء حجم
- فایل حجمی حاوی داده های برچسب - برچسب
فایل حجمی با نام ساختار cifti به
بسته های حجمی را تعریف کنید
[-left-label] - فایل برچسب برای سطح سمت چپ
- فایل برچسب
[-roi-left] - roi رئوس برای استفاده از سطح چپ
- ROI به عنوان یک فایل متریک
[-right-label] - برچسب برای سطح چپ
- فایل برچسب
[-roi-right] - roi رئوس برای استفاده از سطح راست
- ROI به عنوان یک فایل متریک
[-cerebellum-label] - برچسب برای مخچه
- فایل برچسب
[-roi-cerebellum] - roi رئوس برای استفاده از سطح راست
- ROI به عنوان یک فایل متریک
همه فایل های ورودی باید تعداد ستون ها/زیرجلدهای یکسانی داشته باشند.
تنها
اجزای مشخص شده در سیفتی خروجی قرار خواهند گرفت.
حداقل یکی
جزء باید مشخص شود.
La -جلد گزینه ای از -cifti-create-label به دو آرگومان حجمی نیاز دارد
آرگومان label-volume شامل تمام برچسب هایی است که می خواهید نمایش دهید (به عنوان مثال هسته های
تالاموس)، در حالی که آرگومان بسته-حجم شامل تمام ساختارهای CIFTI شما می شود
میخواهید دادهها را در داخل قرار دهید (مانند THALAMUS_LEFT، THALAMUS_RIGHT). اگر فقط می خواهید
برچسبهای موجود در وکسل به عنوان نام ساختار هستند، میتوانید از یک فایل برای هر دو استفاده کنید
استدلال ها حجم بسته باید از برخی از نامهای برچسب از این فهرست استفاده کند
سایر نامهای برچسب در حجم بسته نادیده گرفته میشوند:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
-cifti-create-scalar-series داده های سری را به CIFTI وارد کنید
wb_command -cifti-create-scalar-series
- فایل ورودی - خروجی - خروجی فایل cifti
[-transpose] - اگر ردیفهای فایل متنی در امتداد اسکالر هستند استفاده کنید
بعد
[-name-file] - از یک فایل متنی برای تنظیم نام ها در ابعاد اسکالر استفاده کنید
- فایل متنی حاوی نام، یکی در هر خط
[-series] - واحدها و مقادیر سری را تنظیم کنید
- واحد مورد استفاده - مقدار در نقطه سری اول -
فاصله بین نقاط سری
یک فایل متنی حاوی سری هایی با طول مساوی را به یک فایل cifti تبدیل کنید. متن
فایل باید دارای خطوطی باشد که از اعداد جدا شده با فضای خالی، بدون هیچ اضافی تشکیل شده باشد
خطوط جدید بین خطوط
در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
رادیان هرتز متر دوم
همبستگی متقابل cifti یک فایل CIFTI را با یک فایل CIFTI دیگر مرتبط کنید
wb_command همبستگی متقابل cifti
- اولین ورودی فایل cifti - فایل cifti ورودی دوم
- خروجی - خروجی فایل cifti
[-weights] - وزن ستون را مشخص کنید
- فایل متنی حاوی یک وزن در هر ستون
[-fisher-z] - تبدیل فیشر کوچک z (یعنی artanh) را به همبستگی اعمال کنید
[-mem-limit] - استفاده از حافظه را محدود کنید
- محدودیت حافظه در گیگابایت
هر ردیف را به هم مرتبط می کند با هر ردیف در .
La
نقشه برداری در امتداد ستون ها در تبدیل به نقشه برداری در امتداد سطرها در خروجی می شود.
هنگام استفاده از -fisher-z گزینه، خروجی یک امتیاز Z نیست، آن را artanh(r)، به است
ریاضیات بیشتری را روی این خروجی انجام دهید، استفاده را در نظر بگیرید -cifti-math.
محدود کردن استفاده از حافظه باعث می شود که خروجی را به صورت تکه ای محاسبه کند
خواندن از طریق چندین بار.
-cifti-dilate یک فایل CIFTI را گسترش دهید
wb_command -cifti-dilate
- فایل cifti ورودی - کدام بعد باید گشاد شود،
ROW یا COLUMN - فاصله گشاد شدن روی سطوح، بر حسب میلی متر
- فاصله گشاد شدن در حجم، بر حسب میلی متر -
خروجی - فایل cifti خروجی
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-left-corrected-areas] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه
آنها را از سطح چپ - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-right-corrected-areas] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه
آنها را از سطح سمت راست - نواحی راس اصلاح شده، به عنوان یک متریک
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
[-مخچه-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای
محاسبه آنها از سطح مخچه - راس تصحیح شده
مناطق، به عنوان یک متریک
[-bad-brainordinate-roi] - یک roi از مغزهها را برای بازنویسی مشخص کنید،
به جای صفرها - فایل cifti dscalar یا dtseries، مقادیر مثبت
مشخص کن
متصدیان مغز باید ارزش های خود را جایگزین کنند
[-نزدیکترین] - هنگام گشاد کردن داده های غیر برچسب از نزدیکترین مقدار استفاده کنید
[-merged-volume] - اجزای حجم را طوری رفتار کنید که انگار یک واحد هستند
جزء
برای همه مقادیر دادهای که بهعنوان بد تعیین میشوند، اگر همسایه یک مقدار خوب باشند یا در داخل باشند
فاصله مشخص شده از یک مقدار خوب در همان نوع مدل، مقدار را جایگزین کنید
با میانگین وزنی فاصله از مقادیر خوب نزدیک، در غیر این صورت مقدار را روی تنظیم کنید
صفر اگر -نزدیک ترین مشخص شده است، از مقدار نزدیکترین مقدار خوب استفاده خواهد کرد
در محدوده به جای میانگین وزنی.
گزینه های -*-تصحیح مناطق برای اتساع به طور متوسط گروه در نظر گرفته شده است
سطوح، اما این تنها یک اصلاح تقریبی برای کاهش ساختار است
در سطح متوسط گروهی
If بد-مغز-روی مشخص شده است، تمام مقادیر، از جمله مقادیر با ارزش
صفر، خوب هستند، به جز مکان هایی با مقدار مثبت در ROI. اگر هست
مشخص نشده است، فقط مقادیر برابر با صفر بد هستند.
-cifti-estimate-fwhm یکنواختی FWHM یک فایل CIFTI را برآورد کنید
wb_command -cifti-estimate-fwhm
- فایل cifti ورودی
[-merged-volume] - اجزای حجم را طوری رفتار کنید که انگار یک واحد هستند
جزء
[-column] - فقط برآوردهای خروجی برای یک ستون
- شماره ستون
[-سطح] - قابل تکرار - سطح ورودی را مشخص کنید
- برای چه ساختاری از این سطح استفاده شود - فایل سطحی
تخمین صافی اجزای فایل cifti، چاپ برآوردها
به خروجی استاندارد اگر -ادغام شده-حجم استفاده می شود، همه وکسل ها به صورت تکی استفاده می شوند
جزء، به جای جدا شدن توسط ساختار.
باید یکی از موارد زیر باشد:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
-cifti-export-dese-mapping ایندکس را در نگاشت عنصر به عنوان متن بنویسید
wb_command -cifti-export-dese-mapping
- فایل cifti - نقشه برداری از کدام جهت صادر شود،
ROW یا COLUMN
[-volume-all] - نگاشت تمام وکسل ها را صادر می کند
- خروجی - فایل متنی خروجی
[-no-cifti-index] - فهرست cifti را در فایل خروجی ننویسید
[-structure] - ساختاری که هر وکسل به آن تعلق دارد را در خروجی بنویسید
پرونده
[-سطح] - قابل تکرار - صادرات نگاشت یک ساختار سطح
- ساختار به خروجی - خروجی - فایل متنی خروجی
[-no-cifti-index] - فهرست cifti را در فایل خروجی ننویسید
[-volume] - قابل تکرار - صادرات نگاشت ساختار یک حجم
- ساختار به خروجی - خروجی - فایل متنی خروجی
[-no-cifti-index] - فهرست cifti را در فایل خروجی ننویسید
این دستور فایل های متنی را تولید می کند که نگاشت از شاخص های cifti به را توصیف می کند
رئوس یا وکسل های سطحی همه شاخص ها بر مبنای صفر هستند. فرمت پیش فرض برای
سطح خطوطی از فرم است:
فرمت پیش فرض برای -جلد و -حجم-همه خطوطی از فرم است:
-cifti-extrema EXTREMA را در یک فایل CIFTI پیدا کنید
wb_command -cifti-extrema
- سیفتی ورودی - حداقل فاصله بین اکستریم ها
از همان
نوع، برای اجزای سطح
- حداقل فاصله بین انتها از همان
نوع، برای اجزای حجم
- کدام بعد برای پیدا کردن امتداد، ROW یا COLUMN -
خروجی - خروجی cifti
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
[-سطح-پیش صاف] - قبل از یافتن اکسترم روی سطح صاف شود
- سیگما برای صاف کردن سطح گاوسی
هسته، بر حسب میلی متر
[-volume-presmooth] - اجزای حجمی صاف قبل از یافتن اکسترم
- سیگما برای هسته صاف کننده حجم گاوسی،
در میلی متر
[-آستانه] - افراطی کوچک را نادیده بگیرید
- بزرگترین مقداری که باید برای حداقل بودن در نظر گرفت - کوچکترین
مقدار برای حداکثر بودن در نظر گرفته شود
[-merged-volume] - اجزای حجم را طوری رفتار کنید که انگار یک واحد هستند
جزء
[-sum-maps] - بهجای هر نقشه، مجموع نقشههای اضافی را خروجی میدهد
به طور جداگانه
[-consolidate-mode] - از ادغام حداقل های محلی به جای a استفاده کنید
محله بزرگ
[-only-maxima] - فقط حداکثر را پیدا کنید
[-only-minima] - فقط حداقل را پیدا کنید
مکانهای مکانی را در یک فایل cifti پیدا میکند که مقادیر شدیدتر از همه دارند
مکان های نزدیک در همان جزء (ساختار سطحی یا حجمی). ورودی
فایل cifti باید دارای نقشه مدل های مغز در جهت مشخص شده باشد. ستون
جهتی است که روی dtseries و dscalar کار می کند. برای dconn، اگر متقارن باشد
از COLUMN استفاده کنید، در غیر این صورت از ROW استفاده کنید.
-cifti-کاذب-همبستگی همبستگی را به صورت محلی و در سراسر/از طریق SULCI/GYRI مقایسه کنید
wb_command -cifti-کاذب-همبستگی
- فایل cifti برای استفاده برای همبستگی <3D-dist> - حداکثر فاصله سه بعدی
برای بررسی اطراف هر رأس - حداکثر فاصله ژئودزیکی برای استفاده
همسایه
ارتباط
- حداقل فاصله ژئودزیکی برای استفاده برای همسایگان
ارتباط
- خروجی - خروجی فایل cifti dscalar
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-dump-text] - مقادیر خام مورد استفاده در یک فایل متنی را تخلیه کنید
- فایل متنی خروجی
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-dump-text] - مقادیر خام مورد استفاده در یک فایل متنی را تخلیه کنید
- فایل متنی خروجی
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
[-dump-text] - مقادیر خام مورد استفاده در یک فایل متنی را تخلیه کنید
- فایل متنی خروجی
برای هر رأس، میانگین همبستگی را در محدوده ای از ژئودزیک محاسبه کنید
فواصلی که از یک شیار/شکنج عبور نمی کنند، و همبستگی با نزدیکترین آنها
راس از یک شیار/شکنج عبور می کند. یک راس برای عبور از یک شیار/شکنج در نظر گرفته می شود اگر
فاصله سه بعدی کمتر از یک سوم فاصله ژئودزیکی است. فایل خروجی
شامل نسبت بین این همبستگی ها و برخی نقشه های اضافی برای کمک است
نسبت را توضیح دهید
-cifti-find-clusters خوشه های فیلتر بر اساس منطقه/حجم
wb_command -cifti-find-clusters
- سیفتی ورودی - آستانه برای داده های سطحی
ارزش های - آستانه برای سطح خوشه، در میلی متر ^ 2
- آستانه برای مقادیر داده های حجمی -
آستانه برای اندازه خوشه حجم، در میلی متر^3 - برای کدام بعد استفاده شود
اطلاعات مکانی، ROW یا
ستون
- خروجی - سیفتی خروجی
[-less-than] - مقادیر کمتر از ، به جای
بیشتر
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
از سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
از سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
از سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-cifti-roi] - جستجو فقط در مناطق مورد علاقه
- مناطق برای جستجو در داخل، به عنوان یک فایل cifti
[-merged-volume] - اجزای حجم را طوری رفتار کنید که انگار یک واحد هستند
جزء
[-size-ratio] - خوشه های کوچکتر از کسری معین را نادیده بگیرید
بزرگترین خوشه در ساختار - کسری از ساختار
بزرگترین منطقه خوشه - کسری از بزرگترین خوشه سازه
حجم
[-فاصله] - خوشهها را دورتر از فاصله معینی نادیده بگیرید
بزرگترین خوشه در ساختار - چقدر از بزرگترین
cluster a cluster can
باشد، لبه به لبه، برحسب میلی متر
- یک خوشه چقدر می تواند از بزرگترین خوشه دور باشد،
لبه به لبه، در میلی متر
[-start] - شروع به برچسب زدن خوشه ها از مقداری غیر از 1 کنید
- مقداری که به اولین خوشه یافت شده داده می شود
خروجی یک فایل cifti با اعداد صحیح غیرصفر برای همه مغزها در یک بزرگ
به اندازه کافی خوشه، و صفر در جاهای دیگر. اعداد صحیح نشان دهنده عضویت در خوشه (با
به طور پیش فرض، اولین خوشه یافت شده از مقدار 1، خوشه دوم 2 و غیره استفاده می کند. ورودی
فایل cifti باید دارای نگاشت مدل های مغز در بعد انتخابی، ستون هایی برای
dtseries، و یا برای .dconn. ROI باید یک نقشه برداری از مدل های مغز داشته باشد
ستونها، دقیقاً مطابق با نگاشت جهت انتخاب شده در فایل ورودی.
داده های خارج از ROI نادیده گرفته می شود.
-cifti-gradient GRADIDENT از یک فایل CIFTI بگیرید
wb_command -cifti-gradient
- سیفتی ورودی - گرادیان را در کنار کدام بعد قرار دهیم،
ROW یا COLUMN - خروجی - سیفتی خروجی
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-left-corrected-areas] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه
آنها را از سطح چپ - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-right-corrected-areas] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه
آنها را از سطح سمت راست - نواحی راس اصلاح شده، به عنوان یک متریک
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
[-مخچه-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای
محاسبه آنها از سطح مخچه - راس تصحیح شده
مناطق، به عنوان یک متریک
[-سطح-پیش صاف] - قبل از محاسبه بر روی سطح صاف می شود
شیب - سیگما برای صاف کردن سطح گاوسی
هسته، بر حسب میلی متر
[-volume-presmooth] - قبل از محاسبه گرادیان، روی سطح صاف است
- سیگما برای هسته صاف کننده حجم گاوسی،
در میلی متر
[-متوسط-خروجی] - میانگین نقشه های بزرگی گرادیان را خروجی می کند
به جای هر نقشه گرادیان به طور جداگانه
[-بردار] - بردارهای گرادیان خروجی
- خروجی - بردارها، به عنوان یک فایل dscalar
محاسبه گرادیان را بر روی هر جزء از فایل cifti و به صورت اختیاری انجام می دهد
گرادیان های حاصل را میانگین می کند. در بردارها و -میانگین خروجی گزینه ها ممکن است نه
با هم استفاده شود شما باید برای هر ساختار سطحی یک سطح را مشخص کنید
فایل cifti. جهت COLUMN باید سریعتر باشد و جهتی است که کار می کند
در dtseries برای dconn، احتمالاً ROW می خواهید، مگر اینکه از آن استفاده کنید
-میانگین خروجی.
-cifti-label-adjacency ایجاد ماتریس مجاورت از یک فایل برچسب CIFTI
wb_command -cifti-label-adjacency
- فایل برچسب cifti ورودی - خروجی - سیفتی خروجی
ماتریس مجاورت pconn
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
وکسل های مجاور صورت و رئوس متصل را که دارای مقادیر برچسب متفاوتی هستند، پیدا کنید.
و آنها را برای هر جفت بشمارید. شمارش های به دست آمده را در یک بسته بندی قرار دهید
فایل اتصال، با قطر آن صفر است. این یک تخمین تقریبی از
طول یا وسعت مرز بین دو برچسب چقدر است.
-cifti-label-export-table میز برچسب صادراتی از CIFTI به عنوان متن
wb_command -cifti-label-export-table
- فایل برچسب cifti ورودی - شماره یا نام نقشه برچسب
برای استفاده - خروجی - فایل متنی خروجی
جدول برچسب را از نقشه برچسب cifti می گیرد و در قالب متن می نویسد
مطابق با آنچه مورد انتظار است -cifti-label-import.
-cifti-label-import از یک فایل CIFTI یک فایل برچسب CIFTI درست کنید
wb_command -cifti-label-import
- فایل cifti ورودی - فایل متنی حاوی مقادیر
و نام برای برچسب ها - خروجی - فایل لیبل cifti خروجی
[-discard- Others] - مقادیری که در لیست برچسب ذکر نشده اند را روی مقدار تنظیم کنید
؟؟؟ برچسب
[-unlabeled-value] - مقداری را تنظیم کنید که به عنوان بدون برچسب تفسیر شود
- مقدار عددی بدون برچسب (پیشفرض 0)
[-drop-unused-labels] - مقادیر برچسب استفاده نشده را از برچسب حذف کنید
جدول
یک فایل برچسب cifti از یک فایل cifti با مقادیر برچسب مانند ایجاد می کند.
شما
ممکن است رشته خالی را مشخص کند ('' روی لینوکس/مک کار خواهد کرد) برای ،
که به گونه ای رفتار می شود که گویی یک فایل خالی است. فایل لیست برچسب باید داشته باشد
خطوط با فرمت زیر:
کلید "unlabeled" را در فایل مشخص نکنید، فرض بر این است که 0 به معنای خیر است
برچسب زده شده مگر اینکه -unlabeled-value مشخص شده است. نام برچسب ها باید روی یک برچسب جداگانه باشد
خط، اما ممکن است حاوی فاصله یا سایر کاراکترهای غیرعادی باشد (اما نه خط جدید).
فضای خالی از هر دو انتهای نام برچسب بریده شده است، اما اگر در آن باشد، حفظ می شود
وسط یک برچسب مقادیر قرمز، سبز، آبی و آلفا باید از اعداد صحیح باشند
0 تا 255، و رنگی را که برچسب ترسیم شده است مشخص می کند (آلفای 255 به معنای
مات، که احتمالاً همان چیزی است که شما می خواهید). به طور پیش فرض، نام برچسب های جدیدی را تنظیم می کند
با نام LABEL_# برای هر مقداری که در لیست ذکر نشده است
فایل، مشخص کنید دور انداختن-دیگران به جای آن اینها را روی کلید "بدون برچسب" تنظیم کنید.
-cifti-label-to-roi یک برچسب CIFTI را در ROI ایجاد کنید
wb_command -cifti-label-to-roi
- فایل برچسب cifti ورودی - خروجی - سیفتی خروجی
فایل اسکالر
[-name] - برچسب را با نام انتخاب کنید
- نام برچسبی که میخواهید یک روی از آن داشته باشید
[-key] - برچسب به کلید را انتخاب کنید
- کلید برچسبی که می خواهید از آن roi کنید
[-map] - یک نقشه برچسب واحد را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام نقشه
برای هر نقشه در ، یک نقشه در ایجاد می شود که در آن همه مکان ها
برچسب گذاری شده با یا با یک کلید از مقدار 1 داده می شود و
همه مکان های دیگر 0 داده شده است. دقیقا یکی از -سیب زمینی شیرین و -کی باید مشخص شود.
مشخص کردن -نقشه برای استفاده از تنها یک نقشه از .
-cifti-math ارزیابی بیان در فایل های CIFTI
wb_command -cifti-math
- عبارت برای ارزیابی، در نقل قول - خروجی -
خروجی فایل cifti
[-fixnan] - نتایج NaN را با یک مقدار جایگزین کنید
- مقدار جایگزین NaN با
[-override-mapping-check] - نگاشت ها را برای سازگاری بررسی نکنید،
فقط طول را بررسی کنید
[-var] - قابل تکرار - یک فایل cifti برای استفاده به عنوان متغیر
- نام متغیر، همانطور که در عبارت استفاده می شود - سیفتی
فایل برای استفاده به عنوان این متغیر
[-select] - قابل تکرار - یک شاخص واحد را از یک بعد انتخاب کنید
- بعد برای انتخاب (بر اساس 1) - شاخص مورد استفاده (بر اساس 1)
[-repeat] - مقادیر انتخاب شده را برای هر شاخص خروجی در داخل تکرار کنید
این بعد
این دستور ارزیابی می کند در هر عنصر ماتریس به طور مستقل. آنجا
باید حداقل یکی باشد -var گزینه (برای دریافت طرح خروجی از)، حتی اگر
مشخص شده در آن استفاده نشده است .
برای انتخاب یک ستون از یک فایل دو بعدی (اکثر فایلهای cifti دو بعدی هستند)، استفاده کنید -انتخاب کنید 1
، جایی که مبتنی بر 1 است. برای انتخاب یک ردیف از یک فایل 2 بعدی، استفاده کنید
-انتخاب کنید 2 . جایی که -انتخاب کنید استفاده نمی شود، فایل های cifti باید سازگار باشند
نقشهبرداریها (مثلاً، مدلهای مغز و نگاشت بستهها باید دقیقاً به جز برای
نام بسته ها). استفاده کنید لغو-نقشه-بررسی برای رد شدن از این بررسی
نام فایل ها در آن معتبر نیستند ، از نام متغیر و a استفاده کنید -var گزینه با
تطابق برای تعیین یک فایل ورودی فرمت از هست مثل
به شرح زیر است:
عبارات شامل ثابت ها، متغیرها، عملگرها، پرانتزها و توابع هستند.
در نماد infix، مانند 'exp(-x + 3) * مقیاس'. متغیرها رشته هایی از هر کدام هستند
طول، با استفاده از کاراکترهای az، AZ، 0-9، و _، اما ممکن است نام یک
ثابت نامگذاری شده است. در حال حاضر، تنها یک ثابت به نام PI وجود دارد. اپراتورها
عبارتند از +، -، *، /، ^، >، <، >=، <=، ==، !=، !، &&، ||. اینها مانند C رفتار می کنند، به جز
که ^ توان است، یعنی pow(x, y) و اولویت بیشتری نسبت به سایرین دارد
عملگرهای باینری (همچنین، '-3^-4^-5' به معنای '-(3^(-(4^-5)))'). <=، >=، ==، و !=
به اپراتورها مقدار کمی از اتاق تکان دادن، برابر با یک میلیونیم داده می شود
کوچکتر از مقادیر مطلق مقادیر مقایسه شده.
عملگرهای مقایسه و منطقی 0 یا 1 را برمیگردانند، میتوانید ماسک کردن را با عبارات انجام دهید
مانند 'x * (ماسک > 0)'. برای همه عملگرهای منطقی، یک ورودی if true در نظر گرفته می شود
بیشتر از 0 است. عبارت '0 < x < 5' از نظر نحوی اشتباه نیست، اما
آن چیزی که مورد نظر است را انجام نمی دهد، زیرا از چپ به راست ارزیابی می شود، یعنی '((0
x) < 5)'، که همیشه 1 را برمی گرداند، همانطور که هر دو نتیجه ممکن مقایسه هستند
کمتر از 5. در صورت شناسایی عبارتی از این نوع، یک هشدار ایجاد می شود.
از چیزی مانند 'x > 0 && x < 5' برای به دست آوردن رفتار مورد نظر استفاده کنید.
فضای خالی بین عناصر نادیده گرفته می شود، ' sin ( 2 * x ) ' معادل است
'sin(2*x)'، اما 's in(2*x)' یک خطا است. ضرب ضمنی مجاز نیست،
عبارت '2x' به عنوان یک متغیر تجزیه خواهد شد. پرانتزها () هستند، استفاده نکنید
[] یا {}. توابع به پرانتز نیاز دارند، عبارت 'sin x' یک خطا است.
توابع زیر پشتیبانی می شوند:
sin: 1 آرگومان، سینوس برهان (واحدها رادیان هستند) cos: 1 آرگومان، the
کسینوس برهان (واحدها رادیان هستند) tan: 1 آرگومان، مماس از
آرگومان (واحدها رادیان هستند) asin: 1 آرگومان، معکوس سینوس برهان،
در رادیان acos: 1 آرگومان، معکوس کسینوس آرگومان، بر حسب رادیان
آتان: 1 آرگومان، معکوس مماس برهان، بر حسب رادیان atan2: 2
آرگومان ها، atan2(y, x) معکوس مماس را برمی گرداند
(y/x)، در رادیان، تعیین ربع با علامت هر دو استدلال
sinh: 1 آرگومان، سینوس هذلولی آرگومان cosh: 1 آرگومان، the
کسینوس هذلولی از آرگومان tanh: 1 آرگومان، مماس هذلولی از
آرگومان asinh: 1 آرگومان، سینوس هذلولی معکوس آرگومان acosh: 1
آرگومان، کسینوس هذلولی معکوس آرگومان atanh: 1 آرگومان، the
مماس معکوس هایپربولوک آرگومان ln: آرگومان 1، لگاریتم طبیعی
آرگومان exp: 1 آرگومان، ثابت e به قدرت آرگومان افزایش یافته است
log: 1 آرگومان، لگاریتم پایه 10 آرگومان sqrt: 1 آرگومان، مربع
ریشه آرگومان abs: 1 آرگومان، قدر مطلق آرگومان کف: 1
آرگومان، بزرگترین عدد صحیح بزرگتر از آرگومان دور: 1 آرگومان، the
نزدیکترین عدد صحیح، با پیوندهای گرد شده از
صفر
ceil: 1 آرگومان، کوچکترین عدد صحیح کمتر از آرگومان min: 2 آرگومان،
min(x, y) y را برمی گرداند اگر (x > y)، x در غیر این صورت max: 2 آرگومان، max(x, y) y را برمی گرداند
اگر (x < y)، x در غیر این صورت mod: 2 آرگومان، mod(x، y) = x - y * طبقه (x / y)، یا 0 اگر
y == 0 گیره: 3 آرگومان، گیره (x، کم، زیاد) = حداقل (حداکثر (x، کم)، زیاد)
-cifti-ادغام ادغام CIFTI TIMESERIES، SCALAR، یا فایل های برچسب
wb_command -cifti-ادغام
- خروجی - خروجی فایل cifti
[-cifti] - قابل تکرار - یک فایل cifti ورودی را مشخص کنید
- یک فایل cifti برای استفاده از ستون ها
[-column] - قابل تکرار - یک ستون را برای استفاده انتخاب کنید
- شاخص ستون (شروع از 1)
[-up-to] - از یک محدوده شامل ستون ها استفاده کنید
- نمایه آخرین ستونی که شامل می شود
[-reverse] - از محدوده به ترتیب معکوس استفاده کنید
فایلهای CIFTI ورودی که دارای نگاشتهای منطبق در امتداد ستونها و برای آنها هستند
نگاشت ها در امتداد ردیف ها از یک نوع هستند، همه یا سری، اسکالر یا برچسب، این
فرمان ستون های مشخص شده را به صورت افقی به هم متصل می کند (ردیف ها طولانی تر می شوند).
مثال: wb_command -cifti-ادغام out.dtseries.nii -چیفتی first.dtseries.nii ستون
1 -چیفتی second.dtseries.nii
این مثال ستون اول را از first.dtseries.nii و سپس همه را می گیرد
ستون ها را از second.dtseries.nii، و این ستون ها را در out.dtseries.nii بنویسید.
-cifti-ادغام-متراکم فایل های CIFTI را در امتداد ابعاد متراکم ادغام کنید
wb_command -cifti-ادغام-متراکم
- کدام بعد برای ادغام، ROW یا COLUMN - خروجی -
فایل cifti خروجی
[-cifti] - قابل تکرار - یک فایل cifti ورودی را مشخص کنید
- یک فایل cifti برای ادغام
فایلهای cifti ورودی باید دارای نگاشتهای منطبق در جهت نه باشند
مشخص شده است، و نقشه برداری در امتداد جهت مشخص شده باید مدل های مغز باشد.
-cifti-pairwise-conrelation ردیف های جفت شده بین دو فایل CIFTI را به هم مرتبط کنید
wb_command -cifti-pairwise-conrelation
- اولین ورودی فایل cifti - فایل cifti ورودی دوم
- خروجی - خروجی فایل cifti
[-fisher-z] - تبدیل فیشر کوچک z (یعنی artanh) را به همبستگی اعمال کنید
برای هر ردیف در ، آن را با همان ردیف در مرتبط کنید ، و قرار دهید
منجر به همان ردیف از ، که فقط یک ستون دارد.
-cifti-palette پالت را روی یک فایل CIFTI تنظیم کنید
wb_command -cifti-palette
- ورودی cifti - حالت نقشه برداری - خروجی -
خروجی فایل cifti
[-column] - یک ستون را برای نقشه های اسکالر انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-pos-percent] - درصد حداقل/حداکثر برای رنگ آمیزی داده های مثبت
- صدک برای حداقل داده های مثبت -
صدک برای مثبت ترین داده ها
[-نفی-درصد] - درصد حداقل/حداکثر برای رنگآمیزی دادههای منفی
- صدک برای کمترین داده های منفی -
صدک برای منفی ترین داده ها
[-pos-user] - مقادیر حداقل/حداکثر کاربر برای رنگ آمیزی داده های مثبت
- مقدار کمترین داده های مثبت - ارزش
برای مثبت ترین داده ها
[-neg-user] - مقادیر حداقل/حداکثر کاربر برای رنگآمیزی دادههای منفی
- مقدار کمترین داده منفی - ارزش
برای منفی ترین داده ها
[-interpolate] - رنگ ها را درون یابی می کند
- بولی، آیا درون یابی شود
[-disp-pos] - نمایش داده های مثبت
- بولی، آیا برای نمایش
[-disp-neg] - نمایش داده های مثبت
- بولی، آیا برای نمایش
[-disp-zero] - نمایش دادهها نزدیکتر به صفر از حداقل برش
- بولی، آیا برای نمایش
[-palette-name] - پالت مورد استفاده را تنظیم کنید
- نام پالت
[-thresholding] - آستانه را تنظیم کنید
- تنظیم آستانه - نمایش مقادیر داخل یا خارج از آستانه
- آستانه پایین تر - آستانه بالایی
توجه: فایل خروجی باید فایلی متفاوت از فایل ورودی باشد.
برای نقشه های اسکالر، به طور پیش فرض پالت برای هر نقشه تغییر می کند، مشخص کنید ستون
برای تغییر تنها یک نقشه تنظیمات پالت مشخص نشده از قسمت گرفته می شود
ستون اول برای نقشه های اسکالر، و از پالت فایل موجود برای نقشه های دیگر
انواع در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE
در استدلال به -palette-name باید یکی از موارد زیر باشد:
PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL نارنجی-زرد خاکستری_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG قرمز-زرد آبی-آبی روشن FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256
در استدلال به آستانه گذاری باید یکی از موارد زیر باشد:
THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL
در استدلال به آستانه گذاری باید یکی از موارد زیر باشد:
THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE
-cifti-parcel-mapping-to-label ایجاد DLABEL از فایل PARCELLATED
wb_command -cifti-parcel-mapping-to-label
- فایل بسته بندی شده ورودی - کدام بعد را در نظر بگیرید
نقشه بسته از، ROW یا COLUMN - یک فایل cifti با مورد دلخواه
نقشه برداری متراکم در امتداد
ستون
- خروجی - فایل برچسب متراکم خروجی
این دستور یک فایل dlabel را خروجی می دهد که برای انجام همان parcellation مفید است
یک فایل متراکم دیگر
برای ptseries، pscalar، plabel، pconn و pdconn، از ROW برای اراده
کار می کنند.
-cifti-parcellate بسته بندی یک فایل CIFTI
wb_command -cifti-parcellate
- فایل cifti برای بسته بندی - یک فایل برچسب cifti برای استفاده
برای بسته بندی - کدام نگاشت به قطعه بندی، ROW یا COLUMN
- خروجی - خروجی فایل cifti
هر برچسب در فایل برچسب cifti به عنوان یک بسته و همه ردیفها یا
ستونهای داخل بسته با هم میانگین میشوند تا سطر یا ستون خروجی را تشکیل دهند.
اگر ROW مشخص شده باشد، نگاشت ورودی در امتداد سطرها باید به صورت مغزی باشد، و
نگاشت خروجی در امتداد سطرها به صورت بسته خواهد بود، به این معنی که ستون ها میانگین می شوند
با یکدیگر. برای dtseries یا dscalar، از COLUMN استفاده کنید.
-cifti-کاهش عملیات کاهش را در امتداد ردیف های CIFTI انجام دهید
wb_command -cifti-کاهش
- فایل cifti برای کاهش - اپراتور کاهش برای استفاده
- خروجی - فایل cifti خروجی
[-exclude-outliers] - موارد پرت را از هر ردیف توسط استاندارد حذف کنید
انحراف - تعداد انحرافات استاندارد کمتر از میانگین به
شامل
- تعداد انحرافات استاندارد بالاتر از میانگین به
شامل
برای هر سطر cifti، داده ها را در امتداد یک ردیف به عنوان بردار می گیرد و آن را انجام می دهد
کاهش مشخص شده روی آن، قرار دادن نتیجه در ستون خروجی واحد در آن
ردیف اپراتورهای کاهش به شرح زیر است:
MAX: حداکثر مقدار MIN: حداقل مقدار INDEXMAX: شاخص مبتنی بر 1
حداکثر مقدار INDEXMIN: شاخص مبتنی بر 1 از حداقل مقدار SUM: همه مقادیر را اضافه کنید
محصول: همه مقادیر را ضرب کنید MEAN: میانگین داده STDEV: استاندارد
انحراف (مخرج N) SAMPSTDEV: نمونه انحراف استاندارد (N-1
مخرج) VARIANCE: واریانس داده ها MEDIAN: میانه داده ها
MODE: حالت داده COUNT_NONZERO: تعداد عناصر غیر صفر در
داده ها
-cifti-reorder مرتب سازی مجدد بسته ها یا نقشه های اسکالار/برچسب در یک فایل CIFTI
wb_command -cifti-reorder
- فایل cifti بسته بندی شده را وارد کنید - کدام بعد را دوباره مرتب کنید
در امتداد ROW یا COLUMN - یک فایل متنی حاوی سفارش مورد نظر
دگرگونی - خروجی - فایل cifti دوباره مرتب شده است
نقشه برداری در جهت مشخص شده باید بسته ها، اسکالرها یا برچسب ها باشد. برای
pscalar یا ptseries، از COLUMN برای مرتب کردن مجدد بسته ها استفاده کنید. برای dlabel، از ROW استفاده کنید. در
فایل باید شامل شاخص های مبتنی بر 1 باشد که با فضای خالی (فضاها،
خطوط جدید، برگهها، و غیره)، با تعداد شاخصها در امتداد مشخص شده است
بعد، ابعاد، اندازه. این شاخص ها مشخص می کنند که کدام شاخص فعلی باید به آن ختم شود
موقعیت، برای مثال، اگر ترتیب فعلی 'ABC D' باشد، و ترتیب مورد نظر است
'DAB C'، فایل متنی باید حاوی '4 1 2 3' باشد.
-cifti-replace-structure داده ها را در یک ساختار در یک فایل CIFTI جایگزین کنید
wb_command -cifti-replace-structure
- cifti برای اصلاح - کدام بعد را به عنوان الف تعبیر کنیم
تک نقشه، ROW یا COLUMN
[-volume-all] - جایگزینی داده ها در تمام اجزای حجم
- حجم ورودی
[-from-cropped] - ورودی به اندازه داده برش داده می شود
[-discard-unused-labels] - هنگام کار بر روی یک فایل dlabel، هر کدام را رها کنید
کلیدهای برچسب استفاده نشده از جدول برچسب
[-label] - قابل تکرار - جایگزینی داده ها در یک جزء برچسب سطحی
- ساختار جایگزین داده های - فایل برچسب ورودی
[-metric] - قابل تکرار - جایگزینی داده ها در یک جزء سطح
- ساختار جایگزین داده های - متریک ورودی
[-volume] - قابل تکرار - جایگزینی داده ها در یک جزء حجم
- ساختار جایگزین داده های - حجم ورودی
[-from-cropped] - ورودی به اندازه مولفه برش داده می شود
شما باید حداقل یکی از آنها را مشخص کنید متریک, -برچسب, -جلد، یا -حجم-همه برای این
دستور انجام هر کاری حجم های ورودی باید با خروجی مطابقت داشته باشند
-cifti-جدا کردن. برای dtseries/dscalar، از COLUMN استفاده کنید، و اگر ماتریس شما خواهد بود
کاملا متقارن، COLUMN کارآمدتر است. آرگومان ساختار باید یکی از آنها باشد
به شرح زیر است:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
-cifti-resample یک فایل CIFTI را به یک فضای CIFTI جدید دوباره نمونه کنید
wb_command -cifti-resample
- فایل cifti برای نمونه گیری مجدد - جهت ورودی
که باید دوباره نمونه برداری شود - یک فایل cifti حاوی فضای cifti
نمونه گیری مجدد به - جهت قالب برای استفاده به عنوان
فضای نمونه گیری مجدد
- یک روش نمونه برداری مجدد سطحی را مشخص کنید - الف را مشخص کنید
روش درونیابی حجمی - خروجی - فایل cifti خروجی
[-سطح-بزرگترین] - از بزرگترین وزن به جای میانگین وزنی استفاده کنید
انجام نمونه گیری مجدد سطح
[-volume-predilate] - قبل از نمونه گیری مجدد، اجزای حجم را گشاد کنید
- فاصله، بر حسب میلی متر، برای گشاد شدن
[-surface-postdilate] - بعد از نمونه برداری مجدد، اجزای سطح را گشاد کنید
- فاصله، بر حسب میلی متر، برای گشاد شدن
[-affine] - از تبدیل آفین در اجزای حجم استفاده کنید
- فایل affine برای استفاده
[-Flirt] - در صورتی که affine affine لاس زدن باشد، باید استفاده شود
- حجم منبع مورد استفاده در هنگام تولید affine
- حجم هدف مورد استفاده در هنگام تولید affine
[-warpfield] - از یک warpfield در اجزای حجم استفاده کنید
- میدان جنگی برای استفاده
[-fnirt] - در صورت استفاده از fnirt warpfield باید استفاده شود
- حجم منبع مورد استفاده در هنگام تولید
warpfield
[-left-sheres] - کره هایی را برای نمونه برداری مجدد سطح چپ مشخص کنید
- یک کره با مش همان سمت چپ فعلی
سطح
- یک کره با مش چپ جدید که در رجیستر است
با حوزه فعلی
[-left-area-surfs] - سطوح سمت چپ را برای انجام ناحیه راس مشخص کنید
اصلاح بر اساس - یک سطح آناتومیک چپ مربوطه با
جاری
مش
- یک سطح آناتومیک سمت چپ مرتبط با مش جدید
[-left-area-metrics] - معیارهای ناحیه راس چپ را برای انجام ناحیه مشخص کنید
اصلاح بر اساس - یک فایل متریک با نواحی راس برای
جاری
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش جدید
[-right-spheres] - کره هایی را برای نمونه برداری مجدد سطح سمت راست مشخص کنید
- یک کره با مش همان سمت راست فعلی
سطح
- یک کره با مش جدید سمت راست که در رجیستر است
با حوزه فعلی
[-right-area-surfs] - سطوح سمت راست را برای انجام ناحیه راس مشخص کنید
اصلاح بر اساس - یک سطح آناتومیک راست مربوطه با
جاری
مش
- یک سطح آناتومیک مناسب مربوطه با مش جدید
[-right-area-metrics] - معیارهای ناحیه راس سمت راست را برای انجام ناحیه مشخص کنید
اصلاح بر اساس - یک فایل متریک با نواحی راس برای
جاری
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش جدید
[-کره های مخچه] - کره هایی را برای نمونه برداری مجدد از سطح مخچه مشخص کنید
- یک کره با شبکه مشابه جریان
سطح مخچه
- یک کره با مش مخچه جدید که در آن قرار دارد
با حوزه فعلی ثبت نام کنید
[-cerebellum-area-surfs] - سطوح مخچه را برای انجام راس مشخص کنید
تصحیح ناحیه بر اساس - سطح آناتومیک مخچه مربوطه
با
مش فعلی
- یک سطح آناتومیک مخچه مربوط با مش جدید
[-متریک-مساحت-مخچه] - معیارهای ناحیه راس مخچه را مشخص کنید
انجام اصلاح ناحیه بر اساس - یک فایل متریک با نواحی راس برای
در حال حاضر
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش جدید
نمونهگیری مجدد دادههای cifti در یک فضای مغزی متفاوت.
استفاده از COLUMN برای
جهت نمونه گیری مجدد dscalar، dlabel، یا dtseries.
نمونه برداری مجدد از هر دو
ابعاد یک dconn نیاز به اجرای این دستور دو بار دارد، یک بار با COLUMN و
یک بار با ROW. اگر یک dconn را مجدداً نمونه برداری می کنید و دستگاه شما مقدار زیادی دارد
از حافظه، ممکن است در نظر داشته باشید که از آن استفاده کنید -cifti-resample-dconn-memory برای اجتناب از نوشتن
و بازخوانی یک فایل میانی. اگر کره ها برای یک سطح مشخص نشده باشند
ساختاری که در فایل های cifti وجود دارد، داده های آن بدون نمونه گیری مجدد یا کپی می شود
اتساع اتساع با روش "نزدیک ترین" انجام می شود و در آن انجام می شود
برای داده های سطحی اجزای حجمی قبل از اتساع لایهبندی میشوند تا اتساع شوند
به لبه جعبه محدود کننده مولفه نمی رسد.
روشهای نمونهگیری مجدد توصیهشده عبارتند از ADAP_BARY_AREA و CUBIC (مکعب اسپلاین)،
به جز داده های برچسب که باید از ADAP_BARY_AREA و ENCLOSING_VOXEL استفاده کنند.
در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR
در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC
-cifti-resample-dconn-memory از حافظه زیادی برای نمونه گیری مجدد DCONN استفاده کنید
wb_command -cifti-resample-dconn-memory
- فایل cifti برای نمونه گیری مجدد - یک فایل cifti حاوی
فضای cifti برای نمونه برداری مجدد - جهت قالب
برای استفاده به عنوان
فضای نمونه گیری مجدد
- یک روش نمونه برداری مجدد سطحی را مشخص کنید - الف را مشخص کنید
روش درونیابی حجمی - خروجی - فایل cifti خروجی
[-سطح-بزرگترین] - از بزرگترین وزن به جای میانگین وزنی استفاده کنید
انجام نمونه گیری مجدد سطح
[-volume-predilate] - قبل از نمونه گیری مجدد، اجزای حجم را گشاد کنید
- فاصله، بر حسب میلی متر، برای گشاد شدن
[-surface-postdilate] - بعد از نمونه برداری مجدد، اجزای سطح را گشاد کنید
- فاصله، بر حسب میلی متر، برای گشاد شدن
[-affine] - از تبدیل آفین در اجزای حجم استفاده کنید
- فایل affine برای استفاده
[-Flirt] - در صورتی که affine affine لاس زدن باشد، باید استفاده شود
- حجم منبع مورد استفاده در هنگام تولید affine
- حجم هدف مورد استفاده در هنگام تولید affine
[-warpfield] - از یک warpfield در اجزای حجم استفاده کنید
- میدان جنگی برای استفاده
[-fnirt] - در صورت استفاده از fnirt warpfield باید استفاده شود
- حجم منبع مورد استفاده در هنگام تولید
warpfield
[-left-sheres] - کره هایی را برای نمونه برداری مجدد سطح چپ مشخص کنید
- یک کره با مش همان سمت چپ فعلی
سطح
- یک کره با مش چپ جدید که در رجیستر است
با حوزه فعلی
[-left-area-surfs] - سطوح سمت چپ را برای انجام ناحیه راس مشخص کنید
اصلاح بر اساس - یک سطح آناتومیک چپ مربوطه با
جاری
مش
- یک سطح آناتومیک سمت چپ مرتبط با مش جدید
[-left-area-metrics] - معیارهای ناحیه راس چپ را برای انجام ناحیه مشخص کنید
اصلاح بر اساس - یک فایل متریک با نواحی راس برای
جاری
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش جدید
[-right-spheres] - کره هایی را برای نمونه برداری مجدد سطح سمت راست مشخص کنید
- یک کره با مش همان سمت راست فعلی
سطح
- یک کره با مش جدید سمت راست که در رجیستر است
با حوزه فعلی
[-right-area-surfs] - سطوح سمت راست را برای انجام ناحیه راس مشخص کنید
اصلاح بر اساس - یک سطح آناتومیک راست مربوطه با
جاری
مش
- یک سطح آناتومیک مناسب مربوطه با مش جدید
[-right-area-metrics] - معیارهای ناحیه راس سمت راست را برای انجام ناحیه مشخص کنید
اصلاح بر اساس - یک فایل متریک با نواحی راس برای
جاری
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش جدید
[-کره های مخچه] - کره هایی را برای نمونه برداری مجدد از سطح مخچه مشخص کنید
- یک کره با شبکه مشابه جریان
سطح مخچه
- یک کره با مش مخچه جدید که در آن قرار دارد
با حوزه فعلی ثبت نام کنید
[-cerebellum-area-surfs] - سطوح مخچه را برای انجام راس مشخص کنید
تصحیح ناحیه بر اساس - سطح آناتومیک مخچه مربوطه
با
مش فعلی
- یک سطح آناتومیک مخچه مربوط با مش جدید
[-متریک-مساحت-مخچه] - معیارهای ناحیه راس مخچه را مشخص کنید
انجام اصلاح ناحیه بر اساس - یک فایل متریک با نواحی راس برای
در حال حاضر
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش جدید
این دستور همان کار اجرا را انجام می دهد -cifti-resample دو بار، اما از حافظه استفاده می کند
تا تقریباً 2 برابر اندازه فایل میانی. این هست
زیرا dconn میانی به جای اینکه روی دیسک نوشته شود در حافظه نگهداری می شود و
اجزای قبل و بعد از نمونه برداری مجدد / اتساع باید در حافظه باشند
در همان زمان در طول محاسبات مربوطه. اگر کره ها برای a مشخص نشده باشند
ساختار سطحی که در فایل های cifti وجود دارد، داده های آن بدون کپی می شود
نمونه گیری مجدد یا اتساع اتساع با روش "نزدیک ترین" انجام می شود و در آن انجام می شود
برای داده های سطحی اجزای حجمی قبل از اتساع لایهبندی میشوند
این اتساع به لبه جعبه محدود کننده اجزا وارد نمی شود.
در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR
در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC
-cifti-restrict-dense-map BRAINORDINATES را از یک فایل CIFTI مستثنی کنید
wb_command -cifti-restrict-dense-map
- سیفتی ورودی - کدام بعد برای تغییر نقشه
روی، ROW یا COLUMN - خروجی - سیفتی خروجی
[-cifti-roi] - فایل cifti حاوی rois ترکیبی
- rois به عنوان یک فایل cifti
[-left-roi] - رئوس برای استفاده از نیمکره چپ
- roi سمت چپ به عنوان یک فایل متریک
[-right-roi] - رئوس برای استفاده از نیمکره راست
- roi مناسب به عنوان یک فایل متریک
[-cerebellum-roi] - رئوس برای استفاده از مخچه
- roi مخچه به عنوان یک فایل متریک
[-vol-roi] - وکسل برای استفاده
- فایل حجم roi
یک نسخه اصلاح شده می نویسد ، که در آن همه مغزها در خارج از
roi(های) مشخص شده از فایل حذف می شوند. اگر -cifti-roi مشخص شده است، دیگری وجود ندارد
گزینه -*-roi ممکن است مشخص شود. در صورت عدم استفاده -cifti-roi، هیچ گزینه -*-roi نیست
اگر در فایل ورودی موجود باشد، ساختار مربوطه را حذف می کند.
-cifti-roi-average ردیف های متوسط در یک فایل CIFTI
wb_command -cifti-roi-average
- فایل cifti به ردیف های متوسط از - خروجی فایل متنی از
مقادیر متوسط
[-cifti-roi] - فایل cifti حاوی rois ترکیبی
- rois به عنوان یک فایل cifti
[-left-roi] - رئوس برای استفاده از نیمکره چپ
- roi سمت چپ به عنوان یک فایل متریک
[-right-roi] - رئوس برای استفاده از نیمکره راست
- roi مناسب به عنوان یک فایل متریک
[-cerebellum-roi] - رئوس برای استفاده از مخچه
- roi مخچه به عنوان یک فایل متریک
[-vol-roi] - وکسل برای استفاده
- فایل حجم roi
ردیف هایی که در ROI مشخص شده هستند را میانگین بگیرید و نتیجه را بنویسید
ردیف متوسط به یک فایل متنی که با خطوط جدید جدا شده است. اگر -cifti-roi مشخص شده است،
چپ-روی, -راست-روی, -مخچه-رویو -ول-روی نباید مشخص شود
-cifti-rois-از-افراط نقشه های CIFTI ROI را از نقشه های EXTREMA ایجاد کنید
wb_command -cifti-rois-از-افراط
- سیفتی ورودی - حد فاصله ژئودزیکی از راس، بر حسب میلی متر
- حد فاصله اقلیدسی از مرکز وکسل، بر حسب میلی متر - کدام
بعد یک نقشه افراطی در امتداد ROW یا COLUMN است - خروجی - خروجی
سیفتی
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
[-gaussian] - به جای ROI های مسطح، هسته های گاوسی تولید می کند
- سیگما برای هسته گاوسی سطح، بر حسب میلی متر -
سیگما برای حجم هسته گاوسی، برحسب میلی متر
[-overlap-logic] - نحوه رسیدگی به ROIهای همپوشانی، پیش فرض ALLOW
- روش حل همپوشانی ها
[-merged-volume] - اجزای حجم را طوری رفتار کنید که انگار یک واحد هستند
جزء
برای هر مقدار غیر صفر در هر نقشه، یک نقشه با ROI در اطراف آن مکان ایجاد کنید.
اگر -گاوسی گزینه مشخص شده است، سپس هسته های گاوسی نرمال شده خروجی می شوند
به جای ROI. در استدلال به همپوشانی-منطق باید یکی از ALLOW باشد،
نزدیکترین، یا EXCLUDE. ALLOW پیشفرض است و به این معنی است که ROIها درمان میشوند
به طور مستقل و ممکن است همپوشانی داشته باشند. CLOSEST به این معنی است که ROI ممکن است همپوشانی نداشته باشد و این
هیچ ROI حاوی رئوس هایی است که به یک راس بذر متفاوت نزدیکتر هستند. EXCLUDE یعنی
که ROI ها ممکن است همپوشانی نداشته باشند و هر رأسی در محدوده بیش از یک ROI باشد
به هیچ ROI تعلق ندارد.
-cifti-جدا کردن یک ساختار CIFTI را به عنوان متریک، برچسب یا حجم بنویسید
wb_command -cifti-جدا کردن
- cifti برای جدا کردن یک جزء از - به کدام جهت
به اجزای ROW یا COLUMN تقسیم کنید
[-volume-all] - تمام ساختارهای حجم را در یک فایل حجمی جدا کنید
- خروجی - حجم خروجی
[-roi] - همچنین roi که وکسل ها دارای داده هستند را نیز خروجی می دهد
- خروجی - حجم خروجی roi
[-label] - خروجی یک فایل برچسب حجمی که محل آن را نشان می دهد
سازه های - خروجی - حجم خروجی برچسب
[-crop] - حجم برش به اندازه داده ها به جای استفاده از
اندازه حجم اصلی
[-label] - قابل تکرار - یک مدل سطح را به یک برچسب سطحی جدا کنید
فایل - ساختار به خروجی - خروجی - برچسب خروجی
پرونده
[-roi] - همچنین خروجی roi که رئوس آن دارای داده است
- خروجی - متریک خروجی roi
[-metric] - قابل تکرار - یک مدل سطح را به یک فایل متریک جدا کنید
- ساختار به خروجی - خروجی - متریک خروجی
[-roi] - همچنین خروجی roi که رئوس آن دارای داده است
- خروجی - متریک خروجی roi
[-volume] - قابل تکرار - یک ساختار حجم را به یک فایل حجمی جدا کنید
- ساختار به خروجی - خروجی - حجم خروجی
[-roi] - همچنین roi که وکسل ها دارای داده هستند را نیز خروجی می دهد
- خروجی - حجم خروجی roi
[-crop] - حجم برش به اندازه جزء به جای استفاده
اندازه حجم اصلی
برای dtseries، dscalar و dlabel، از COLUMN for استفاده کنید ، و اگر شما یک
dconn متقارن، COLUMN کارآمدتر است.
شما باید حداقل یکی از آنها را مشخص کنید متریک, -حجم-همه, -جلد، یا -برچسب برای این
دستور انجام هر کاری حجم های خروجی از نظر فضایی با نسخه اصلی خود مطابقت خواهند داشت
موقعیت ها، چه بریده شده باشند یا نه.
برای هر آرگومان، از یکی از رشته های زیر استفاده کنید:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
سیفتی صاف کننده یک فایل CIFTI را صاف کنید
wb_command سیفتی صاف کننده
- سیفتی ورودی - سیگما برای سطح گاوسی
صاف کننده هسته،
در میلی متر
- سیگما برای هسته صاف کننده حجم گاوسی، در
mm
- کدام بعد برای صاف کردن، ROW یا COLUMN - خروجی -
سیفتی خروجی
[-left-surface] - سطح سمت چپ را برای استفاده مشخص کنید
- فایل سطح سمت چپ
[-left-corrected-areas] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه
آنها را از سطح چپ - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-right-surface] - سطح مناسب برای استفاده را مشخص کنید
- فایل سطحی مناسب
[-right-corrected-areas] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه
آنها را از سطح سمت راست - نواحی راس اصلاح شده، به عنوان یک متریک
[-مخچه-سطح] - سطح مخچه را برای استفاده مشخص کنید
- پرونده سطح مخچه
[-مخچه-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای
محاسبه آنها از سطح مخچه - راس تصحیح شده
مناطق، به عنوان یک متریک
[-cifti-roi] - صاف فقط در مناطق مورد علاقه
- نواحی برای صاف کردن داخل، به عنوان فایل cifti
[-fix-zeros-volume] - مقادیر صفر در حجم را به عنوان داده های گمشده در نظر بگیرید
[-fix-zeros-surface] - مقادیر صفر روی سطح را گمشده در نظر بگیرید
داده ها
[-merged-volume] - صاف در سراسر مرزهای ساختار زیر قشری
فایل cifti ورودی باید دارای نگاشت مدل های مغز در بعد انتخابی باشد.
ستونها برای dtseries. و یا برای .dconn. به طور پیش فرض، داده ها در متفاوت است
سازه ها به طور مستقل هموار می شوند (یعنی هموارسازی "محدودیت بسته")، بنابراین
ساختارهای حجمی که لمس می شوند در سراسر این مرز صاف نمی شوند. مشخص كردن
-ادغام شده-حجم نادیده گرفتن این مرزها صاف کردن سطح با استفاده از
روش هموارسازی GEO_GAUSS_AREA.
گزینه های -*-corrected-areas برای زمانی در نظر گرفته شده اند که صاف کردن آن اجتناب ناپذیر است
سطوح متوسط گروه، تنها یک تصحیح تقریبی برای کاهش است
ساختار در یک سطح متوسط گروهی بهتر است داده ها را صاف کنید
افراد قبل از میانگین گیری، در صورت امکان.
La -تثبیت-صفر-* گزینه ها مقادیر صفر را به عنوان کمبود داده تلقی می کنند و استفاده نمی کنند
این مقدار هنگام تولید مقادیر هموار شده، اما صفرها را با آن پر می کند
مقادیر برون یابی شده ROI باید دارای نقشه مدل های مغز در امتداد ستون ها باشد،
دقیقا مطابق با نگاشت جهت انتخاب شده در فایل ورودی. داده ها
خارج از ROI نادیده گرفته می شود.
-cifti-stats آمار در امتداد ستون های CIFTI
wb_command -cifti-stats
- سیفتی ورودی
[-reduce] - از عملیات کاهش استفاده کنید
- عملیات کاهش
[-percentile] - مقدار را در صدک بدهید
- صدک برای پیدا کردن
[-column] - نمایش خروجی فقط برای یک ستون
- شاخص ستون (شروع از 1)
[-roi] - فقط داده های داخل یک roi را در نظر بگیرید
- roi، به عنوان یک فایل cifti
[-match-maps] - هر ستون ورودی از ستون مربوطه استفاده می کند
از فایل roi
[-show-map-name] - فهرست و نام ستون را قبل از هر خروجی چاپ کنید
برای هر ستون ورودی، یک عدد منفرد چاپ میشود که از
کاهش یا صدک مشخص شده. استفاده کنید ستون برای دادن خروجی فقط برای a
تک ستونی استفاده کنید -روی فقط داده های یک منطقه را در نظر بگیرید. دقیقا یکی از
-كاهش دادن or -درصد باید مشخص شود.
استدلال به -كاهش دادن گزینه باید یکی از موارد زیر باشد:
MAX: حداکثر مقدار MIN: حداقل مقدار INDEXMAX: شاخص مبتنی بر 1
حداکثر مقدار INDEXMIN: شاخص مبتنی بر 1 از حداقل مقدار SUM: همه مقادیر را اضافه کنید
محصول: همه مقادیر را ضرب کنید MEAN: میانگین داده STDEV: استاندارد
انحراف (مخرج N) SAMPSTDEV: نمونه انحراف استاندارد (N-1
مخرج) VARIANCE: واریانس داده ها MEDIAN: میانه داده ها
MODE: حالت داده COUNT_NONZERO: تعداد عناصر غیر صفر در
داده ها
-cifti-transpose انتقال یک فایل CIFTI
wb_command -cifti-transpose
- فایل cifti ورودی - خروجی - فایل cifti خروجی
[-mem-limit] - استفاده از حافظه را محدود کنید
- محدودیت حافظه در گیگابایت
ورودی باید یک فایل cifti 2 بعدی باشد.
خروجی یک فایل cifti است
که در آن هر سطر در ورودی یک ستون در خروجی است.
-cifti-بردار-عملیات یک عملیات برداری بر روی فایل های CIFTI انجام دهید
wb_command -cifti-بردار-عملیات
- اولین فایل ورودی وکتور - فایل ورودی وکتور دوم
- چه عملیات برداری انجام شود - خروجی - فایل خروجی
[-normalize-a] - بردارهای ورودی اول را عادی می کند
[-normalize-b] - بردارهای ورودی دوم را عادی می کند
[-normalize-output] - عادی سازی بردارهای خروجی (برای نقطه معتبر نیست
تولید - محصول)
[-magnitude] - خروجی بزرگی نتیجه (برای نقطه معتبر نیست
تولید - محصول)
روی دو فایل cifti (که باید مضربی از 3 داشته باشند) عملیات برداری انجام می دهد
ستون ها). هر یک از ورودی ها ممکن است چندین بردار (بیش از 3 ستون) داشته باشد.
اما نه هر دو (حداقل یکی باید دقیقاً 3 ستون داشته باشد). در -اندازه و
-Ormalize-output ممکن است گزینه ها با هم یا با عملیاتی که مشخص نشده باشد
یک اسکالر (محصول نقطه ای) را برمی گرداند. در پارامتر باید یکی از
زیر است:
نقطه متقاطع اضافه کردن تفریق
-cifti-weighted-stats آمار وزنی در امتداد ستون های CIFTI
wb_command -cifti-weighted-stats
- سیفتی ورودی
[-spatial-weights] - از ناحیه راس و حجم وکسل به عنوان وزن استفاده کنید
[-left-area-surf] - از یک سطح برای نواحی راس چپ استفاده کنید
- سطح سمت چپ برای استفاده
[-right-area-surf] - از یک سطح برای نواحی راس سمت راست استفاده کنید
- سطح مناسب برای استفاده
[-cerebellum-area-surf] - از یک سطح برای نواحی راس مخچه استفاده کنید
- سطح مخچه برای استفاده
[-left-area-metric] - از یک فایل متریک برای نواحی راس چپ استفاده کنید
- فایل متریک حاوی نواحی راس چپ
[-right-area-metric] - از یک فایل متریک برای نواحی راس سمت راست استفاده کنید
- فایل متریک حاوی نواحی راس سمت راست
[-cerebellum-area-metric] - از یک فایل متریک برای راس مخچه استفاده کنید
مناطق - فایل متریک حاوی راس مخچه
مناطق
[-cifti-weights] - از فایل cifti حاوی وزن استفاده کنید
- وزنه های مورد استفاده، به عنوان فایل cifti
[-column] - نمایش خروجی فقط برای یک ستون
- ستون مورد استفاده (بر اساس 1)
[-roi] - فقط داده های داخل یک roi را در نظر بگیرید
- roi، به عنوان یک فایل cifti
[-match-maps] - هر ستون ورودی از ستون مربوطه استفاده می کند
از فایل roi
[-mean] - میانگین وزنی را محاسبه کنید
[-stdev] - محاسبه انحراف استاندارد وزنی
[-sample] - برآورد جمعیت stdev از نمونه
[-percentile] - صدک وزنی را محاسبه کنید
- صدک برای پیدا کردن
[-sum] - جمع وزنی را محاسبه کنید
[-show-map-name] - فهرست و نام نقشه را قبل از هر خروجی چاپ کنید
اگر نقشه برداری در امتداد ستون مدل های مغزی باشد، برای هر ستون ورودی، مقدار
عملیات مشخص شده روی هر سطح و در تمام وکسل ها انجام می شود و نتایج حاصل می شود
جداگانه چاپ می شوند. برای سایر انواع نقشه برداری، عملیات روی هر کدام انجام می شود
ستون، و یک عدد در هر نقشه چاپ می شود. دقیقا یکی از -وزن های فضایی or
-سیفتی وزنه ها باید مشخص شود. استفاده کنید ستون برای دادن خروجی فقط برای یک واحد
ستون استفاده کنید -روی فقط داده های یک منطقه را در نظر بگیرید. دقیقا یکی از -منظور داشتن,
-stdev, -درصد or -جمع باید مشخص شود.
با استفاده از -جمع با -وزن های فضایی (یا با -سیفتی وزنه ها و یک سیفتی حاوی
اوزان به معنای مشابه) معادل ادغام با توجه به مساحت و
جلد.
-class-add-member
اعضا را به فایل های هدر (.h) و پیاده سازی (cxx.) کلاس اضافه کنید.
[-add-to-files] [-m ]...
اگر -افزودن به فایل ها مشخص نشده است، کد هدر و پیاده سازی
فایل ها در ترمینال چاپ می شوند.
اگر -افزودن به فایل ها مشخص شده است، انتظار می رود فایل های کلاس در قسمت باشند
دایرکتوری فعلی و نامگذاری شده است .h و .cxx. فایل هدر
باید این متن را در بخش خصوصی خود داشته باشد:
// ADD_NEW_MEMBERS_HERE
فایل پیاده سازی باید این متن را در بخش عمومی خود داشته باشد:
// ADD_NEW_METHODS_HERE
اگر یکی از این رشته های متنی وجود نداشته باشد، کدی که به آن اضافه می شود
فایل (ها) در ترمینال چاپ می شود.
برای هر عضو، سه رشته متنی که با فاصله از هم جدا شده اند باید ارائه شود و آنها
نام عضو نوع داده آن و شرحی از عضو است. اگر
توضیحات شامل فضاهایی است که توضیحات باید در دو گیومه ("") محصور شود.
اگر نوع داده با حرف بزرگ شروع شود، نام a فرض می شود
کلاس در این حالت هر دو گیرنده const و non-const ایجاد می شوند اما تنظیم کننده نیستند
خلق شده است. در غیر این صورت، انتظار می رود که نوع داده یک نوع اولیه باشد و هر دو a
گیرنده و ستر ایجاد می شود. توجه داشته باشید که ASTring و QString به عنوان رفتار می شوند
انواع ابتدایی
-کلاس ایجاد کنید
فایل های هدر کلاس (.h) و پیاده سازی (cxx.) ایجاد کنید.
استفاده:
[-کپی] [-event-class ] [-event-listener] [-no-parent] [-parent
]
OPTIONS
-کپی 🀄
سازنده کپی و عملگر انتساب را اضافه می کند
-کلاس رویداد
هنگام ایجاد یک زیر کلاس رویداد، با استفاده از این گزینه به طور خودکار تنظیم می شود
کلاس والد به Event و مقدار نوع رویداد شمارش شده را در آن قرار دهید
پارامتر سازنده کلاس Event.
برای نیازی به اضافه کردن آن با "EventTypeEnum::" نیست.
رویداد شنونده
EventListenerInterface را پیاده سازی کنید تا کلاس بتواند به رویدادها گوش دهد.
-بدون پدر و مادر
کلاس ایجاد شده از هیچ کلاس دیگری مشتق نشده است. به طور پیش فرض، کلاس والد است
CaretObject.
-والدین
کلاس والد (برگرفته از) را مشخص کنید. به طور پیش فرض، کلاس والد است
CaretObject.
-سنس
SceneableInterface را پیاده سازی کنید تا بتوان نمونه های کلاس را بازیابی کرد
از و در صحنه ها ذخیره شده است.
-صحنه-زیر کلاس
متدهایی را اضافه می کند که می توانند توسط سوپرکلاس فراخوانی شوند تا این کلاس فرعی بتواند ذخیره کند
و داده ها را به و از صحنه ها بازیابی کنید.
این گزینه فقط باید هنگام ایجاد کلاسی استفاده شود که کلاس فوق العاده آن را پیاده سازی می کند
Sceneable Interface
-کلاس-ایجاد-الگوریتم
فایل های هدر کلاس الگوریتم (.h) و پیاده سازی (cxx.) ایجاد کنید.
استفاده:
الگوریتم-کلاس-نام
نام مورد نیاز کلاس الگوریتم که باید با "الگوریتم" شروع شود
سوئیچ خط فرمان
سوئیچ خط فرمان مورد نیاز برای الگوریتم
توضیح کوتاه
شرح کوتاه مورد نیاز در دو نقل قول.
-class-create-enum
فایل های هدر نوع شمارش شده (.h) و پیاده سازی (cxx.) ایجاد کنید.
استفاده:
enum-class-name
نام نوع برشمرده شده.
باید به "Enum" ختم شود
تعداد مقادیر
تعداد مقادیر در نوع شمارش شده.
شماره خودکار
کدهای عدد صحیح مطابق با مقادیر برشمرده شده به صورت خودکار تولید می شوند.
مقدار این پارامتر "درست" و "نادرست" است.
[enum-name-1] [enum-name-2]...[enum-name-N]
نام های اختیاری برای مقادیر شمارش شده.
اگر تعداد نام های فهرست شده بیشتر از پارامتر "تعداد مقادیر" باشد،
"تعداد مقادیر" به تعداد نام ها تبدیل می شود. اگر تعداد اسامی است
کمتر از "تعداد مقادیر"، ورودی های خالی ایجاد خواهند شد.
-کلاس-ایجاد-عملیات
فایل های هدر کلاس عملیاتی (.h) و پیاده سازی (cxx.) ایجاد کنید.
استفاده:
[-بدون پارامتر]
عملیات-کلاس-نام
نام مورد نیاز کلاس عملیات که باید با "عملیات" شروع شود
سوئیچ خط فرمان
سوئیچ خط فرمان مورد نیاز برای عملیات
توضیح کوتاه
شرح کوتاه مورد نیاز در دو نقل قول.
-بدون پارامتر
اگر عملیات از پارامترها استفاده نمی کند، پارامتر اختیاری است.
-convert-afine تبدیل یک فایل AFFINE بین کنوانسیون ها
wb_command -convert-afine
[-from-world] - ورودی یک وابستگی 'جهانی' NIFTI است
- وابستگی ورودی
[-from-flirt] - ورودی یک ماتریس معاشقه است
- وابستگی ورودی - حجم منبع مورد استفاده در هنگام تولید
ورودی
اشتیاق
- حجم هدف مورد استفاده در هنگام تولید ورودی
اشتیاق
[-to-world] - خروجی را بهعنوان یک افین «جهان» NIFTI بنویسید
- خروجی - آفت خروجی
[-to-Flirt] - قابل تکرار - خروجی را به عنوان ماتریس لاس زدن بنویسید
- خروجی - آفت خروجی - حجمی که می خواهید
اعمال تبدیل به - فضای هدفی که می خواهید تبدیل شود
حجم به
همخوانی داشتن
ماتریس های جهان NIFTI را می توان مستقیماً روی مختصات میلی متری از طریق ماتریس استفاده کرد
ضرب، آنها از سیستم مختصات NIFTI استفاده می کنند، یعنی X مثبت درست است،
Y مثبت قدامی است و Z مثبت برتر است.
شما باید دقیقا یکی را مشخص کنید -از جانب گزینه، اما شما می توانید چند مورد را مشخص کنید -به
گزینه ها و هر کدام -به گزینه ای که حجم می گیرد ممکن است بیش از یک بار مشخص شود.
-تبدیل جهت گیری فیبر تبدیل حجم های پارامتر بینگهام به فایل جهت گیری فیبر
wb_command -تبدیل جهت گیری فیبر
- حجم برچسب های سازه cifti - خروجی - خروجی
فایل جهت گیری فیبر
[-fiber] - قابل تکرار - حجم پارامتر را برای یک فیبر مشخص کنید
- میانگین استحکام فیبر - انحراف استاندارد استحکام فیبر
- زاویه تتا - زاویه فی - زاویه psi - کا بینگهام
پارامتر - پارامتر kb bingham
پارامترهای بینگهام از پیش محاسبه شده را از فایل های حجمی می گیرد و آنها را به فایل تبدیل می کند
فرمت میز کار برای نمایش استفاده می کند. در آرگومان باید یک برچسب باشد
حجم، جایی که برچسب ها از این رشته ها استفاده می کنند:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
-convert-matrix4-to-matrix2 یک MATRIX2 CIFTI را از MATRIX4 WBSPARSE ایجاد می کند
wb_command -convert-matrix4-to-matrix2
- یک فایل wbsparse matrix4 - خروجی - کل
فیبر به عنوان یک فایل cifti به حساب می آید
[-فاصله] - فاصله مسیر متوسط خروجی
- خروجی - فواصل، به عنوان یک فایل cifti
این دستور یک فایل cifti از تعداد فیبر موجود در یک فایل wbsparse matrix4 می سازد.
و در صورت تمایل یک فایل cifti دوم از فواصل.
-convert-matrix4-to-workbench-sparse تبدیل یک ماتریس 3 فایلی به یک فایل پراکنده میز کار
wb_command -convert-matrix4-to-workbench-sparse
- اولین فایل matrix4 - فایل matrix1 دوم
- سومین فایل matrix4 - فایل .fiberTEMP.nii
این فایل مسیر اعمال می شود
به
- فهرست سه قلوهای شاخص وکسل ماده سفید همانطور که در
ماتریس مسیر
- خروجی - فایل پراکنده میز کار خروجی
[-surface-seeds] - فضای بذر سطحی را مشخص کنید
- فایل roi متریک تمام گره های مورد استفاده در فضای دانه
[-volume-seeds] - فضای بذر حجم را مشخص کنید
- فایل cifti برای استفاده از نگاشت حجم از -
بعد در امتداد فایل cifti برای گرفتن نقشه از آن،
ROW یا COLUMN
خروجی ماتریس 4 probtrackx را به فرمت فایل پراکنده میز کار تبدیل می کند.
دقیقا یکی از دانه های سطحی و - حجم دانه ها باید مشخص شود.
-convert-warpfield تبدیل وارپ فیلد بین کنوانسیون ها
wb_command -convert-warpfield
[-from-world] - ورودی یک میدان جنگی 'جهانی' NIFTI است
- میدان جنگ ورودی
[-from-fnirt] - ورودی یک میدان جنگی fnirt است
- میدان جنگ ورودی - حجم منبع مورد استفاده زمانی که
تولید ورودی
warpfield
[-to-world] - خروجی را به عنوان یک میدان جنگی «جهانی» NIFTI بنویسید
- خروجی - میدان جنگ خروجی
[-to-fnirt] - قابل تکرار - نوشتن خروجی به عنوان یک میدان جنگی لاس زدن
- خروجی - میدان جنگ خروجی - حجمی که می خواهید
اعمال warpfield به
میدانهای جنگ جهانی NIFTI را میتوان مستقیماً روی مختصات میلیمتری از طریق نمونهبرداری استفاده کرد
سه حجم فرعی در مختصات و افزودن مقادیر نمونه برداری شده به مختصات
بردار، آنها از سیستم مختصات NIFTI استفاده می کنند، یعنی X از چپ به راست، Y است
خلفی به قدامی، و Z پایین تر از برتر است.
توجه: این دستور warpfield را معکوس نمی کند و برای تاب برداشتن سطح باید
از معکوس میدان تاب استفاده کنید که حجم مربوطه را تاب می دهد.
شما باید دقیقا یکی را مشخص کنید -از جانب گزینه، اما شما می توانید چند مورد را مشخص کنید -به
گزینه ها و هر کدام -به گزینه ای که حجم می گیرد ممکن است بیش از یک بار مشخص شود.
-حجم-فاصله-امضا-ایجاد حجم علامت گذاری شده فاصله را از سطح ایجاد کنید
wb_command -حجم-فاصله-امضا-ایجاد
- سطح ورودی - یک حجم در فضای خروجی مورد نظر
(تاری، فاصله، مبدا) - خروجی - حجم خروجی
[-roi-out] - خروجی حجم roi از جایی که خروجی محاسبه شده است
مقدار - خروجی - حجم Roi خروجی
[-fill-value] - مقداری را برای قرار دادن در تمام وکسلهایی که دریافت نمیکنند مشخص کنید
فاصله تعیین کرد - مقدار برای پر کردن (پیش فرض 0)
[-exact-limit] - فاصله را برای خروجی دقیق مشخص کنید
- فاصله بر حسب میلی متر (پیش فرض 5)
[-approx-limit] - فاصله را برای خروجی تقریبی مشخص کنید
- فاصله بر حسب میلی متر (پیش فرض 20)
[-approx-neighborhood] - محله وکسل برای محاسبه تقریبی
- اندازه مکعب محله از مرکز به سمت دیگر، در
وکسل (پیشفرض 2 = 5x5x5)
[-winding] - روش سیم پیچی برای تست نقطه داخل سطح
- نام روش (پیشفرض EVEN_ODD)
تابع فاصله علامت دار سطح را محاسبه می کند.
فاصله دقیق است
با یافتن نزدیکترین نقطه در هر مثلث سطحی به مرکز محاسبه می شود
وکسل فاصله تقریبی با استفاده از این فاصله ها محاسبه می شود
روش dijkstra با همسایگی وکسل ها. مشخص کردن خیلی کوچک و دقیق
فاصله ممکن است نتایج غیر منتظره ای ایجاد کند. مشخص کننده های معتبر برای روش های سیم پیچی هستند
به شرح زیر است:
EVEN_ODD (پیشفرض) NEGATIVE NONZERO NORMALS
روش NORMALS از نرمال مثلث ها و یال ها یا نزدیک ترین مثلث استفاده می کند
برخورد پرتو از نقطه این روش ممکن است کمی سریعتر باشد، اما فقط همین است
قابل اعتماد برای یک سطح بسته که از خود عبور نمی کند. همه دیگر
روشها گذرهای ورودی (مثبت) و خروجی (منفی) یک پرتو عمودی را از آن شمارش میکنند
نقطه، سپس اگر مجموع فرد، منفی یا غیرصفر باشد، داخل حساب می شود،
بود.
تخمینی-فیبر-بینگهام تخمین توزیع جهت گیری فیبر از نمونه های BEDPOSTX
wb_command تخمینی-فیبر-بینگهام
- نمونه های مقاومت فیبر 1 - فیبر 1 تتا
نمونه ها - نمونه فیبر 1 فی - فیبر 1
نمونه های قدرت - نمونه فیبر 2 تتا -
نمونه فیبر 2 فیبر - نمونه های مقاومت الیاف 3
- نمونه فیبر 3 تتا - فیبر 3 فی
نمونه ها - حجم برچسب های سازه cifti - خروجی -
خروجی فایل توزیع کننده فیبر cifti
این دستور تخمینی از توزیع بینگهام برای هر فیبر انجام می دهد
جهت گیری در هر وکسل که یک شناسه ساختار برچسب گذاری شده است. این برچسب ها
آمده از آرگومان، که باید دارای برچسب هایی باشد که مطابق با
رشته های زیر:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
-محصولات فیبر نقطه محاسبات محصولات نقطه ای از جهت گیری فیبر با نرمال های سطحی
wb_command -محصولات فیبر نقطه
- سطح مرزی سفید/خاکستری - جهت گیری فیبر
فایل - حداکثر فاصله از هر گره سطحی یک فیبر
جمعیت ممکن است بر حسب میلی متر باشد
- آزمایش در برابر سطح برای اینکه آیا یک جمعیت فیبر باید یا خیر
استفاده شود
- خروجی - متریک محصولات نقطه ای - خروجی - یک متریک
از مقادیر f توزیع فیبر
برای هر رأس، این دستور نزدیکترین جمعیت فیبر را پیدا میکند
تست می کند و قدر مطلق حاصلضرب نقطه ای سطح را محاسبه می کند
نرمال و جهت میانگین نرمال شده هر فیبر. در تست باید
یکی از INSIDE، OUTSIDE یا ANY باشد که باعث می شود دستور فقط از فیبر استفاده کند
جمعیت هایی که در داخل سطح هستند، خارج از سطح، یا اهمیتی نمی دهند که کدام
جهت آن از سطح است. هر جمعیت فیبر در یک خروجی جداگانه است
ستون متریک
- تبدیل فایل تغییر نسخه فرمت فایل
wb_command - تبدیل فایل
[-border-version-convert] - یک فایل حاشیه با نسخه دیگری بنویسید
- فایل حاشیه ورودی - نسخه فرمت برای نوشتن به عنوان،
1 یا 3 (2 ندارد
وجود داشته باشد)
- خروجی - فایل حاشیه خروجی
[-surface] - اگر ورودی نسخه 1 باشد، باید مشخص شود
- از این فایل سطحی برای ساختار و تعداد استفاده کنید
رئوس، مرزهای ساختارهای دیگر را نادیده بگیرید
[-nifti-version-convert] - یک فایل nifti با نسخه متفاوت بنویسید
- فایل nifti ورودی - نسخه nifti برای نوشتن به عنوان -
خروجی - خروجی فایل nifti
[-cifti-version-convert] - یک فایل cifti با نسخه متفاوت بنویسید
- فایل cifti ورودی - نسخه cifti برای نوشتن به عنوان
- خروجی - فایل cifti خروجی
شما فقط می توانید یک گزینه سطح بالا را مشخص کنید.
- اطلاعات فایل فهرست اطلاعات در مورد محتوای یک فایل
wb_command - اطلاعات فایل
- فایل اطلاعات
[-no-map-info] - اطلاعات نقشه برای فایل هایی که از نقشه ها پشتیبانی می کنند نشان داده نمی شود
[-only-step-interval] - خروجی عادی را سرکوب کنید، فاصله را چاپ کنید
بین نقشه ها
[-only-number-of-maps] - خروجی عادی را متوقف کنید، تعداد نقشه ها را چاپ کنید
[-only-map-names] - خروجی عادی را متوقف کنید، نام همه نقشه ها را چاپ کنید
اطلاعات مربوط به محتوای یک فایل داده را فهرست کنید.
فقط یک -فقط انتخاب
ممکن است مشخص شود.
اطلاعات ذکر شده در زمانی که نه -فقط گزینه موجود است
بستگی به نوع فایل داده دارد.
-foci-get-projection-vertex دریافت راس پروجکشن برای کانون
wb_command -foci-get-projection-vertex
- فایل کانونی - سطح مربوط به فایل کانونی
- خروجی - فایل متریک خروجی
[-name] - فوکوس را با نام انتخاب کنید
- نام کانون
برای هر فوکوس، یک ستون در آن ایجاد می شود ، و راس با بیشترین
تأثیر بر طرح ریزی آن در آن ستون، با بقیه، مقدار 1 تخصیص داده می شود
رئوس 0. اگر -سیب زمینی شیرین استفاده می شود، تنها یک فوکوس استفاده خواهد شد.
-foci-list-coords مختصات کانون های خروجی در یک فایل متنی
wb_command -foci-list-coords
- فایل کانونی ورودی - خروجی - مختصات خروجی
فایل متنی
[-names-out] - خروجی نام کانون ها
- خروجی - فایل متنی برای قرار دادن نام کانون ها
خروجی مختصات برای هر فوکوس در فایل کانونی، و به صورت اختیاری فوکوس
نام ها در یک فایل متنی دوم
کانونی-نمونهگیری مجدد کانون های پروژه را در سطحی متفاوت قرار دهید
wb_command کانونی-نمونهگیری مجدد
- فایل کانونی ورودی - خروجی - فایل کانونی خروجی
[-left-sfaces] - سطوح سمت چپ برای نمونه برداری مجدد
- سطحی که کانون ها در حال حاضر روی آن برجسته می شوند -
سطحی برای پرتاب کردن کانون ها روی آن
[-right-surfaces] - سطوح مناسب برای نمونه برداری مجدد
- سطحی که کانون ها در حال حاضر روی آن برجسته می شوند -
سطحی برای پرتاب کردن کانون ها روی آن
[-مخچه-سطوح] - سطوح مخچه برای نمونه برداری مجدد
- سطحی که کانون ها در حال حاضر روی آن برجسته می شوند -
سطحی برای پرتاب کردن کانون ها روی آن
[-discard-distance-from-surface] - فاصله کانونی ها در بالا را نادیده بگیرید
یا زیر سطح فعلی
[-restore-xyz] - مختصات xyz اصلی را در کانون ها قرار دهید
نسبت به مختصات به دست آمده از unprojection
Unprojects کانون از برای ساختار، سپس آنها را به
. اگر فواصل معني دار در بالا يا پايين سطح كانون ها وجود دارد، از آن استفاده كنيد
سطوح آناتومیکی اگر کانون ها باید روی سطح باشند، از کره های ثبت شده استفاده کنید
و گزینه ها دور انداختن-فاصله-از-سطح و بازیابی-xyz.
-هدیه-همه-برچسب-به-رویس از همه برچسب ها در یک ستون هدیه درست کنید
wb_command -هدیه-همه-برچسب-به-رویس
- فایل برچسب هدیه ورودی - شماره یا نام نقشه برچسب
برای استفاده - خروجی - فایل متریک خروجی
فایل متریک خروجی دارای یک ستون برای هر برچسب در نقشه ورودی مشخص شده است،
غیر از ??? برچسب، که هر کدام حاوی ROI از تمام رئوس هستند
روی برچسب مربوطه تنظیم کنید.
-تبدیل هدیه فایل GIFTI را به کدگذاری های مختلف تبدیل کنید
استفاده:
هدیه رمزگذاری
رمزگذاری GIFTI مورد نیاز.
input-gifti-file
نام فایل GIFTI ورودی مورد نیاز.
خروجی-فایل هدیه
نام فایل GIFTI خروجی مورد نیاز.
رمزگذاری های معتبر GIFTI:
ASCII BASE64_BINARY GZIP_BASE64_BINARY EXTERNAL_FILE_BINARY
-gifti-label-add-prefix افزودن پیشوند به همه نام های برچسب در یک فایل برچسب هدیه
wb_command -gifti-label-add-prefix
- فایل برچسب ورودی - رشته پیشوند برای اضافه کردن -
خروجی - فایل برچسب خروجی
برای هر برچسبی غیر از «???»، پیشنویس کنید به نام برچسب
-هدیه-برچسب-به-روی یک برچسب هدیه را در یک معیار ROI بسازید
wb_command -هدیه-برچسب-به-روی
- فایل برچسب هدیه ورودی - خروجی - متریک خروجی
پرونده
[-name] - برچسب را با نام انتخاب کنید
- نام برچسبی که میخواهید یک روی از آن داشته باشید
[-key] - برچسب به کلید را انتخاب کنید
- کلید برچسبی که می خواهید از آن roi کنید
[-map] - یک نقشه برچسب واحد را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام نقشه
برای هر نقشه در ، یک نقشه در ایجاد می شود که در آن همه مکان ها
برچسب گذاری شده با یا با یک کلید از مقدار 1 داده می شود و
همه مکان های دیگر 0 داده شده است. دقیقا یکی از -سیب زمینی شیرین و -کی باید مشخص شود.
مشخص کردن -نقشه برای استفاده از تنها یک نقشه از .
-برچسب-گشاد کردن گشاد کردن یک فایل برچسب
wb_command -برچسب-گشاد کردن
- برچسب ورودی - سطحی که روی آن گشاد شود -
فاصله بر حسب میلی متر برای گشاد شدن برچسب ها - خروجی - فایل برچسب خروجی
[-bad-vertex-roi] - یک roi از رئوس را برای بازنویسی مشخص کنید.
رئوس با کلید بدون برچسب - فایل متریک، مقادیر مثبت نشان می دهد
رئوس داشتن
ارزش های آنها جایگزین شده است
[-column] - یک ستون را برای گشاد شدن انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
اطلاعات برچسب را برای همه رئوس تعیین شده به عنوان بد، تا میزان مشخص شده پر می کند
فاصله از برچسب های دیگر اگر -bad-vertex-roi مشخص شده است، تمام رئوس،
از جمله آنهایی که دارای کلید بدون برچسب هستند، به جز رئوس با a خوب هستند
ارزش مثبت در بازگشت سرمایه اگر مشخص نشده باشد، فقط رئوس با
کلید بدون برچسب بد هستند.
-برچسب-صادرات-جدول جدول برچسب صادراتی از GIFTI به عنوان متن
wb_command -برچسب-صادرات-جدول
- فایل برچسب ورودی - خروجی - فایل متنی خروجی
جدول برچسب را از فایل برچسب gifti می گیرد و در قالب متن می نویسد
مطابق با آنچه مورد انتظار است -metric-label-import.
-برچسب-ماسک ماسک یک فایل برچسب
wb_command -برچسب-ماسک
- فایل برچسب برای ماسک کردن - متریک ماسک - خروجی -
فایل برچسب خروجی
[-column] - یک ستون را انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
به طور پیش فرض، برچسب خروجی یک کپی از برچسب ورودی است، اما با "unused"
هر جا که متریک ماسک مثبت نیست برچسب بزنید. اگر ستون مشخص شده است،
خروجی فقط شامل یک ستون است، نسخه پوشانده شده از ستون ورودی مشخص شده.
-برچسب-ادغام فایل های برچسب را در یک فایل جدید ادغام کنید
wb_command -برچسب-ادغام
- خروجی - برچسب خروجی
[-label] - قابل تکرار - یک برچسب ورودی را مشخص کنید
- یک فایل برچسب برای استفاده از ستون ها
[-column] - قابل تکرار - یک ستون را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-up-to] - از یک محدوده شامل ستون ها استفاده کنید
- شماره یا نام آخرین ستونی که باید درج شود
[-reverse] - از محدوده به ترتیب معکوس استفاده کنید
یک یا چند فایل برچسب را می گیرد و با الحاق یک فایل برچسب جدید می سازد
ستون هایی از آنها فایل های ورودی باید دارای تعداد رئوس و یکسان باشند
همان ساختار
مثال: wb_command -برچسب-ادغام out.label.gii -برچسب first.label.gii ستون 1
-برچسب second.label.gii
این مثال ستون اول را از first.label.gii و همه زیرجلدها می گیرد
از second.label.gii، و اینها را در out.label.gii بنویسید.
-label-modify-keys مقادیر کلیدی را در یک فایل برچسب تغییر دهید
wb_command -label-modify-keys
- فایل برچسب ورودی - فایل متنی با کلید قدیمی و جدید
ارزش های - خروجی - فایل برچسب خروجی
[-column] - یک ستون را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
باید خطوطی به شکل "oldkey newkey" داشته باشد، مانند:
3 5 5 8 8 2
با این کار برچسب فعلی با کلید '3' تغییر می کند تا از کلید '5' به جای 5 استفاده شود
از 8 استفاده می شود و 8 از 2 استفاده می کند. هر برخوردی در مقادیر کلیدی منجر به برچسب می شود
که در فایل remap مشخص نشده بود که به فایلی که در غیر این صورت استفاده نشده بود، مجدداً نگاشت شود
کلید نگاشت مجدد بیش از یک کلید به همان کلید جدید یا همان کلید به بیش از
یک کلید جدید، منجر به خطا می شود. با این کار ظاهر فایل تغییر نمی کند
هنگامی که نمایش داده می شود، همزمان کلیدهای داده را تغییر می دهد.
-برچسب-نمونه مجدد یک فایل LABEL را به مش های مختلف تبدیل کنید
wb_command -برچسب-نمونه مجدد
- فایل برچسب برای نمونه گیری مجدد - یک سطح کره ای با
مش که فایل برچسب است
در حال حاضر روشن
- یک سطح کره ای که با آن ثبت شده است
و دارای مش خروجی مورد نظر می باشد
- نام روش - خروجی - فایل برچسب خروجی
[-area-surfs] - سطوحی را برای انجام اصلاح ناحیه راس بر اساس مشخص کنید
- یک سطح آناتومیک مربوطه با
مش
- یک سطح آناتومیک مربوطه با مش
[-area-metrics] - معیارهای ناحیه راس را برای انجام اصلاح ناحیه بر اساس مشخص کنید
بر - یک فایل متریک با نواحی راس برای
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش
[-current-roi] - از یک roi ورودی روی مش فعلی استفاده کنید تا غیر داده ها را حذف کنید
رگه ها - roi، به عنوان یک فایل متریک
[-valid-roi-out] - خروجی بازگشت سرمایه از رئوس هایی که داده ها را از معتبر دریافت کرده اند
رئوس منبع - خروجی - Roi خروجی به عنوان یک متریک
[-largest] - فقط از برچسب راس با بیشترین وزن استفاده کنید
با توجه به دو سطح کروی که در رجیستر هستند، یک فایل برچسب را دوباره نمونه می کند. اگر
روش اصلاح ناحیه را انجام می دهد، دقیقا یکی از -منطقه موج سواری or متریک مساحت باید
مشخص شده.
La -بزرگترین هنگامی که با BARYCENTRIC استفاده می شود، گزینه نزدیکترین رفتار راس را نشان می دهد.
از مقدار راس منبع که بیشترین وزن را دارد استفاده می کند. چه زمانی -بزرگترین
مشخص نشده است، وزن های راس بر اساس کدام برچسب جمع می شوند
مطابقت دارد و از برچسبی که بیشترین مقدار را دارد استفاده می شود.
در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC
روش ADAP_BARY_AREA برای داده های برچسب توصیه می شود، زیرا باید باشد
بهتر در حل رئوس نزدیک به چندین برچسب یا در صورت وجود
پایین نمونه گیری
-برچسب به مرز مرزها را در اطراف برچسب ها بکشید
wb_command -برچسب به مرز
- سطح مورد استفاده برای اطلاعات همسایه - ورودی
فایل برچسب - خروجی - فایل حاشیه خروجی
[-placement] - تعیین کنید تا چه اندازه در امتداد نقاط مرزی لبه کشیده شده است
- کسری در امتداد لبه از داخل راس (پیشفرض 0.33)
[-column] - یک ستون را انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
برای هر برچسب، تمام لبه های مش را که از مرز برچسب عبور می کنند، پیدا می کند.
و از طریق آنها مرزها را ترسیم می کند. به طور پیش فرض، این کار بر روی تمام ستون های موجود در
فایل ورودی، با استفاده از نام نقشه به عنوان نام کلاس برای حاشیه.
فراداده-حذف-منشا اطلاعات منشأ را از فراداده فایل حذف کنید
wb_command فراداده-حذف-منشا
- فایلی برای حذف اطلاعات منشأ از -
خروجی - نام ذخیره فایل اصلاح شده به عنوان
فیلدهای فراداده منشأ اضافه شده توسط Workbench در طول پردازش را حذف می کند.
-متادیتا-رشته-جایگزینی یک رشته را در تمام فراداده های یک فایل جایگزین کنید
wb_command -متادیتا-رشته-جایگزینی
- فایلی که جایگزین ابرداده می شود - رشته برای پیدا کردن
- رشته برای جایگزینی با - خروجی
- نام ذخیره فایل اصلاح شده به عنوان
[-case-insensitive] - مطابقت با تنوع حروف نیز
جایگزین همه موارد از در ابرداده و نام نقشه از
با .
-متریک-تبدیل تبدیل فایل متریک به NIFTI جعلی
wb_command -متریک-تبدیل
[-to-nifti] - متریک را به nifti تبدیل کنید
- متریک برای تبدیل - خروجی - خروجی فایل nifti
[-from-nifti] - تبدیل nifti به متریک
- فایل nifti برای تبدیل - فایل سطحی برای استفاده از تعداد
گره ها و ساختار از - خروجی - فایل متریک خروجی
هدف از این دستور تبدیل بین فایل های متریک و nifti1 است به طوری که
برنامه های gifti-unaware می توانند روی داده ها کار کنند. شما باید دقیقا یکی از آنها را مشخص کنید
گزینه ها
متریک-گشاد کردن یک فایل METRIC را گسترش دهید
wb_command متریک-گشاد کردن
- متریک برای گشاد شدن - سطح برای محاسبه -
فاصله بر حسب میلی متر برای گشاد شدن - خروجی - متریک خروجی
[-bad-vertex-roi] - یک roi از رئوس را برای بازنویسی مشخص کنید.
رئوس با مقدار صفر - فایل متریک، مقادیر مثبت نشان می دهد
رئوس داشتن
ارزش های آنها جایگزین شده است
[-data-roi] - یک roi از جایی که داده وجود دارد را مشخص کنید
- فایل متریک، مقادیر مثبت نشان دهنده رئوس هایی است که دارند
داده ها
[-column] - یک ستون را برای گشاد شدن انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-nearest] - از نزدیکترین مقدار خوب به جای میانگین وزنی استفاده کنید
[-خطی] - مقادیر را با درون یابی خطی در امتداد قویترین پر کنید
شیب
[-exponent] - از یک توان متفاوت در تابع وزن استفاده کنید
- توان 'n' برای استفاده در (مساحت / (فاصله ^ n)) به عنوان
تابع وزن دهی (پیش فرض 2)
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
برای همه رئوس متریک که به عنوان بد تعیین می شوند، اگر همسایه یک غیر بد باشند
راس با داده یا در فاصله مشخص شده از چنین رئوسی قرار دارند، آن را جایگزین کنید
مقدار با میانگین وزنی فاصله از رئوس غیر بد مجاور که داده دارند،
در غیر این صورت مقدار را صفر کنید. هر چقدر هم که کوچک باشد است، اتساع خواهد شد
همیشه حداقل از رئوس همسایه فوری استفاده کنید. اگر -نزدیک ترین مشخص شده است، آن
در عوض از مقدار نزدیکترین راس غیر بد با دادههای درون محدوده استفاده میکند
از میانگین وزنی
If -bad-vertex-roi مشخص شده است، فقط رئوس با مقدار مثبت در ROI هستند
بد اگر مشخص نشده باشد، فقط رئوس دارای داده، با مقدار صفر،
بد هستند اگر -data-roi مشخص نشده است، فرض می شود همه رئوس دارای داده هستند.
توجه داشته باشید که نواحی تصحیح شده گزینه از یک تصحیح تقریبی برای تغییر استفاده می کند
در فواصل در امتداد یک سطح متوسط گروهی.
-metric-estimate-fwhm یکنواختی FWHM یک فایل متریک را برآورد کنید
wb_command -metric-estimate-fwhm
- سطح مورد استفاده برای اطلاعات فاصله و همسایه -
متریک ورودی
[-roi] - فقط از دادههای درون ROI استفاده کنید
- فایل متریک برای استفاده به عنوان ROI
[-column] - یک ستون را برای تخمین صاف بودن انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
صافی ستون های متریک را تخمین می زند و تخمین ها را به صورت استاندارد چاپ می کند
خروجی این تخمینها تنوع در فاصله راس را نادیده میگیرند.
متریک-افراطی EXTREMA را در یک فایل METRIC پیدا کنید
wb_command متریک-افراطی
- سطح مورد استفاده برای اطلاعات فاصله - متریک به
افراطی از - حداقل فاصله بین منتهی الیه مشخص شده از
همان
نوع
- خروجی - متریک افراطی خروجی
[-presmooth] - قبل از یافتن اکسترم، متریک را صاف کنید
- سیگما برای هسته صاف کننده گاوسی، بر حسب میلی متر
[-roi] - مقادیر خارج از ناحیه انتخاب شده را نادیده بگیرید
- ناحیه ای برای یافتن افراط در آن، به عنوان یک متریک
[-آستانه] - افراطی کوچک را نادیده بگیرید
- بزرگترین مقداری که باید برای حداقل بودن در نظر گرفت - کوچکترین
مقدار برای حداکثر بودن در نظر گرفته شود
[-sum-columns] - به جای هر کدام، مجموع ستون های انتهایی را خروجی می دهد
ستون جداگانه
[-consolidate-mode] - از ادغام حداقل های محلی به جای a استفاده کنید
محله بزرگ
[-only-maxima] - فقط حداکثر را پیدا کنید
[-only-minima] - فقط حداقل را پیدا کنید
[-column] - یک ستون را برای پیدا کردن اکسترم انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
Extrema را در یک فایل متریک پیدا می کند، به گونه ای که هیچ دو Extrema از یک نوع وجود ندارد
در داخل از همدیگر. افراطی ها به عنوان برچسب گذاری می شوند -1 برای حداقل، 1 برای
حداکثر، 0 در غیر این صورت. اگر -فقط-حداکثر or -فقط-حداقل مشخص شده است، سپس خواهد شد
extrema که از نوع مشخص شده نیست را نادیده بگیرید. این گزینه ها متقابل هستند.
If -روی مشخص شده است، نه تنها از داده های خارج از roi استفاده نمی شود، بلکه هر رأسی روشن است
لبه ROI هرگز به عنوان افراطی محاسبه نمی شود، در صورتی که ROI کاهش یابد
در سراسر یک گرادیان، که در غیر این صورت، در جایی که باید وجود داشته باشد، اکستریم ایجاد می کند
هیچ کدام.
If -مجموع-ستون ها مشخص شده است، این ستون های انتهایی جمع شده و خروجی دارد
یک ستون با این نتیجه
بهطور پیشفرض، یک نقطه داده تنها در صورتی افراطی است که از هر نقطه دیگر افراطیتر باشد
نقطه داده که در داخل است از آن. اگر حالت - تحکیم استفاده می شود، آن
در عوض با یافتن تمام نقاط داده که شدیدتر از نقطه فوری آنها هستند شروع می شود
همسایگان، سپس در حالی که هر افراطی در داخل وجود دارد از یکدیگر، بگیرید
دو اکسترم نزدیک به هم و آنها را با میانگین وزنی در یکی ادغام کنید
بر اساس تعداد اکسترمای اصلی که در هر کدام ادغام شده اند.
بهطور پیشفرض، تمام ستونهای ورودی بدون هموارسازی استفاده میشوند ستون برای مشخص کردن الف
تک ستونی برای استفاده، و -پیش صاف کردن برای صاف کردن ورودی قبل از پیدا کردن
مفرط.
-متریک-کاذب-همبستگی همبستگی را به صورت محلی و در سراسر/از طریق SULCI/GYRI مقایسه کنید
wb_command -متریک-کاذب-همبستگی
- سطح برای محاسبه فاصله ژئودزیکی و سه بعدی -
متریک برای همبستگی <3D-dist> - حداکثر فاصله سه بعدی برای بررسی اطراف هر رأس
- حداکثر فاصله ژئودزیکی برای استفاده برای همسایگان
ارتباط
- حداقل فاصله ژئودزیکی برای استفاده برای همسایگان
ارتباط
- خروجی - متریک خروجی
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را انتخاب کنید که دارای داده است
- منطقه، به عنوان یک فایل متریک
[-dump-text] - مقادیر خام مورد استفاده در یک فایل متنی را تخلیه کنید
- فایل متنی خروجی
برای هر رأس، میانگین همبستگی را در محدوده ای از ژئودزیک محاسبه کنید
فواصلی که از یک شیار/شکنج عبور نمی کنند، و همبستگی با نزدیکترین آنها
راس از یک شیار/شکنج عبور می کند. یک راس برای عبور از یک شیار/شکنج در نظر گرفته می شود اگر
فاصله سه بعدی کمتر از یک سوم فاصله ژئودزیکی است. فایل خروجی
شامل نسبت بین این همبستگی ها و برخی نقشه های اضافی برای کمک است
نسبت را توضیح دهید
متریک پر کردن سوراخ سوراخ ها را در یک متریک ROI پر کنید
wb_command متریک پر کردن سوراخ
- سطح مورد استفاده برای اطلاعات همسایه - بازگشت سرمایه ورودی
متریک - خروجی - متریک ROI خروجی
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
تمام نواحی متصل که در ROI گنجانده نشده اند را پیدا می کند و آن ها را در آن می نویسد
همه آنها به جز بزرگترین، از نظر مساحت.
-متریک پیدا کردن خوشه ها خوشه های فیلتر بر اساس سطح سطح
wb_command -متریک پیدا کردن خوشه ها
- سطح برای محاسبه - متریک ورودی
- آستانه برای مقادیر داده - آستانه برای
مساحت خوشه، بر حسب mm^2 - خروجی - متریک خروجی
[-less-than] - مقادیر کمتر از ، به جای
بیشتر
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را انتخاب کنید
- roi، به عنوان یک متریک
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-column] - یک ستون را انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-size-ratio] - خوشه های کوچکتر از کسری معین را نادیده بگیرید
بزرگترین خوشه در نقشه - کسری از مساحت بزرگترین خوشه
[-فاصله] - خوشهها را دورتر از فاصله معینی نادیده بگیرید
بزرگترین خوشه - یک خوشه چقدر می تواند از بزرگترین خوشه دور باشد،
لبه
به لبه، در میلی متر
[-start] - شروع به برچسب زدن خوشه ها از مقداری غیر از 1 کنید
- مقداری که به اولین خوشه یافت شده داده می شود
یک متریک با اعداد صحیح غیرصفر برای همه رئوس در یک اندازه کافی بزرگ به دست میدهد
خوشه، و صفر در جاهای دیگر. اعداد صحیح نشان دهنده عضویت در خوشه هستند (به طور پیش فرض،
اولین خوشه یافت شده از مقدار 1، خوشه دوم 2 و غیره استفاده می کند. به طور پیش فرض، مقادیر
بزرگتر از در یک خوشه در نظر گرفته می شوند، استفاده کنید -کمتر از به
مقادیر کمتر از آستانه را آزمایش کنید. برای اعمال این به عنوان یک ماسک به داده ها، یا
برای انجام آستانه پیچیده تر، ببینید متریک-ریاضی.
- گرادیان متریک شیب سطحی یک فایل متریک
wb_command - گرادیان متریک
- سطح برای محاسبه گرادیان - متریک به
گرادیان را محاسبه کنید - خروجی - بزرگی گرادیان
[-presmooth] - قبل از محاسبه گرادیان، متریک را صاف کنید
- سیگما برای هسته صاف کننده گاوسی، بر حسب میلی متر
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را برای گرفتن گرادیان انتخاب کنید
- ناحیه ای که باید گرادیان درون آن را به عنوان یک متریک در نظر گرفت
[-match-columns] - برای هر ستون ورودی، از ستون مربوطه استفاده کنید
از روی
[-بردار] - بردارهای گرادیان خروجی
- خروجی - بردارها به عنوان یک فایل متریک
[-column] - یک ستون را برای محاسبه گرادیان انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-average-normals] - میانگین نرمال های هر راس با آن
همسایگان قبل از استفاده از آنها برای محاسبه گرادیان
در هر رأس، همسایگان بلافصل بر روی صفحه ای مماس بر روی باز می شوند
سطح در راس (به طور خاص، عمود بر حالت عادی). گرادیان است
با استفاده از رگرسیون بین موقعیتهای بازشده رئوس و
ارزش های آنها سپس گرادیان با شیب های رگرسیون و
به عنوان یک بردار گرادیان سه بعدی بازسازی شده است. به طور پیش فرض، گرادیان همه را می گیرد
ستون ها، بدون پیش صاف کردن، در سراسر سطح، بدون میانگین
نرمال های سطح در بین همسایگان
هنگام استفاده از نواحی تصحیح شده، توجه داشته باشید که یک تصحیح تقریبی است. در حال انجام
صاف کردن سطوح جداگانه قبل از میانگین / گرادیان ترجیح داده می شود
به منظور استفاده از ساختار سطح اصلی امکان پذیر است.
تعیین ROI، گرادیان را محدود می کند تا فقط از داده هایی که ROI هستند استفاده کند
متریک مثبت است و خروجی صفر در هر جایی که متریک ROI مثبت نیست.
به طور پیش فرض، اولین ستون از متریک roi برای تمام ستون های ورودی استفاده می شود. چه زمانی
-مطابقت-ستون ها مشخص شده است -روی گزینه، معیارهای ورودی و roi باید داشته باشند
همان تعداد ستون، و برای شاخص هر ستون ورودی، همان ستون
شاخص در متریک roi استفاده می شود. اگر -مطابقت-ستون ها گزینه ای برای -روی استفاده شده است
در حالی که ستون گزینه نیز استفاده می شود، تعداد ستون های متریک roi باید
متریک ورودی را مطابقت دهید، و از ستون roi با ایندکس استفاده میکند
ستون ورودی انتخاب شده
متریک خروجی برداری طوری سازماندهی شده است که اجزای X، Y و Z از a
ستون ورودی تک ستون های متوالی هستند.
-metric-label-import یک فایل برچسب هدیه را از یک فایل METRIC وارد کنید
wb_command -metric-label-import
- فایل متریک ورودی - فایل متنی حاوی مقادیر
و نام برای برچسب ها - خروجی - خروجی فایل برچسب هدیه
[-discard- Others] - مقادیری که در لیست برچسب ذکر نشده اند را روی مقدار تنظیم کنید
؟؟؟ برچسب
[-unlabeled-value] - مقداری را تنظیم کنید که به عنوان بدون برچسب تفسیر شود
- مقدار عددی بدون برچسب (پیشفرض 0)
[-column] - یک ستون را برای وارد کردن انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-drop-unused-labels] - مقادیر برچسب استفاده نشده را از برچسب حذف کنید
جدول
یک فایل برچسب gifti جدید از یک فایل متریک با مقادیر برچسب مانند ایجاد می کند. شما ممکن است
رشته خالی را مشخص کنید ('' روی لینوکس/مک کار خواهد کرد) برای ، که
طوری رفتار می شود که انگار یک فایل خالی است. فایل لیست برچسب باید دارای خطوط باشد
فرمت زیر:
کلید "unlabeled" را در فایل مشخص نکنید، فرض بر این است که 0 به معنای خیر است
برچسب زده شده مگر اینکه -unlabeled-value مشخص شده است. نام برچسب ها باید روی یک برچسب جداگانه باشد
خط، اما ممکن است حاوی فاصله یا سایر کاراکترهای غیرعادی باشد (اما نه خط جدید).
فضای خالی از هر دو انتهای نام برچسب بریده شده است، اما اگر در آن باشد، حفظ می شود
وسط یک برچسب مقادیر قرمز، سبز، آبی و آلفا باید از اعداد صحیح باشند
0 تا 255، و رنگی را که برچسب ترسیم شده است مشخص می کند (آلفای 255 به معنای
مات، که احتمالاً همان چیزی است که شما می خواهید). به طور پیش فرض، نام برچسب های جدیدی را تنظیم می کند
با نام LABEL_# برای هر مقداری که در لیست ذکر نشده است
فایل، مشخص کنید دور انداختن-دیگران به جای آن این وکسل ها را روی کلید "بدون برچسب" تنظیم کنید.
-ماسک متریک ماسک یک فایل متریک
wb_command -ماسک متریک
- متریک ورودی - متریک ماسک - خروجی -
متریک خروجی
[-column] - یک ستون را انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
به طور پیش فرض، متریک خروجی یک کپی از متریک ورودی است، اما با صفر
هر جا که متریک ماسک مثبت نباشد. اگر ستون مشخص شده است، خروجی
شامل تنها یک ستون، نسخه پوشانده شده از ستون ورودی مشخص شده است.
متریک-ریاضی ارزیابی بیان بر روی فایل های متریک
wb_command متریک-ریاضی
- عبارت برای ارزیابی، در نقل قول - خروجی -
متریک خروجی
[-fixnan] - نتایج NaN را با یک مقدار جایگزین کنید
- مقدار جایگزین NaN با
[-var] - قابل تکرار - معیاری برای استفاده به عنوان متغیر
- نام متغیر، همانطور که در عبارت استفاده می شود - متریک
فایل برای استفاده به عنوان این متغیر
[-column] - یک ستون را انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-repeat] - استفاده مجدد از یک ستون برای هر ستون محاسبه
این دستور ارزیابی می کند در هر رأس سطحی به طور مستقل. آنجا
باید حداقل یکی باشد -var گزینه (برای به دست آوردن ساختار، تعداد رئوس، و
تعداد ستون ها از)، حتی اگر مشخص شده در آن استفاده نشده است
. همه معیارها باید تعداد رئوس یکسانی داشته باشند. نام فایل ها هستند
معتبر نیست در ، از نام متغیر و a استفاده کنید -var گزینه با تطبیق
برای تعیین یک فایل ورودی اگر ستون به هر کدام گزینه داده می شود -var
گزینه، تنها یک ستون از آن فایل استفاده می شود. اگر -تکرار مشخص شده است، فایل
باید یا فقط یک ستون داشته باشد، یا آن را داشته باشد ستون گزینه مشخص شده است. تمام فایل های
که استفاده نمی کنند -تکرار باید همان تعداد ستون های درخواست شده برای استفاده را داشته باشد.
فرمت از به شرح زیر است:
عبارات شامل ثابت ها، متغیرها، عملگرها، پرانتزها و توابع هستند.
در نماد infix، مانند 'exp(-x + 3) * مقیاس'. متغیرها رشته هایی از هر کدام هستند
طول، با استفاده از کاراکترهای az، AZ، 0-9، و _، اما ممکن است نام یک
ثابت نامگذاری شده است. در حال حاضر، تنها یک ثابت به نام PI وجود دارد. اپراتورها
عبارتند از +، -، *، /، ^، >، <، >=، <=، ==، !=، !، &&، ||. اینها مانند C رفتار می کنند، به جز
که ^ توان است، یعنی pow(x, y) و اولویت بیشتری نسبت به سایرین دارد
عملگرهای باینری (همچنین، '-3^-4^-5' به معنای '-(3^(-(4^-5)))'). <=، >=، ==، و !=
به اپراتورها مقدار کمی از اتاق تکان دادن، برابر با یک میلیونیم داده می شود
کوچکتر از مقادیر مطلق مقادیر مقایسه شده.
عملگرهای مقایسه و منطقی 0 یا 1 را برمیگردانند، میتوانید ماسک کردن را با عبارات انجام دهید
مانند 'x * (ماسک > 0)'. برای همه عملگرهای منطقی، یک ورودی if true در نظر گرفته می شود
بیشتر از 0 است. عبارت '0 < x < 5' از نظر نحوی اشتباه نیست، اما
آن چیزی که مورد نظر است را انجام نمی دهد، زیرا از چپ به راست ارزیابی می شود، یعنی '((0
x) < 5)'، که همیشه 1 را برمی گرداند، همانطور که هر دو نتیجه ممکن مقایسه هستند
کمتر از 5. در صورت شناسایی عبارتی از این نوع، یک هشدار ایجاد می شود.
از چیزی مانند 'x > 0 && x < 5' برای به دست آوردن رفتار مورد نظر استفاده کنید.
فضای خالی بین عناصر نادیده گرفته می شود، ' sin ( 2 * x ) ' معادل است
'sin(2*x)'، اما 's in(2*x)' یک خطا است. ضرب ضمنی مجاز نیست،
عبارت '2x' به عنوان یک متغیر تجزیه خواهد شد. پرانتزها () هستند، استفاده نکنید
[] یا {}. توابع به پرانتز نیاز دارند، عبارت 'sin x' یک خطا است.
توابع زیر پشتیبانی می شوند:
sin: 1 آرگومان، سینوس برهان (واحدها رادیان هستند) cos: 1 آرگومان، the
کسینوس برهان (واحدها رادیان هستند) tan: 1 آرگومان، مماس از
آرگومان (واحدها رادیان هستند) asin: 1 آرگومان، معکوس سینوس برهان،
در رادیان acos: 1 آرگومان، معکوس کسینوس آرگومان، بر حسب رادیان
آتان: 1 آرگومان، معکوس مماس برهان، بر حسب رادیان atan2: 2
آرگومان ها، atan2(y, x) معکوس مماس را برمی گرداند
(y/x)، در رادیان، تعیین ربع با علامت هر دو استدلال
sinh: 1 آرگومان، سینوس هذلولی آرگومان cosh: 1 آرگومان، the
کسینوس هذلولی از آرگومان tanh: 1 آرگومان، مماس هذلولی از
آرگومان asinh: 1 آرگومان، سینوس هذلولی معکوس آرگومان acosh: 1
آرگومان، کسینوس هذلولی معکوس آرگومان atanh: 1 آرگومان، the
مماس معکوس هایپربولوک آرگومان ln: آرگومان 1، لگاریتم طبیعی
آرگومان exp: 1 آرگومان، ثابت e به قدرت آرگومان افزایش یافته است
log: 1 آرگومان، لگاریتم پایه 10 آرگومان sqrt: 1 آرگومان، مربع
ریشه آرگومان abs: 1 آرگومان، قدر مطلق آرگومان کف: 1
آرگومان، بزرگترین عدد صحیح بزرگتر از آرگومان دور: 1 آرگومان، the
نزدیکترین عدد صحیح، با پیوندهای گرد شده از
صفر
ceil: 1 آرگومان، کوچکترین عدد صحیح کمتر از آرگومان min: 2 آرگومان،
min(x, y) y را برمی گرداند اگر (x > y)، x در غیر این صورت max: 2 آرگومان، max(x, y) y را برمی گرداند
اگر (x < y)، x در غیر این صورت mod: 2 آرگومان، mod(x، y) = x - y * طبقه (x / y)، یا 0 اگر
y == 0 گیره: 3 آرگومان، گیره (x، کم، زیاد) = حداقل (حداکثر (x، کم)، زیاد)
متریک-ادغام فایل های متریک را در یک فایل جدید ادغام کنید
wb_command متریک-ادغام
- خروجی - متریک خروجی
[-metric] - قابل تکرار - یک متریک ورودی را مشخص کنید
- یک فایل متریک برای استفاده از ستون ها
[-column] - قابل تکرار - یک ستون را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-up-to] - از یک محدوده شامل ستون ها استفاده کنید
- شماره یا نام آخرین ستونی که باید درج شود
[-reverse] - از محدوده به ترتیب معکوس استفاده کنید
یک یا چند فایل متریک را می گیرد و با الحاق یک فایل متریک جدید می سازد
ستون هایی از آنها فایل های متریک ورودی باید تعداد رئوس یکسانی داشته باشند
و همان ساختار
مثال: wb_command متریک-ادغام out.func.gii متریک first.func.gii ستون 1
متریک second.func.gii
این مثال ستون اول را از first.func.gii و سپس همه را می گیرد
ستون ها را از second.func.gii، و این ستون ها را در out.func.gii بنویسید.
پالت متریک پالت یک فایل متریک را تنظیم کنید
wb_command پالت متریک
- معیار برای اصلاح - حالت نقشه برداری
[-column] - یک ستون را انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-pos-percent] - درصد حداقل/حداکثر برای رنگ آمیزی داده های مثبت
- صدک برای حداقل داده های مثبت -
صدک برای مثبت ترین داده ها
[-نفی-درصد] - درصد حداقل/حداکثر برای رنگآمیزی دادههای منفی
- صدک برای کمترین داده های منفی -
صدک برای منفی ترین داده ها
[-pos-user] - مقادیر حداقل/حداکثر کاربر برای رنگ آمیزی داده های مثبت
- مقدار کمترین داده های مثبت - ارزش
برای مثبت ترین داده ها
[-neg-user] - مقادیر حداقل/حداکثر کاربر برای رنگآمیزی دادههای منفی
- مقدار کمترین داده منفی - ارزش
برای منفی ترین داده ها
[-interpolate] - رنگ ها را درون یابی می کند
- بولی، آیا درون یابی شود
[-disp-pos] - نمایش داده های مثبت
- بولی، آیا برای نمایش
[-disp-neg] - نمایش داده های مثبت
- بولی، آیا برای نمایش
[-disp-zero] - نمایش دادهها نزدیکتر به صفر از حداقل برش
- بولی، آیا برای نمایش
[-palette-name] - پالت مورد استفاده را تنظیم کنید
- نام پالت
[-thresholding] - آستانه را تنظیم کنید
- تنظیم آستانه - نمایش مقادیر داخل یا خارج از آستانه
- آستانه پایین تر - آستانه بالایی
فایل متریک اصلی با نسخه اصلاح شده بازنویسی شده است.
By
به طور پیش فرض، تمام ستون های فایل متریک با تنظیمات جدید تنظیم می شوند، از
ستون گزینه ای برای تغییر تنها یک ستون. تنظیمات نقشه برداری مشخص نشده است
گزینه ها از ستون اول گرفته می شوند. در استدلال باید یکی از
به شرح زیر است:
MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE
در استدلال به -palette-name باید یکی از موارد زیر باشد:
PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL نارنجی-زرد خاکستری_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG قرمز-زرد آبی-آبی روشن FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256
در استدلال به آستانه گذاری باید یکی از موارد زیر باشد:
THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL
در استدلال به آستانه گذاری باید یکی از موارد زیر باشد:
THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE
متریک-کاهش انجام عملیات کاهش در میان ستون های متریک
wb_command متریک-کاهش
- متریک برای کاهش - اپراتور کاهش برای استفاده
- خروجی - متریک خروجی
[-exclude-outliers] - بر اساس استاندارد، مقادیر پرت را از هر بردار حذف کنید
انحراف - تعداد انحرافات استاندارد کمتر از میانگین به
شامل
- تعداد انحرافات استاندارد بالاتر از میانگین به
شامل
برای هر رأس سطحی، داده ها را در ستون ها به صورت بردار می گیرد و اجرا می کند
کاهش مشخص شده روی آن، قرار دادن نتیجه در ستون خروجی واحد در
آن راس اپراتورهای کاهش به شرح زیر است:
MAX: حداکثر مقدار MIN: حداقل مقدار INDEXMAX: شاخص مبتنی بر 1
حداکثر مقدار INDEXMIN: شاخص مبتنی بر 1 از حداقل مقدار SUM: همه مقادیر را اضافه کنید
محصول: همه مقادیر را ضرب کنید MEAN: میانگین داده STDEV: استاندارد
انحراف (مخرج N) SAMPSTDEV: نمونه انحراف استاندارد (N-1
مخرج) VARIANCE: واریانس داده ها MEDIAN: میانه داده ها
MODE: حالت داده COUNT_NONZERO: تعداد عناصر غیر صفر در
داده ها
متریک-رگرسیون معیارها را از یک فایل متریک خارج کنید
wb_command متریک-رگرسیون
- معیاری که باید از آن پس رفت - خروجی - متریک خروجی
[-roi] - فقط در داخل یک roi پسرفت می کند
- ناحیه مورد استفاده برای رگرسیون، به عنوان یک متریک
[-column] - یک ستون را برای پسرفت انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-remove] - قابل تکرار - معیاری را برای پسرفت مشخص کنید
- فایل متریک برای استفاده
[-remove-column] - به جای همه، یک ستون را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-keep] - قابل تکرار - معیاری را برای گنجاندن در رگرسیون مشخص کنید، اما نه
برداشتن - فایل متریک برای استفاده
[-keep-column] - به جای همه، یک ستون را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
برای هر رگرسیون، میانگین آن در سراسر سطح از داده های آن کم می شود. هر یک
سپس نقشه ورودی در برابر اینها و یک عبارت ثابت پسرفت می شود. نتیجه
شیب های پسرفته همه رگرسیورهای مشخص شده با -برداشتن با آنها ضرب می شوند
نقشه های رگرسیور مربوطه، و اینها از نقشه ورودی کم می شوند.
-متریک-حذف-جزایر جزایر را از شاخص بازگشت سرمایه حذف کنید
wb_command -متریک-حذف-جزایر
- سطح مورد استفاده برای اطلاعات همسایه - بازگشت سرمایه ورودی
متریک - خروجی - متریک ROI خروجی
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
تمام نواحی متصل را در ROI پیدا میکند و همه مناطق به جز بزرگترین آنها را صفر میکند
شرایط سطح
-متریک-نمونه مجدد یک فایل METRIC را به مش های مختلف تبدیل کنید
wb_command -متریک-نمونه مجدد
- فایل متریک برای نمونه گیری مجدد - یک سطح کره ای با
مش که متریک است
در حال حاضر روشن
- یک سطح کره ای که با آن ثبت شده است
و دارای مش خروجی مورد نظر می باشد
- نام روش - خروجی - متریک خروجی
[-area-surfs] - سطوحی را برای انجام اصلاح ناحیه راس بر اساس مشخص کنید
- یک سطح آناتومیک مربوطه با
مش
- یک سطح آناتومیک مربوطه با مش
[-area-metrics] - معیارهای ناحیه راس را برای انجام اصلاح ناحیه بر اساس مشخص کنید
بر - یک فایل متریک با نواحی راس برای
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش
[-current-roi] - از یک roi ورودی روی مش فعلی استفاده کنید تا غیر داده ها را حذف کنید
رگه ها - roi، به عنوان یک فایل متریک
[-valid-roi-out] - خروجی بازگشت سرمایه از رئوس هایی که داده ها را از معتبر دریافت کرده اند
رئوس منبع - خروجی - Roi خروجی به عنوان یک متریک
[-largest] - فقط از مقدار راس با بیشترین وزن استفاده کنید
با توجه به دو سطح کروی که در رجیستر هستند، یک فایل متریک را دوباره نمونه می کند. اگر
روش اصلاح ناحیه را انجام می دهد، دقیقا یکی از -منطقه موج سواری or متریک مساحت باید
مشخص شده.
La -current-roi گزینه فقط ورودی را می پوشاند، خروجی ممکن است کمی گشاد شود
مقایسه، استفاده را در نظر بگیرید -ماسک متریک روی خروجی هنگام استفاده -current-roi.
La -بزرگترین هنگامی که با BARYCENTRIC استفاده می شود، گزینه نزدیکترین رفتار راس را نشان می دهد.
به جای انجام میانگین وزنی، از مقدار راس منبع استفاده می کند که
بیشترین وزن را برای هر رأس هدف دارد. این عمدتا برای در نظر گرفته شده است
نمونه برداری مجدد از معیارهای ROI
در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC
روش ADAP_BARY_AREA برای دادههای متریک معمولی توصیه میشود، زیرا
برخلاف BARYCENTRIC، باید از تمام داده ها در حین پایین نمونه گیری استفاده کند.
متریک-رویس-از-افراط از نقشه های EXTREMA، نقشه های بازگشت سرمایه متریک را ایجاد کنید
wb_command متریک-رویس-از-افراط
- سطح مورد استفاده برای فاصله ژئودزیکی - متریک ورودی
فایل - حد فاصله ژئودزیکی از راس، بر حسب میلی متر - خروجی -
فایل متریک خروجی
[-gaussian] - به جای ROI مسطح، یک هسته گاوسی تولید کنید
- سیگما برای هسته گاوسی، بر حسب میلی متر
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را برای استفاده انتخاب کنید
- منطقه مورد استفاده، به عنوان یک متریک
[-overlap-logic] - نحوه رسیدگی به ROIهای همپوشانی، پیش فرض ALLOW
- روش حل همپوشانی ها
[-column] - یک ستون ورودی واحد را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
برای هر مقدار غیر صفر در هر نقشه، یک نقشه با ROI در اطراف آن مکان ایجاد کنید.
اگر -گاوسی گزینه مشخص شده است، سپس هسته های گاوسی نرمال شده خروجی می شوند
به جای ROI. در استدلال به همپوشانی-منطق باید یکی از ALLOW باشد،
نزدیکترین، یا EXCLUDE. ALLOW پیشفرض است و به این معنی است که ROIها درمان میشوند
به طور مستقل و ممکن است همپوشانی داشته باشند. CLOSEST به این معنی است که ROI ممکن است همپوشانی نداشته باشد و این
هیچ ROI حاوی رئوس هایی است که به یک راس بذر متفاوت نزدیکتر هستند. EXCLUDE یعنی
که ROI ها ممکن است همپوشانی نداشته باشند و هر رأسی در محدوده بیش از یک ROI باشد
به هیچ ROI تعلق ندارد.
متریک-rois-to-border مرزها را در اطراف METRIC ROIS بکشید
wb_command متریک-rois-to-border
- سطح مورد استفاده برای اطلاعات همسایه - متریک ورودی
حاوی ROI - نامی که برای کلاس مرزهای خروجی استفاده می شود
- خروجی - فایل حاشیه خروجی
[-placement] - تعیین کنید تا چه اندازه در امتداد نقاط مرزی لبه کشیده شده است
- کسری در امتداد لبه از داخل راس (پیشفرض 0.33)
[-column] - یک ستون را انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
برای هر ستون ROI، تمام لبههای مش را که از مرز آن عبور میکنند، پیدا میکند
ROI، و مرزها را از طریق آنها ترسیم می کند. به طور پیش فرض، این کار در تمام ستون های موجود انجام می شود
فایل ورودی، با استفاده از نام نقشه به عنوان نام مرز.
متریک-صاف کردن یک فایل متریک را صاف کنید
wb_command متریک-صاف کردن
- سطح برای صاف کردن - متریک برای صاف کردن
- سیگما برای تابع هسته گاوسی، بر حسب میلی متر
- خروجی - متریک خروجی
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را برای صاف کردن انتخاب کنید
- Roi برای صاف کردن درون، به عنوان یک متریک
[-match-columns] - برای هر ستون ورودی، از ستون مربوطه استفاده کنید
از روی
[-fix-zeros] - مقادیر صفر را به عنوان داده ای در نظر نمی گیرند
[-column] - یک ستون را برای صاف کردن انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
[-method] - روش هموارسازی، پیشفرض GEO_GAUSS_AREA را انتخاب کنید
- نام روش صاف کردن
یک فایل متریک را روی یک سطح صاف کنید.
به طور پیش فرض، تمام ستون های ورودی را صاف می کند
در کل سطح، مشخص کنید ستون برای استفاده از تنها یک ستون ورودی، و -روی به
صاف فقط در جاهایی که متریک roi بزرگتر از 0 است، خروجی صفر در جاهای دیگر.
هنگام استفاده از -روی، داده های ورودی خارج از ROI برای محاسبه هموار استفاده نمی شود
ارزش های. به طور پیش فرض، اولین ستون متریک roi برای همه ورودی ها استفاده می شود
ستون ها. چه زمانی -مطابقت-ستون ها مشخص شده است -روی گزینه، ورودی و roi
معیارها باید تعداد ستون های یکسانی داشته باشند و برای هر شاخص ستون ورودی،
همان شاخص ستون در متریک roi استفاده می شود. اگر -مطابقت-ستون ها گزینه ای برای
-روی استفاده می شود در حالی که ستون گزینه نیز استفاده می شود، تعداد ستون ها باید
بین متریک roi و ورودی مطابقت دارد و از ستون roi با
نمایه ستون ورودی انتخاب شده
La -تثبیت صفرها گزینه باعث می شود که هموارسازی از یک مقدار ورودی در صورت صفر استفاده نکند،
اما همچنان یک مقدار هموار شده روی راس بنویسید. این برای صفرهایی که مفید است
نشان دهنده کمبود اطلاعات است که مانع از کاهش شدت آن می شود
رئوس نزدیک، در حالی که به صفر یک مقدار برون یابی می دهد.
La نواحی تصحیح شده گزینه برای زمانی در نظر گرفته شده است که صاف کردن آن اجتناب ناپذیر است
سطح متوسط گروه، فقط یک تصحیح تقریبی برای کاهش است
ساختار در یک سطح متوسط گروهی بهتر است داده ها را صاف کنید
افراد قبل از میانگین گیری، در صورت امکان.
مقادیر معتبر برای هستند:
GEO_GAUSS_AREA - از یک هسته گاوسی ژئودزیکی استفاده می کند و بر اساس راس نرمال می شود.
منطقه به منظور کار با اطمینان بیشتر بر روی سطوح نامنظم
GEO_GAUSS_EQUAL - از یک هسته گاوسی ژئودزیکی استفاده می کند و با فرض هر یک نرمال می شود
رأس اهمیت یکسانی دارد
GEO_GAUSS - هموارسازی گاوسی ژئودزیکی از caret5 را مطابقت دارد، اما بررسی نمی کند
هسته برای داشتن اهمیت نابرابر
روش GEO_GAUSS_AREA پیش فرض است زیرا معمولاً انتخاب صحیحی است.
وقتی مجموع مقادیر راس بیشتر باشد GEO_GAUSS_EQUAL ممکن است انتخاب صحیحی باشد
معنی دار است سپس انتگرال سطحی (مجموع مقادیر .* مساحت ها)، به عنوان مثال وقتی
صاف کردن نواحی راس (مجموع کل سطح است، در حالی که سطح است
انتگرال مجموع مربعات نواحی راس است). روش GEO_GAUSS نیست
توصیه می شود، عمدتاً برای تکرار روش های مطالعات انجام شده با caret5 وجود دارد
هموارسازی ژئودزیکی
آمارهای متریک آمار مکانی روی یک فایل متریک
wb_command آمارهای متریک
- متریک ورودی
[-reduce] - از عملیات کاهش استفاده کنید
- عملیات کاهش
[-percentile] - مقدار را در صدک بدهید
- صدک برای پیدا کردن
[-column] - نمایش خروجی فقط برای یک ستون
- شماره یا نام ستون
[-roi] - فقط داده های داخل یک roi را در نظر بگیرید
- roi، به عنوان یک فایل متریک
[-match-maps] - هر ستون ورودی از ستون مربوطه استفاده می کند
از فایل roi
[-show-map-name] - فهرست و نام نقشه را قبل از هر خروجی چاپ کنید
برای هر ستون ورودی، یک عدد منفرد چاپ میشود که از
کاهش یا صدک مشخص شده. استفاده کنید ستون برای دادن خروجی فقط برای a
تک ستونی استفاده کنید -روی فقط داده های یک منطقه را در نظر بگیرید. دقیقا یکی از
-كاهش دادن or -درصد باید مشخص شود.
استدلال به -كاهش دادن گزینه باید یکی از موارد زیر باشد:
MAX: حداکثر مقدار MIN: حداقل مقدار INDEXMAX: شاخص مبتنی بر 1
حداکثر مقدار INDEXMIN: شاخص مبتنی بر 1 از حداقل مقدار SUM: همه مقادیر را اضافه کنید
محصول: همه مقادیر را ضرب کنید MEAN: میانگین داده STDEV: استاندارد
انحراف (مخرج N) SAMPSTDEV: نمونه انحراف استاندارد (N-1
مخرج) VARIANCE: واریانس داده ها MEDIAN: میانه داده ها
MODE: حالت داده COUNT_NONZERO: تعداد عناصر غیر صفر در
داده ها
-metric-tfce TFCE را روی یک فایل METRIC انجام دهید
wb_command -metric-tfce
- سطح برای محاسبه - معیاری برای اجرای TFCE روی
- خروجی - متریک خروجی
[-presmooth] - قبل از اجرای TFCE، متریک را صاف کنید
- سیگما برای هسته صاف کننده گاوسی، بر حسب میلی متر
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را برای اجرای TFCE انتخاب کنید
- منطقه ای برای اجرای TFCE، به عنوان یک متریک
[-parameters] - پارامترها را برای انتگرال TFCE تنظیم کنید
- توان برای منطقه خوشه (پیش فرض 1.0) - توان برای مقدار آستانه
(پیش فرض 2.0)
[-column] - یک ستون را انتخاب کنید
- شماره یا نام ستون
[-تصحیح-مناطق] - نواحی راس برای استفاده به جای محاسبه آنها
سطح - نواحی راس تصحیح شده، به عنوان یک متریک
افزایش خوشه بدون آستانه روشی برای افزایش ارزش نسبی است
مناطقی که در یک آزمون آستانه استاندارد، خوشه ها را تشکیل می دهند. این هست
با ارزیابی انتگرال از:
e(h، p)^E * h^H * dh
در هر راس p، جایی که h از 0 تا حداکثر مقدار در داده ها متغیر است و e(h،
p) وسعت خوشه حاوی راس p در آستانه h است. منفی
مقادیر به طور مشابه با نفی داده ها، اجرای همان فرآیند و
نفی نتیجه
هنگام استفاده از -پیش صاف کردن با نواحی تصحیح شده، توجه داشته باشید که یک عدد تقریبی است
اصلاح در الگوریتم هموارسازی (تصحیح TFCE دقیق است). در حال انجام
صاف کردن سطوح جداگانه قبل از میانگین / TFCE در صورت امکان ترجیح داده می شود.
به منظور گره زدن بهتر اندازه هسته صاف کننده به اندازه ویژگی اصلی.
روش TFCE در: Smith SM، Nichols TE.، "Threshold-free cluster توضیح داده شده است.
افزایش: رسیدگی به مشکلات هموارسازی، وابستگی آستانه و
محلی سازی در استنتاج خوشه ای." Neuroimage. 2009 Jan 1;44(1): 83-98. PMID:
18501637
متریک به حجم نگاشت نقشه METRIC فایل به حجم
wb_command متریک به حجم نگاشت
- فایل متریک ورودی - سطح برای استفاده از مختصات
- یک فایل حجمی در فضای حجم خروجی مورد نظر -
خروجی - فایل حجم خروجی
[-nearest-vertex] - از مقدار نزدیکترین راس به وکسل استفاده کنید
مرکز - فاصله از سطح تا نگاشت مقادیر به وکسل، برحسب میلی متر
[-ribbon-constrained] - از الگوریتم نگاشت محدود نواری استفاده کنید
- سطح داخلی روبان - سطح بیرونی
روبان
[-voxel-subdiv] - تقسیم وکسل در حین تخمین وزن وکسل
- تعداد زیربخش ها، پیش فرض 3
مقادیر را از یک فایل متریک به یک فایل حجمی نگاشت می کند.
باید مشخص کنید
دقیقا یک گزینه روش نقشه برداری.
La -نزدیکترین رأس روش استفاده می کند
مقدار از نزدیکترین راس به مرکز وکسل (مفید برای مقادیر صحیح). در
-روبان محدود روش از همان روش استفاده می کند حجم به سطح نقشه برداری,
سپس از وزنه ها به صورت معکوس استفاده می کند.
متریک-بردار-عملیات یک عملیات برداری بر روی فایل های متریک انجام دهید
wb_command متریک-بردار-عملیات
- اولین فایل ورودی وکتور - فایل ورودی وکتور دوم
- چه عملیات برداری انجام شود - خروجی - فایل خروجی
[-normalize-a] - بردارهای ورودی اول را عادی می کند
[-normalize-b] - بردارهای ورودی دوم را عادی می کند
[-normalize-output] - عادی سازی بردارهای خروجی (برای نقطه معتبر نیست
تولید - محصول)
[-magnitude] - خروجی بزرگی نتیجه (برای نقطه معتبر نیست
تولید - محصول)
یک عملیات برداری را روی دو فایل متریک انجام می دهد (که باید مضرب 3 باشند
ستون ها). هر یک از ورودی ها ممکن است چندین بردار (بیش از 3 ستون) داشته باشد.
اما نه هر دو (حداقل یکی باید دقیقاً 3 ستون داشته باشد). در -اندازه و
-Ormalize-output ممکن است گزینه ها با هم یا با عملیاتی که مشخص نشده باشد
یک اسکالر (محصول نقطه ای) را برمی گرداند. در پارامتر باید یکی از
زیر است:
نقطه متقاطع اضافه کردن تفریق
-بردار-متریک-به-روی پیدا کنید اگر بردارها به سمت ROI هستند
wb_command -بردار-متریک-به-روی
- سطح برای محاسبه - roi برای پیدا کردن کوتاه ترین
مسیری به - خروجی - متریک خروجی
[-roi] - برای رئوس خارج از roi محاسبه نکنید
- منطقه برای محاسبه در داخل، به عنوان یک متریک
در هر رأس، بردار را در امتداد شروع کوتاهترین مسیر به ROI محاسبه کنید.
-متریک-وزن-آمار آمارهای فضایی وزنی روی یک فایل متریک
wb_command -متریک-وزن-آمار
- متریک ورودی
[-area-surface] - از نواحی راس به عنوان وزن استفاده کنید
- سطحی که برای نواحی راس استفاده می شود
[-weight-metric] - از وزن های فایل متریک استفاده کنید
- فایل متریک حاوی وزن
[-column] - نمایش خروجی فقط برای یک ستون
- شماره یا نام ستون
[-roi] - فقط داده های داخل یک roi را در نظر بگیرید
- roi، به عنوان یک فایل متریک
[-match-maps] - هر ستون ورودی از ستون مربوطه استفاده می کند
از فایل roi
[-mean] - میانگین وزنی را محاسبه کنید
[-stdev] - محاسبه انحراف استاندارد وزنی
[-sample] - برآورد جمعیت stdev از نمونه
[-percentile] - صدک وزنی را محاسبه کنید
- صدک برای پیدا کردن
[-sum] - جمع وزنی را محاسبه کنید
[-show-map-name] - فهرست و نام نقشه را قبل از هر خروجی چاپ کنید
برای هر ستون ورودی، یک عدد منفرد چاپ میشود که از
عملیات مشخص شده استفاده کنید ستون برای دادن خروجی فقط برای یک ستون. استفاده کنید
-روی فقط داده های یک منطقه را در نظر بگیرید. دقیقا یکی از -كاهش دادن or
-درصد باید مشخص شود، و دقیقا یکی از -منظور داشتن, -stdev, -درصد or
-جمع باید مشخص شود.
با استفاده از -جمع با -سطح-سطح (و یا -وزن متریک با متریک حاوی مشابه
داده) معادل یکپارچه سازی با توجه به مساحت سطح است. به عنوان مثال، اگر
می خواهید مساحت سطح را در یک roi پیدا کنید، این کار را انجام دهید:
$ wb_command -metric-weighted-stats roi.func.gii -sum -area-surface
midthickness.surf.gii
-nifti-اطلاعات نمایش اطلاعات در مورد یک فایل NIFTI/CIFTI
wb_command -nifti-اطلاعات
- فایل nifti/cifti برای بررسی
[-print-header] - نمایش محتوای هدر
[-print-matrix] - خروجی مقادیر موجود در ماتریس (فقط cifti)
[-print-xml] - سیفتی XML را چاپ کنید (فقط cifti)
[-نسخه] - XML را به یک نسخه خاص CIFTI تبدیل کنید (پیشفرض است
نسخه cifti فایل) - نسخه CIFTI برای استفاده
شما باید حداقل یکی را مشخص کنید -چاپ-* گزینه.
-probtrackx-dot-convert یک فایل .DOT را از PROBTRACKX به CIFTI تبدیل کنید
wb_command -probtrackx-dot-convert
- فایل .dot را وارد کنید - خروجی - خروجی فایل cifti
[-row-voxels] - نگاشت خروجی در امتداد یک ردیف وکسل خواهد بود
- یک فایل متنی حاوی شاخص های IJK برای وکسل ها
استفاده
- یک جلد برچسب با ابعاد و شکل استفاده شده، با
برچسب های ساختار
[-row-surface] - نگاشت خروجی در امتداد یک ردیف رئوس سطح خواهد بود
- یک فایل متریک با مقادیر مثبت در تمام گره های استفاده شده
[-row-cifti] - نقشه برداری در امتداد یک ردیف از یک فایل cifti
- فایل cifti برای گرفتن نقشه از - به کدام بعد
نقشه برداری را در امتداد ROW یا COLUMN بردارید
[-col-voxels] - نگاشت خروجی در امتداد یک ستون وکسل خواهد بود
- یک فایل متنی حاوی شاخص های IJK برای وکسل ها
استفاده
- یک جلد برچسب با ابعاد و شکل استفاده شده، با
برچسب های ساختار
[-col-surface] - نگاشت خروجی در امتداد یک ستون سطحی خواهد بود
رگه ها - یک فایل متریک با مقادیر مثبت در تمام گره های استفاده شده
[-col-cifti] - نقشه برداری در امتداد یک ستون از یک فایل cifti
- فایل cifti برای گرفتن نقشه از - به کدام بعد
نقشه برداری را در امتداد ROW یا COLUMN بردارید
[-transpose] - ماتریس ورودی را جابجا کنید
[-make-symmetric] - ورودی نیم مربع را به خروجی ماتریس کامل تبدیل می کند
توجه: دقیقا یکی -رو گزینه و یک -سرهنگ گزینه باید استفاده شود
اگر فایل ورودی فهرست های خود را به ترتیب صحیح مرتب نکرده باشد، این
فرمان ممکن است بیش از حد انتظار طول بکشد. مشخص کردن - جابجایی را منتقل خواهد کرد
ماتریس ورودی قبل از تلاش برای قرار دادن مقادیر آن در فایل cifti، که این است
در حال حاضر حداقل برای ماتریس 2 مورد نیاز است تا آن را همانطور که در نظر گرفته شده نشان دهد. چگونه
فایل cifti بر اساس آن نمایش داده می شود -رو گزینه مشخص شده است: if ردیف-وکسل
مشخص شده است، سپس داده ها را بر روی برش های حجمی نمایش می دهد. نام برچسب در
جلد(های) برچسب باید نامهای زیر را داشته باشد، نامهای دیگر نادیده گرفته میشوند:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
-set-map-names نام یک یا چند نقشه را در یک فایل تنظیم کنید
wb_command -set-map-names
- فایل برای تنظیم نام نقشه
[-name-file] - از یک فایل متنی برای جایگزینی همه نامهای نقشه استفاده کنید
- فایل متنی حاوی نام نقشه، یکی در هر خط
[-map] - قابل تکرار - یک نقشه را برای تنظیم نام مشخص کنید
- فهرست نقشه برای تغییر نام - نامی که باید برای آن تنظیم کنید
نقشه
نام یک یا چند نقشه را برای متریک، شکل، برچسب، حجم، سیفتی اسکالر یا
فایل های لیبل cifti. اگر -نام-فایل گزینه مشخص نشده است -نقشه گزینه باید
حداقل یک بار مشخص شود. در -نقشه گزینه زمانی قابل استفاده نیست -نام-فایل is
مشخص شده.
-مجموعه-ساختار تنظیم ساختار یک فایل داده
wb_command -مجموعه-ساختار
- فایل برای تنظیم ساختار - ساختار برای تنظیم
پرونده به
[-surface-type] - نوع سطح را تنظیم کنید (فقط در صورتی استفاده می شود که فایل a باشد
فایل سطحی) - نام نوع سطح
[-surface-secondary-type] - نوع ثانویه یک سطح را تنظیم کنید (فقط
اگر فایل یک فایل سطحی باشد استفاده می شود) - نام نوع ثانویه سطح
فایل موجود اصلاح شده و به همان نام فایل بازنویسی می شود.
معتبر
مقادیر نام ساختار عبارتند از:
CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT نامعتبر OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT
نام های معتبر برای نوع سطح عبارتند از:
بازسازی ناشناخته آناتومیک باد شده VERY_INFLATED کروی SEMI_SPHERICAL
بدنه مسطح ELLIPSOID
نام های معتبر برای نوع ثانویه سطحی عبارتند از:
PIAL GRAY_WHITE MIDTHICKNESS نامعتبر
-نمایش صحنه ارائه خارج از صفحه صحنه به یک فایل تصویری
wb_command -نمایش صحنه
- فایل صحنه - نام یا شماره (شروع از یک)
از صحنه در
فایل صحنه
- خروجی نام فایل تصویری - عرض تصویر(های) خروجی
- ارتفاع تصویر(های) خروجی
محتوای پنجره های مرورگر نمایش داده شده در یک صحنه را به فایل(های) تصویر تبدیل کنید. در
نام فایل تصویری باید شبیه "capture.png" باشد. اگر فقط یک تصویر وجود دارد
رندر، نام تصویر تغییر نخواهد کرد. اگر بیش از یک تصویر برای ارائه وجود دارد،
یک نمایه در نام تصویر درج می شود: "capture_01.png"، "capture_02.png"
و غیره.
فرمت تصویر با پسوند فایل تصویر تعیین می شود. فرمت های تصویر
موجود در این سیستم عبارتند از:
bmp ico jpeg jpg png ppm tif tiff xbm xpm
توجه: فرمت های تصویر موجود ممکن است بسته به سیستم عامل متفاوت باشد.
-فاصله تا سطح امضا شده محاسبه فاصله امضا شده از یک سطح تا سطح دیگر
wb_command -فاصله تا سطح امضا شده
- سطح مقایسه برای اندازه گیری فاصله علامت گذاری شده روی
- سطح مرجعی که فاصله علامت گذاری شده را مشخص می کند
تابع
- خروجی - متریک خروجی
[-winding] - روش سیم پیچی برای تست نقطه داخل سطح
- نام روش (پیشفرض EVEN_ODD)
تابع فاصله علامت دار سطح مرجع را در هر راس روشن محاسبه کنید
سطح مقایسه توجه: این رابطه متقارن نیست، خط از a
راس به نزدیکترین نقطه در سطح "ref" (همانی که علامت را تعریف می کند
تابع فاصله) فقط با نرمال سطح "ref" همسو می شود. معتبر
مشخصات روش های سیم پیچی به شرح زیر است:
EVEN_ODD (پیشفرض) NEGATIVE NONZERO NORMALS
روش NORMALS از نرمال مثلث ها و یال ها یا نزدیک ترین مثلث استفاده می کند
برخورد پرتو از نقطه این روش ممکن است کمی سریعتر باشد، اما فقط همین است
قابل اعتماد برای یک سطح بسته که از خود عبور نمی کند. همه دیگر
روشها گذرهای ورودی (مثبت) و خروجی (منفی) یک پرتو عمودی را از آن شمارش میکنند
نقطه، سپس اگر مجموع فرد، منفی یا غیرصفر باشد، داخل حساب می شود،
بود.
-spec-file-merge دو فایل مشخصات را در یک ادغام کنید
wb_command -spec-file-merge
- اولین فایل مشخصات برای ادغام - فایل مشخصات دوم برای ادغام
- خروجی - فایل مشخصات خروجی
فایل مشخصات خروجی شامل هر فایلی است که در هر یک از فایل های مشخصات ورودی وجود دارد.
-سطح-آفین-رگرسیون تغییر شکل آفین بین سطوح روی همان مش
wb_command -سطح-آفین-رگرسیون
- سطح به تاب برداشتن - سطح برای مطابقت با مختصات
- خروجی - فایل affine خروجی
از رگرسیون خطی برای محاسبه افینی استفاده کنید که مجموع مجذورهای آن را به حداقل می رساند
تفاوت بین سطح هدف و سطح منبع تاب خورده را هماهنگ می کند.
توجه داشته باشید که این یک سوگیری برای انقباض سطحی است که در حال تاب برداشتن است. خروجی
به عنوان یک ماتریس "جهان" NIFTI نوشته شده است، ببینید -convert-afine برای تبدیل آن برای استفاده در
نرم افزارهای دیگر
-سطح-اعمال-آفین AFFINE TRANSFORM را روی فایل سطحی اعمال کنید
wb_command -سطح-اعمال-آفین
- سطح برای تبدیل - فایل affine - خروجی
- سطح تبدیل شده خروجی
[-Flirt] - در صورتی که affine affine لاس زدن باشد، باید استفاده شود
- حجم منبع مورد استفاده در هنگام تولید affine
- حجم هدف مورد استفاده در هنگام تولید affine
برای ماتریس های لاس زدن، باید از آن استفاده کنید - معاشقه گزینه، زیرا ماتریس های لاس زدن نیستند
شرح کامل تبدیل مختصاتی که آنها نشان می دهند. اگر - معاشقه
گزینه موجود نیست، affine باید affine 'جهانی' nifti باشد، که می تواند باشد
به دست آمده با -convert-afine دستور، یا aff_conv از مجموعه 4dfp.
-سطح-اعمال-وارپفیلد WARPFIELD را روی فایل سرفیس اعمال کنید
wb_command -سطح-اعمال-وارپفیلد
- سطح برای تبدیل - میدان جنگی INVERSE
- خروجی - سطح تبدیل شده خروجی
[-fnirt] - در صورت استفاده از fnirt warpfield باید استفاده شود
- میدان جنگی رو به جلو
توجه: تاب برداشتن یک سطح مستلزم معکوس میدان تاب است که برای تاب برداشتن آن استفاده می شود
حجم آن با آن ردیف می شود. هدر تاب رو به جلو مورد نیاز است -fnirt
گزینه ای برای تفسیر صحیح جابجایی ها در fnirt warpfield.
اگر -fnirt گزینه موجود نیست، warpfield باید یک "جهان" nifti باشد
warpfield، که با استفاده از -convert-warpfield فرمان
-میانگین سطحی متوسط فایل های سطحی با هم
wb_command -میانگین سطحی
- خروجی - سطح متوسط خروجی
[-stddev] - انحراف استاندارد نمونه سه بعدی را محاسبه کنید
- خروجی - متریک خروجی برای نمونه سه بعدی
انحراف معیار
[-عدم قطعیت] - محاسبه caret5 'عدم قطعیت'
- خروجی - متریک خروجی برای عدم قطعیت
[-surf] - قابل تکرار - سطحی را برای گنجاندن در میانگین مشخص کنید
- یک فایل سطحی به طور متوسط
انحراف استاندارد نمونه سه بعدی به صورت 'sqrt(مجموع(طول مربع(xyz -
mean(xyz)))/(n - 1))'.
عدم قطعیت یک معیار قدیمی است که در caret5 استفاده میشود و به صورت 'ssum(length(xyz
- mean(xyz)))/n'.
-سطح-نزدیکترین رأس نزدیکترین راس سطح به مختصات را پیدا کنید
wb_command -سطح-نزدیکترین رأس
- سطح مورد استفاده - فایل متنی با مختصات
- خروجی - فایل متنی خروجی با اعداد رأس
برای هر مختصات XYZ سه گانه، نزدیکترین راس را در سطح پیدا کنید و خروجی بگیرید
شماره راس آن در یک فایل متنی.
-مختصات سطح به متریک ایجاد فایل متریک مختصات سطحی
wb_command -مختصات سطح به متریک
- سطح برای استفاده از مختصات - خروجی -
متریک خروجی
مختصات سطح را در یک فایل متریک 3 نقشه ای به صورت x، y، z قرار می دهد.
-سطح-قشر-لایه یک سطح تقریباً یک لایه قشر مغز ایجاد کنید
wb_command -سطح-قشر-لایه
- سطح ماده سفید - سطح پیل
- لایه را در چه کسر حجمی قرار دهیم - خروجی -
سطح خروجی
[-placement-out] - خروجی قرار دادن به عنوان کسری فاصله از پیال
به سفید - خروجی - متریک خروجی
[-untwist] - گزینه موقت برای مقایسه روش ها، مشخص کنید که از قدیمی استفاده کنید
روش
سطوح ورودی باید مطابقت رأس داشته باشند.
سطح خروجی
با قرار دادن رئوس بین دو سطح به گونه ای ایجاد می شود که محصور شده باشد
حجم در هر تکه کوچک از سطوح جدید و سفید کسر داده شده است
از حجم همان لکه بین پیال و سطوح سفید (یعنی
مشخص کردن 0 سطح سفید را نشان می دهد و 1 سطح پیال را نشان می دهد).
-سطح-ایجاد-کره کره ای با نواحی راس ثابت ایجاد کنید
wb_command -سطح-ایجاد-کره
- تعداد رئوس دلخواه - خروجی - خروجی
کره
با تقسیم منظم مثلث های یک ایکوسادرون، کره ای تولید می کند
تا حد امکان به تعداد رئوس مورد نظر نزدیک شده و آن را برای داشتن تغییر دهید
مناطق راس بسیار مشابه برای همه رئوس. برای تولید یک جفت راس منطبق
کره های چپ و راست، از این دستور استفاده کنید، سپس -surface-flip-lr برای تولید
پس حوزه دیگر -مجموعه-ساختار روی هر کدام مثلا:
$ wb_command -surface-create-sphere 6000 Sphere.6k.R.surf.gii
$ wb_command -surface-flip-lr Sphere.6k.R.surf.gii Sphere.6k.L.surf.gii
$ wb_command -set-structure Sphere.6k.R.surf.gii CORTEX_RIGHT
$ wb_command -set-structure Sphere.6k.L.surf.gii CORTEX_LEFT
سطح-برش-نمونه مجدد یک سطح برش را دوباره نمونه کنید
wb_command سطح-برش-نمونه مجدد
- فایل سطحی برای نمونه گیری مجدد - یک سطح کره ای
با مش که سطح ورودی
در حال حاضر روشن است
- یک سطح کره ای که با آن ثبت شده است
و دارای مش خروجی مورد نظر می باشد
- خروجی - فایل سطح خروجی
با توجه به دو سطح کروی که در رجیستر هستند، یک فایل سطحی را دوباره نمونه می کند.
از نمونهگیری مجدد باریسنتریک استفاده میشود، زیرا معمولاً برای نمونهگیری مجدد بهتر است
سطوح، و چون به هر حال برای کشف توپولوژی جدید مورد نیاز است.
-سطح اعوجاج اعوجاج بین سطوح را اندازه گیری کنید
wb_command -سطح اعوجاج
- سطح مرجع - تحریف شده
سطح - خروجی - متریک اعوجاج خروجی
[-smooth] - داده های منطقه را صاف کنید
- سیگمای هسته صاف کننده بر حسب میلی متر
[-caret5-method] - از روش اعوجاج سطحی از caret5 استفاده کنید
[-edge-method] - محاسبه اعوجاج طول لبه به جای مساحت
این دستور در صورت عدم استفاده -caret5-روش or -روش لبه، معادل استفاده است
-سطح-راس-مناطق در هر سطح، هر دو معیار خروجی را با
روش GEO_GAUSS_EQUAL روی سطحی که از آن آمده اند -صاف مشخص شده است و
سپس با استفاده از فرمول 'ln(distorted/reference)/ln(2)' روی نتایج هموار.
هنگام استفاده از -caret5-روش، از روش اعوجاج سطحی از caret5 استفاده می کند که
لاگ پایه 2 نسبت مساحت های کاشی را می گیرد، سپس آن نتایج را در میانگین می گیرد
هر رأس، و سپس نتیجه را روی سطح مرجع صاف می کند.
هنگام استفاده از -روش لبهاز -صاف گزینه نادیده گرفته می شود و خروجی در هر کدام
راس میانگین 'abs(ln(refEdge/distortEdge)/ استln(2)) روی تمام لبه ها
به رأس متصل است.
-surface-flip-lr یک سطح را از طریق صفحه YZ آینه کنید
wb_command -surface-flip-lr
- سطح به تلنگر - خروجی - سطح برگردانده خروجی
این دستور مختصات x هر راس را نفی میکند و سطح را برمیگرداند
نرمال، به طوری که شما یک سطح با دست مخالف با ویژگی های یکسان دارید
و مطابقت گره، با نرمال های سازگار با سطح اصلی. که
است، اگر سطح ورودی دارای نرمال های رو به بیرون باشد، سطح خروجی نیز خواهد بود
دارای حالت عادی رو به بیرون
-Surface-Flip-Normals همه کاشی ها را روی یک سطح ورق بزنید
wb_command -Surface-Flip-Normals
- سطح به تلنگر نرمال از - خروجی - خروجی
سطح
تمام مثلثها را روی یک سطح برمیگرداند، در نتیجه نرمالهای سطح برمیگردند
جهت دیگر (داخل در مقابل بیرون). اگر یک سطح را با آفین تبدیل کنید
که دارای تعیین کننده منفی است، یا یک میدان جنگی که به طور مشابه سطح را می چرخاند، شما
ممکن است به سطحی ختم شود که دارای سطوح نرمال به سمت داخل باشد، که ممکن است دارای نمایشگر باشد
چالش ها و مسائل. با استفاده از این دستور این مشکل حل می شود.
-سطح-تولید- باد شده SURFACE GENERATE باد کرده است
wb_command -سطح-تولید- باد شده
- سطح تشریحی - خروجی -
سطح باد شده خروجی - خروجی - خروجی بسیار
سطح باد شده
[-iterations-scale] - مقیاس بندی تکرارهای اختیاری
- ارزش مقیاس تکرارها
سطوح متورم و بسیار متورم ایجاد کنید. سطوح خروجی "همسان" هستند
(دارای محدوده XYZ یکسان) تا سطح آناتومیک. در بیشتر موارد، یک مقیاس تکراری
از 1.0 (پیش فرض) کافی است. با این حال، اگر سطح شامل تعداد زیادی از
گره (150,000)، مقیاس تکرار 2.5 را امتحان کنید.
-سطح-ژئودزیک-فاصله محاسبه فاصله ژئودزیکی از یک راس تا کل سطح
wb_command -سطح-ژئودزیک-فاصله
- سطح برای محاسبه - راس برای محاسبه ژئودزیک
فاصله از - خروجی - متریک خروجی
[- ساده لوح] - فقط از همسایگان استفاده کنید، مثلث ها را نخیزید (توصیه نمی شود)
[-limit] - در یک فاصله معین توقف کنید
- فاصله در میلی متر برای توقف
مگر اینکه -حد مشخص شده است، فاصله ژئودزیکی از مشخص شده را محاسبه می کند
راس به بقیه نتیجه به صورت یک فایل متریک تک ستونی با یک خروجی است
ارزش -1 برای رئوسی که فاصله برای آنها محاسبه نشده است. اگر -آدم ساده نیست
مشخص شده است، نه تنها از همسایگان فوری، بلکه از همسایگان مشتق شده نیز استفاده می کند
خزیدن روی جفت مثلث هایی که یک لبه مشترک دارند.
-سطح-ژئودزیک-رویس ROIS محدود GEODESIC را در رئوس بکشید
wb_command -سطح-ژئودزیک-رویس
- سطحی برای کشیدن - محدودیت فاصله ژئودزیکی از راس،
در میلی متر - یک فایل متنی حاوی رئوس برای رسم ROI
دور و بر
- خروجی - متریک خروجی
[-gaussian] - به جای ROI مسطح، یک هسته گاوسی تولید کنید
- سیگما برای هسته گاوسی، بر حسب میلی متر
[-overlap-logic] - نحوه رسیدگی به ROIهای همپوشانی، پیش فرض ALLOW
- روش حل همپوشانی ها
[-names] - نام ستون ها را از فایل متنی
- یک فایل متنی حاوی نام ستون، یکی در هر خط
برای هر رأس در فایل لیست، یک ستون در متریک خروجی ایجاد می شود و یک
ROI اطراف آن راس در آن ستون رسم شده است. هر ستون متریک صفر خواهد داشت
خارج از فاصله ژئودزیکی که توسط ، و به طور پیش فرض دارای یک خواهد بود
مقدار 1.0 در داخل آن. اگر -گاوسی گزینه مشخص شده است، مقادیر داخل
ROI در عوض یک گاوسی با مقدار مشخص شده سیگما، نرمال شده تشکیل می دهد
به طوری که مجموع مقادیر غیر صفر در ستون متریک 1.0 باشد. را
استدلال به همپوشانی-منطق باید یکی از ALLOW، CLOSEST یا EXCLUDE باشد. ALLOW است
بهطور پیشفرض، و به این معنی است که ROI به طور مستقل بررسی میشود و ممکن است همپوشانی داشته باشند. نزدیکترین
به این معنی است که ROI ممکن است با هم همپوشانی نداشته باشد و هیچ ROI حاوی رئوس نزدیکتر نباشد
به یک راس دانه متفاوت EXCLUDE به این معنی است که ROI ها ممکن است با هم همپوشانی نداشته باشند، و هر کدام
راس در محدوده بیش از یک ROI به هیچ ROI تعلق ندارد.
-تورم سطحی تورم سطحی
wb_command -تورم سطحی
- سطح تشریحی - فایل سطح به
باد کردن - تعداد چرخه های صاف کردن
- قدرت صاف کردن (محدوده [0.0 - 1.0])
- هموارسازی تکرارها - عامل تورم
- خروجی - فایل سطح خروجی
با انجام چرخه هایی که شامل صاف کردن و به دنبال آن می شود، یک سطح را باد کنید
تورم (برای اصلاح انقباض ناشی از صاف کردن).
-اطلاعات سطحی نمایش اطلاعات در مورد یک سطح
wb_command -اطلاعات سطحی
- سطحی که اطلاعات برای آن نمایش داده می شود
اطلاعات مربوط به سطح نمایش داده می شود از جمله رئوس، مثلث ها، جعبه مرزی،
و فاصله گذاری
-مطابقت سطحی مسابقه سطحی
wb_command -مطابقت سطحی
- مطابقت (مرجع) سطح - فایل
حاوی سطحی است که تبدیل خواهد شد - فایل سطحی
پس از تحول
فایل سطح ورودی به گونهای تبدیل میشود که محدوده مختصات آن (محدود شود
باکس) با فایل Match Surface مطابقت دارد
-سطح-تغییر-کره شعاع را تغییر دهید و به صورت اختیاری یک کره را مجدداً مرکز کنید
wb_command -سطح-تغییر-کره
- کره برای اصلاح - شعاع کره خروجی باید
دارند - خروجی - کره خروجی
[-recenter] - کره را با استفاده از کادر محدود کننده جدید کنید
اگر از این دستور استفاده کرده باشید ممکن است مفید باشد -نمونه مجدد سطحی برای نمونه برداری مجدد از یک کره،
که ممکن است از مشکلاتی رنج ببرند که عموماً در آنها وجود ندارد
-سطح-کره-پروژه-بدون پروژه. اگر کره باید از قبل به اطراف متمرکز شده باشد
منشاء، با استفاده از -مرکز کردن ممکن است هنوز کمی آن را قبل از تغییر شعاع جابجا کند،
که به احتمال زیاد نامطلوب است.
اگر نزدیک به کروی نیست، یا در اطراف مبدا متمرکز نیست و
-مرکز کردن استفاده نمی شود، یک هشدار چاپ شده است.
-سطح-طبیعی نرمال های راس خروجی به عنوان فایل متریک
wb_command -سطح-طبیعی
- سطح به خروجی نرمال از - خروجی - عادی است
بردار
بردارهای عادی فایل سطحی را محاسبه می کند و آنها را به صورت یک ستون 3 خروجی می دهد
فایل متریک
-نمونه مجدد سطحی یک سطح را به مش های مختلف تبدیل کنید
wb_command -نمونه مجدد سطحی
- فایل سطحی برای نمونه گیری مجدد - یک سطح کره ای
با مش که سطح ورودی
در حال حاضر روشن است
- یک سطح کره ای که با آن ثبت شده است
و دارای مش خروجی مورد نظر می باشد
- نام روش - خروجی - فایل سطح خروجی
[-area-surfs] - سطوحی را برای انجام اصلاح ناحیه راس بر اساس مشخص کنید
- یک سطح مربوط با مش - آ
سطح مربوطه با مش
[-area-metrics] - معیارهای ناحیه راس را برای انجام اصلاح ناحیه بر اساس مشخص کنید
بر - یک فایل متریک با نواحی راس برای
مش
- یک فایل متریک با نواحی راس برای مش
با توجه به دو سطح کروی که در رجیستر هستند، یک فایل سطحی را دوباره نمونه می کند. اگر
این روش اصلاح ناحیه را انجام می دهد، دقیقا یکی از -منطقه موج سواری or متریک مساحت باید
مشخص شود. این گزینه در شرایط عادی استفاده نمی شود، اما ارائه شده است
کامل بودن
در آرگومان باید یکی از موارد زیر باشد:
ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC
روش BARYCENTRIC برای سطوح آناتومیک توصیه می شود، مگر اینکه چنین باشد
نسبتاً خشن، به منظور به حداقل رساندن هموار شدن.
برای سطوح برش خورده (از جمله نقشه های مسطح)، استفاده کنید سطح-برش-نمونه مجدد.
به جای نمونه برداری مجدد از یک سطح کروی، -سطح-کره-پروژه-بدون پروژه
دستور توصیه می شود.
-صاف کننده سطح صاف کردن سطح
wb_command -صاف کننده سطح
- سطح سوهان صاف شود - قدرت صاف کنندگی
(محدوده [0.0 - 1.0]) - هموارسازی تکرارها -
خروجی - فایل سطح خروجی
سطح را با میانگین گیری گره ها با همسایگان خود صاف می کند.
-سطح-کره-پروژه-بدون پروژه یک کره را طبق یک ثبت نام تغییر شکل دهید
wb_command -سطح-کره-پروژه-بدون پروژه
- کره با مش خروجی مورد نظر - آ
کره ای که با کره درون همسو می شود - کره-پروژه-به
به فضای خروجی تغییر شکل داده است - خروجی - کره خروجی
هر رأس از پیش بینی شده است بدست آوردن
وزنه های باریسنتریک، که سپس برای خارج کردن از آنها استفاده می شود .
این منجر به یک کره با توپولوژی از ، اما مختصات تغییر کرد
توسط تغییر شکل بین و .
و باید توپولوژی یکسانی با هر کدام داشته باشد
دیگر، اما ممکن است توپولوژی متفاوتی داشته باشد.
-سطح به سطح-فاصله سه بعدی محاسبه فاصله بین رئوس متناظر
wb_command -سطح به سطح-فاصله سه بعدی
- سطح برای مقایسه با مرجع -
سطح برای استفاده به عنوان مرجع - خروجی - فواصل خروجی
[-بردار] - خروجی بردارهای جابجایی
- خروجی - بردارهای خروجی
اختلاف بردار بین رئوس هر سطح را با همان محاسبه می کند
شاخص، به عنوان (comp - ref)، و خروجی بزرگی، و اختیاری جابجایی
بردارها
-سطح-راس-مناطق مساحت سطح را اندازه گیری کنید که هر رأس مسئول آن است
wb_command -سطح-راس-مناطق
- سطح برای اندازه گیری - خروجی - متریک خروجی
هر رأس یک سوم مساحت هر مثلثی که بخشی از آن است را به خود اختصاص می دهد.
-سطح-گوه-حجم حجم در هر راس بین سطوح را اندازه گیری کنید
wb_command -سطح-گوه-حجم
- سطح داخلی - سطح بیرونی -
خروجی - متریک خروجی
حجم مساحت هر رأس را از یک سطح به سطح دیگر محاسبه کنید. سطوح
باید مکاتبات گره داشته باشد.
-واحد آزمایش
-volume-affine-resample حجم را با استفاده از تبدیل آفین دوباره نمونه کنید
wb_command -volume-affine-resample
- حجم برای نمونه گیری مجدد - فایل affine برای اعمال
- یک فایل حجمی در فضای حجمی که برای آن می خواهید
تولید
- روش نمونه گیری مجدد - خروجی - حجم خروجی
[-Flirt] - در صورتی که affine affine لاس زدن باشد، باید استفاده شود
- حجم منبع مورد استفاده در هنگام تولید affine
- حجم هدف مورد استفاده در هنگام تولید affine
یک فایل حجمی را با تبدیل affine مجدداً نمونه برداری کنید.
توصیه می شود
متدها CUBIC (مکعب spline) برای بیشتر دادهها و ENCLOSING_VOXEL برای دادههای برچسب هستند.
پارامتر باید یکی از:
CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR
-حجم-همه-برچسب ها-به-رویس ROIS را از همه برچسب ها در یک قاب حجمی درست کنید
wb_command -حجم-همه-برچسب ها-به-رویس
- فایل برچسب حجم ورودی - شماره یا نام برچسب
نقشه برای استفاده - خروجی - فایل حجم خروجی
حجم خروجی دارای یک قاب برای هر برچسب در قاب ورودی مشخص شده است
از ??? برچسب، که هر کدام حاوی ROI از تمام وکسلهایی است که روی عدد تنظیم شدهاند
برچسب مربوطه
- حجم - گرفتن - هواپیما ادغام تصویر از صفحه از طریق حجم
wb_command - حجم - گرفتن - هواپیما
- فایل حجمی برای درون یابی از - نام یا شماره
حجم فرعی برای استفاده - نوع درونیابی - عرض تصویر خروجی،
در پیکسل - ارتفاع تصویر خروجی، بر حسب پیکسل - ارزش برای ارائه
به صورت سیاه - مقدار برای ارائه به صورت سفید - مختصات x از
سمت چپ پایین تصویر خروجی - مختصات y از پایین
سمت چپ تصویر خروجی - مختصات z پایین سمت چپ
تصویر خروجی - مختصات x سمت راست پایین خروجی
تصویر - مختصات y سمت راست پایین تصویر خروجی
- مختصات z سمت راست پایین تصویر خروجی
- مختصات x سمت چپ بالای تصویر خروجی -
مختصات y سمت چپ بالای تصویر خروجی - Z- مختصات از
سمت چپ بالای تصویر خروجی - خروجی - تصویر خروجی
توجه: اگر می خواهید تصویری با تمام قابلیت های رابط کاربری گرافیکی ایجاد کنید
ارائه، ببینید -نمایش صحنه.
تصویری از یک صفحه دلخواه را از طریق فایل حجمی با یک ساده ارائه می دهد
پالت خاکستری خطی پارامتر باید یکی از:
CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR
-جلد-کپی-پسوندها داده های توسعه یافته را در یک فایل حجمی دیگر کپی کنید
wb_command -جلد-کپی-پسوندها
- فایل حجمی حاوی داده های وکسل برای استفاده
- فایل حجمی حاوی پسوندهای مورد استفاده - خروجی -
حجم خروجی
[-drop-unknown] - پسوندهایی را که میز کار نمی فهمد کپی نکنید
این دستور اطلاعات را در یک فایل حجمی کپی می کند که بخش مهمی از آن نیست
هدر استاندارد یا ماتریس داده، به عنوان مثال نام نقشه، تنظیمات پالت، جداول برچسب.
If -افتاده-ناشناس مشخص نشده است، همچنین انواع مشابهی از مجموعه اطلاعات را کپی می کند
توسط نرم افزارهای دیگر
ایجاد حجم یک فایل حجمی خالی ایجاد کنید
wb_command ایجاد حجم
- طول بعد اول - طول بعد دوم -
طول بعد سوم - خروجی - حجم خروجی
[-plumb] - تنظیم از طریق ترتیب محور و فاصله / افست
- رشته ای مانند 'XYZ' که مشخص می کند کدام شاخص در امتداد قرار دارد
کدام بعد فضایی
- تغییر در مختصات x از افزایش مربوطه
شاخص
- تغییر در مختصات y از افزایش مربوطه
شاخص
- تغییر در مختصات z از افزایش مربوطه
شاخص
- مختصات x اولین وکسل - مختصات y از
اولین وکسل - مختصات z اولین وکسل
[-sform] - تنظیم از طریق شکل نیفتی
- افزایش مختصات x از افزایش شاخص i
- افزایش مختصات x از افزایش شاخص j - افزایش در
مختصات x از افزایش شاخص k - مختصات x اولین وکسل
- افزایش مختصات y از افزایش شاخص i
- افزایش مختصات y از افزایش شاخص j - افزایش در
مختصات y از افزایش شاخص k - مختصات y اولین وکسل
- افزایش مختصات z از افزایش شاخص i
- افزایش مختصات z از افزایش شاخص j - افزایش در
مختصات z از افزایش شاخص k - مختصات z اولین وکسل
یک فایل حجمی پر از صفر ایجاد می کند.
دقیقا یکی از -شقق or شکل دادن
باید مشخص شود.
- حجم - گشاد کردن یک فایل حجمی را گشاد کنید
wb_command - حجم - گشاد کردن
- حجم برای گشاد شدن - فاصله بر حسب میلی متر تا گشاد شدن -
روش اتساع برای استفاده - خروجی - حجم خروجی
[-bad-voxel-roi] - یک roi از وکسل ها را برای بازنویسی مشخص کنید، به جای
وکسل هایی با مقدار صفر - فایل حجم، مقادیر مثبت نشان دهنده وکسل به
داشته باشد
ارزش های آنها جایگزین شده است
[-data-roi] - یک roi از جایی که داده وجود دارد را مشخص کنید
- فایل حجم، مقادیر مثبت نشان دهنده وکسل هایی است که دارند
داده ها
[-subvolume] - یک زیر جلد را برای گشاد شدن انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
برای همه وکسل هایی که به عنوان بد تعیین می شوند، اگر با وکسل غیر بد همسایه باشند
داده ها و یا در فاصله مشخص شده از چنین وکسل هستند، مقدار را جایگزین کنید
وکسل بد با مقدار محاسبه شده از وکسل های غیر بد مجاور که داده دارند،
در غیر این صورت مقدار را صفر کنید. هر چقدر هم که کوچک باشد است، اتساع خواهد شد
همیشه حداقل از وکسل های همسایه صورت استفاده کنید.
به طور پیش فرض، وکسل هایی که داده هایی با مقدار 0 دارند، بد هستند، مشخص کنید -bad-voxel-roi
فقط در صورتی که وکسل ها توسط roi انتخاب شده باشند، بد حساب شوند. اگر -data-roi نیست
مشخص شده، فرض می شود همه وکسل ها دارای داده هستند.
مقادیر معتبر برای هستند:
نزدیکترین - از مقدار نزدیکترین وکسل خوب WEIGHTED استفاده کنید - از یک وزن دار استفاده کنید
میانگین بر اساس فاصله
-volume-estimate-fwhm یکنواختی یک حجم FWHM را برآورد کنید
wb_command -volume-estimate-fwhm
- حجم ورودی
[-roi] - فقط از دادههای درون ROI استفاده کنید
- حجم برای استفاده به عنوان ROI
[-subvolume] - یک زیرجلد واحد را برای تخمین صافی انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
صافی حجم ورودی را در جهت های X، Y و Z به طور جداگانه تخمین می زند.
چاپ برآوردها به خروجی استاندارد اگر -زیرجلد مشخص نشده است، هر کدام
حجم فرعی تخمین زده می شود و به طور جداگانه نمایش داده می شود.
-حجم-افراطی EXTREMA را در یک فایل حجمی پیدا کنید
wb_command -حجم-افراطی
- فایل حجمی برای یافتن قسمت های انتهایی - حداقل فاصله
بین افراطی های شناسایی شده از همان
نوع
- خروجی - حجم فوق العاده خروجی
[-presmooth] - قبل از یافتن اکسترم، صدا را صاف کنید
- سیگما برای هسته صاف کننده گاوسی، بر حسب میلی متر
[-roi] - مقادیر خارج از ناحیه انتخاب شده را نادیده بگیرید
- منطقه ای برای یافتن افراط در
[-آستانه] - افراطی کوچک را نادیده بگیرید
- بزرگترین مقداری که باید برای حداقل بودن در نظر گرفت - کوچکترین
مقدار برای حداکثر بودن در نظر گرفته شود
[-sum-subvols] - به جای هر یک، مجموع زیرحجمهای انتهایی را خروجی میدهد
زیر جلد به طور جداگانه
[-consolidate-mode] - از ادغام حداقل های محلی به جای a استفاده کنید
محله بزرگ
[-only-maxima] - فقط حداکثر را پیدا کنید
[-only-minima] - فقط حداقل را پیدا کنید
[-subvolume] - یک زیرجلد واحد را برای یافتن اکسترم انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
Extrema را در یک فایل حجمی پیدا می کند، به طوری که هیچ دو Extrema از یک نوع وجود ندارد
در داخل از همدیگر. افراطی ها به عنوان برچسب گذاری می شوند -1 برای حداقل، 1 برای
حداکثر، 0 در غیر این صورت. اگر -فقط-حداکثر or -فقط-حداقل مشخص شده است، سپس خواهد شد
extrema که از نوع مشخص شده نیست را نادیده بگیرید. این گزینه ها متقابل هستند.
If مجموع-subvols مشخص شده است، این حجم های فرعی فوق العاده جمع می شوند و خروجی
دارای یک زیر جلد با این نتیجه است.
بهطور پیشفرض، یک نقطه داده تنها در صورتی افراطی است که از هر نقطه دیگر افراطیتر باشد
نقطه داده که در داخل است از آن. اگر حالت - تحکیم استفاده می شود، آن
در عوض با یافتن تمام نقاط داده که شدیدتر از نقطه فوری آنها هستند شروع می شود
همسایگان، سپس در حالی که هر افراطی در داخل وجود دارد از یکدیگر، بگیرید
دو اکسترم نزدیک به هم و آنها را با میانگین وزنی در یکی ادغام کنید
بر اساس تعداد اکسترمای اصلی که در هر کدام ادغام شده اند.
بهطور پیشفرض، همه حجمهای فرعی ورودی بدون هموارسازی استفاده میشوند -زیرجلد به
یک زیرجلد واحد را برای استفاده مشخص کنید، و -پیش صاف کردن برای صاف کردن ورودی قبل
پیدا کردن افراطی
-حفره-پر کردن-حجم سوراخ ها را در یک حجم ROI پر کنید
wb_command -حفره-پر کردن-حجم
- حجم ROI ورودی - خروجی - حجم ROI خروجی
تمام قسمتهای متصل به چهره را که در ROI گنجانده نشدهاند، پیدا میکند و همه جز را پر میکند
بزرگترین با آنهایی که
حجم-پیدا کردن-خوشه ها فیلتر خوشه ها بر اساس حجم
wb_command حجم-پیدا کردن-خوشه ها
- حجم ورودی - آستانه برای مقادیر داده
- آستانه برای حجم خوشه، در میلی متر^3 - خروجی -
حجم خروجی
[-less-than] - مقادیر کمتر از ، به جای
بیشتر
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را انتخاب کنید
- roi، به عنوان یک فایل حجمی
[-subvolume] - یک زیر جلد را انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
[-size-ratio] - خوشه های کوچکتر از کسری معین را نادیده بگیرید
بزرگترین خوشه در نقشه - کسری از حجم بزرگترین خوشه
[-فاصله] - خوشهها را دورتر از فاصله معینی نادیده بگیرید
بزرگترین خوشه - یک خوشه چقدر می تواند از بزرگترین خوشه دور باشد،
لبه
به لبه، در میلی متر
[-start] - شروع به برچسب زدن خوشه ها از مقداری غیر از 1 کنید
- مقداری که به اولین خوشه یافت شده داده می شود
حجمی با اعداد صحیح غیرصفر را برای همه وکسلها در یک حجم به اندازه کافی بزرگ خروجی میدهد
خوشه، و صفر در جاهای دیگر. اعداد صحیح نشان دهنده عضویت در خوشه هستند (به طور پیش فرض،
اولین خوشه یافت شده از مقدار 1، خوشه دوم 2 و غیره استفاده می کند. به طور پیش فرض، مقادیر
بزرگتر از در یک خوشه در نظر گرفته می شوند، استفاده کنید -کمتر از به
مقادیر کمتر از آستانه را آزمایش کنید. برای اعمال این به عنوان یک ماسک به داده ها، یا
برای انجام آستانه پیچیده تر، ببینید -حجم-ریاضی.
- گرادیان حجمی گرادیان یک فایل حجمی
wb_command - گرادیان حجمی
- حجم ورودی - خروجی - گرادیان خروجی
حجم قدر
[-presmooth] - قبل از محاسبه گرادیان، صدا را صاف کنید
- سیگما برای تابع وزن دهی گاوسی، برحسب میلی متر
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را برای گرفتن گرادیان انتخاب کنید
- منطقه ای برای گرفتن گرادیان در داخل
[-بردار] - بردارهای خروجی
- خروجی - بردارها به صورت فایل حجمی
[-subvolume] - یک زیر جلد را برای گرفتن گرادیان انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
گرادیان حجم را با انجام رگرسیون های خطی برای هر وکسل محاسبه می کند.
فقط همسایه های چهره خود را در نظر می گیرد مگر اینکه همسایه های چهره بسیار کمی وجود داشته باشد. را
بردار گرادیان از مشتقات جزئی خطی حاصل ساخته شده است
تابع، و بزرگی این بردار خروجی است. اگر مشخص شد، حجم
خروجی برداری با مولفه های x، y و z از یک زیرحجم به عنوان مرتب شده است
زیر جلدهای متوالی
-جدول-برچسب-صادرات-جدول جدول برچسب صادراتی از حجم به عنوان متن
wb_command -جدول-برچسب-صادرات-جدول
- فایل برچسب حجم ورودی - شماره یا نام برچسب
نقشه برای استفاده - خروجی - فایل متنی خروجی
جدول برچسب را از نقشه برچسب حجم می گیرد و در قالب متن می نویسد
مطابق با آنچه مورد انتظار است حجم-برچسب-واردات.
حجم-برچسب-واردات حجم LABEL را به فرمت CARET وارد کنید
wb_command حجم-برچسب-واردات
- حجم برچسب برای وارد کردن - فایل متنی حاوی
مقادیر و نام برای برچسب ها - خروجی - حجم برچسب میز کار خروجی
[-discard- Others] - هر وکسل را با مقادیری که در برچسب ذکر نشده است تنظیم کنید
لیست به ??? برچسب
[-unlabeled-value] - مقداری را تنظیم کنید که به عنوان بدون برچسب تفسیر شود
- مقدار عددی بدون برچسب (پیشفرض 0)
[-subvolume] - یک زیرجلد واحد را برای وارد کردن انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
[-drop-unused-labels] - مقادیر برچسب استفاده نشده را از برچسب حذف کنید
جدول
یک حجم جدید با اطلاعات برچسب در هدر در caret nifti ایجاد می کند
فرمت پسوند شما می توانید رشته خالی ('' روی لینوکس/مک کار می کند) را برای آن مشخص کنید
، که به گونه ای رفتار می شود که گویی یک فایل خالی است. لیست برچسب
فایل باید خطوطی با فرمت زیر داشته باشد:
کلید "unlabeled" را در فایل مشخص نکنید، فرض بر این است که 0 به معنای خیر است
برچسب زده شده مگر اینکه -unlabeled-value مشخص شده است. نام برچسب ها باید روی یک برچسب جداگانه باشد
خط، اما ممکن است حاوی فاصله یا سایر کاراکترهای غیرعادی باشد (اما نه خط جدید).
فضای خالی از هر دو انتهای نام برچسب بریده شده است، اما اگر در آن باشد، حفظ می شود
وسط یک برچسب مقادیر قرمز، سبز، آبی و آلفا باید از اعداد صحیح باشند
0 تا 255، و رنگی را که برچسب ترسیم شده است مشخص می کند (آلفای 255 به معنای
مات، که احتمالاً همان چیزی است که شما می خواهید). به طور پیش فرض، نام برچسب های جدیدی را تنظیم می کند
با نام LABEL_# برای هر مقداری که در لیست ذکر نشده است
فایل، مشخص کنید دور انداختن-دیگران به جای آن این وکسل ها را روی کلید "بدون برچسب" تنظیم کنید.
حجم-برچسب-به-roi یک برچسب حجم را به یک ROI VOLUME بسازید
wb_command حجم-برچسب-به-roi
- فایل برچسب حجم ورودی - خروجی - حجم خروجی
پرونده
[-name] - برچسب را با نام انتخاب کنید
- نام برچسبی که میخواهید یک روی از آن داشته باشید
[-key] - برچسب به کلید را انتخاب کنید
- کلید برچسبی که می خواهید از آن roi کنید
[-map] - یک نقشه برچسب واحد را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام نقشه
برای هر نقشه در ، یک نقشه در ایجاد می شود که در آن همه مکان ها
برچسب گذاری شده با یا با یک کلید از مقدار 1 داده می شود و
همه مکان های دیگر 0 داده شده است. دقیقا یکی از -سیب زمینی شیرین و -کی باید مشخص شود.
مشخص کردن -نقشه برای استفاده از تنها یک نقشه از .
-برچسب-برچسب-به-سطح-نقشه حجم یک برچسب را به یک فایل برچسب سطحی نگاشت کنید
wb_command -برچسب-برچسب-به-سطح-نقشه
- حجم به نقشه داده ها از - سطحی که داده ها را روی آن نقشه برداری کنید
- خروجی - خروجی فایل برچسب هدیه
[-subvol-select] - یک زیرجلد واحد را برای نقشه انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
از روش نگاشت وکسل محصور کننده برای نگاشت داده های برچسب به فایل برچسب هدیه استفاده می کند.
-حجم-ریاضی ارزیابی بیان در فایل های حجمی
wb_command -حجم-ریاضی
- عبارت برای ارزیابی، در نقل قول - خروجی -
حجم خروجی
[-fixnan] - نتایج NaN را با یک مقدار جایگزین کنید
- مقدار جایگزین NaN با
[-var] - قابل تکرار - یک فایل حجمی برای استفاده به عنوان متغیر
- نام متغیر، همانطور که در عبارت استفاده می شود - حجم
فایل برای استفاده به عنوان این متغیر
[-subvolume] - یک زیر جلد را انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
[-repeat] - استفاده مجدد از یک زیر جلد برای هر زیرجلد محاسبه
این دستور ارزیابی می کند در هر وکسل به طور مستقل
آنجا
باید حداقل یکی باشد -var گزینه (برای دریافت فضای حجم از)، حتی اگر
مشخص شده در آن استفاده نشده است . همه جلدها باید حجم یکسانی داشته باشند
فضا. نام فایل ها در آن معتبر نیستند ، از نام متغیر و a استفاده کنید -var
گزینه با تطبیق برای تعیین یک فایل ورودی اگر -زیرجلد گزینه است
به هر کدام داده می شود -var گزینه، تنها یک زیرجلد از آن فایل استفاده می شود. اگر -تکرار is
مشخص شده، فایل یا باید فقط یک زیرجلد داشته باشد یا دارای آن باشد -زیرجلد
گزینه مشخص شده است. همه فایل هایی که استفاده نمی کنند -تکرار باید به همان تعداد باشد
حجم های فرعی درخواست شده برای استفاده فرمت از به شرح زیر است:
عبارات شامل ثابت ها، متغیرها، عملگرها، پرانتزها و توابع هستند.
در نماد infix، مانند 'exp(-x + 3) * مقیاس'. متغیرها رشته هایی از هر کدام هستند
طول، با استفاده از کاراکترهای az، AZ، 0-9، و _، اما ممکن است نام یک
ثابت نامگذاری شده است. در حال حاضر، تنها یک ثابت به نام PI وجود دارد. اپراتورها
عبارتند از +، -، *، /، ^، >، <، >=، <=، ==، !=، !، &&، ||. اینها مانند C رفتار می کنند، به جز
که ^ توان است، یعنی pow(x, y) و اولویت بیشتری نسبت به سایرین دارد
عملگرهای باینری (همچنین، '-3^-4^-5' به معنای '-(3^(-(4^-5)))'). <=، >=، ==، و !=
به اپراتورها مقدار کمی از اتاق تکان دادن، برابر با یک میلیونیم داده می شود
کوچکتر از مقادیر مطلق مقادیر مقایسه شده.
عملگرهای مقایسه و منطقی 0 یا 1 را برمیگردانند، میتوانید ماسک کردن را با عبارات انجام دهید
مانند 'x * (ماسک > 0)'. برای همه عملگرهای منطقی، یک ورودی if true در نظر گرفته می شود
بیشتر از 0 است. عبارت '0 < x < 5' از نظر نحوی اشتباه نیست، اما
آن چیزی که مورد نظر است را انجام نمی دهد، زیرا از چپ به راست ارزیابی می شود، یعنی '((0
x) < 5)'، که همیشه 1 را برمی گرداند، همانطور که هر دو نتیجه ممکن مقایسه هستند
کمتر از 5. در صورت شناسایی عبارتی از این نوع، یک هشدار ایجاد می شود.
از چیزی مانند 'x > 0 && x < 5' برای به دست آوردن رفتار مورد نظر استفاده کنید.
فضای خالی بین عناصر نادیده گرفته می شود، ' sin ( 2 * x ) ' معادل است
'sin(2*x)'، اما 's in(2*x)' یک خطا است. ضرب ضمنی مجاز نیست،
عبارت '2x' به عنوان یک متغیر تجزیه خواهد شد. پرانتزها () هستند، استفاده نکنید
[] یا {}. توابع به پرانتز نیاز دارند، عبارت 'sin x' یک خطا است.
توابع زیر پشتیبانی می شوند:
sin: 1 آرگومان، سینوس برهان (واحدها رادیان هستند) cos: 1 آرگومان، the
کسینوس برهان (واحدها رادیان هستند) tan: 1 آرگومان، مماس از
آرگومان (واحدها رادیان هستند) asin: 1 آرگومان، معکوس سینوس برهان،
در رادیان acos: 1 آرگومان، معکوس کسینوس آرگومان، بر حسب رادیان
آتان: 1 آرگومان، معکوس مماس برهان، بر حسب رادیان atan2: 2
آرگومان ها، atan2(y, x) معکوس مماس را برمی گرداند
(y/x)، در رادیان، تعیین ربع با علامت هر دو استدلال
sinh: 1 آرگومان، سینوس هذلولی آرگومان cosh: 1 آرگومان، the
کسینوس هذلولی از آرگومان tanh: 1 آرگومان، مماس هذلولی از
آرگومان asinh: 1 آرگومان، سینوس هذلولی معکوس آرگومان acosh: 1
آرگومان، کسینوس هذلولی معکوس آرگومان atanh: 1 آرگومان، the
مماس معکوس هایپربولوک آرگومان ln: آرگومان 1، لگاریتم طبیعی
آرگومان exp: 1 آرگومان، ثابت e به قدرت آرگومان افزایش یافته است
log: 1 آرگومان، لگاریتم پایه 10 آرگومان sqrt: 1 آرگومان، مربع
ریشه آرگومان abs: 1 آرگومان، قدر مطلق آرگومان کف: 1
آرگومان، بزرگترین عدد صحیح بزرگتر از آرگومان دور: 1 آرگومان، the
نزدیکترین عدد صحیح، با پیوندهای گرد شده از
صفر
ceil: 1 آرگومان، کوچکترین عدد صحیح کمتر از آرگومان min: 2 آرگومان،
min(x, y) y را برمی گرداند اگر (x > y)، x در غیر این صورت max: 2 آرگومان، max(x, y) y را برمی گرداند
اگر (x < y)، x در غیر این صورت mod: 2 آرگومان، mod(x، y) = x - y * طبقه (x / y)، یا 0 اگر
y == 0 گیره: 3 آرگومان، گیره (x، کم، زیاد) = حداقل (حداکثر (x، کم)، زیاد)
-حجم-ادغام فایل های حجم را در یک فایل جدید ادغام کنید
wb_command -حجم-ادغام
- خروجی - فایل حجم خروجی
[-volume] - قابل تکرار - یک فایل حجم ورودی را مشخص کنید
- یک فایل حجمی برای استفاده از زیرجلدها
[-subvolume] - قابل تکرار - یک زیرجلد واحد را برای استفاده انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
[-up-to] - از یک محدوده فراگیر از حجم های فرعی استفاده کنید
- شماره یا نام آخرین زیرجلد به
شامل
[-reverse] - از محدوده به ترتیب معکوس استفاده کنید
یک یا چند فایل حجمی را می گیرد و با الحاق یک فایل حجمی جدید می سازد
حجم های فرعی از آنها فایل های حجم ورودی باید فضای حجم یکسانی داشته باشند.
مثال: wb_command -حجم-ادغام out.nii -جلد first.nii -زیرجلد 1 -جلد
second.nii
این مثال اولین زیرجلد را از first.nii و به دنبال آن همه می گیرد
زیر جلدها را از second.nii، و اینها را به out.nii بنویسید.
-پالت حجمی پالت یک فایل حجمی را تنظیم کنید
wb_command -پالت حجمی
- فایل حجم برای تغییر - حالت نقشه برداری
[-subvolume] - یک زیر جلد را انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
[-pos-percent] - درصد حداقل/حداکثر برای رنگ آمیزی داده های مثبت
- صدک برای حداقل داده های مثبت -
صدک برای مثبت ترین داده ها
[-نفی-درصد] - درصد حداقل/حداکثر برای رنگآمیزی دادههای منفی
- صدک برای کمترین داده های منفی -
صدک برای منفی ترین داده ها
[-pos-user] - مقادیر حداقل/حداکثر کاربر برای رنگ آمیزی داده های مثبت
- مقدار کمترین داده های مثبت - ارزش
برای مثبت ترین داده ها
[-neg-user] - مقادیر حداقل/حداکثر کاربر برای رنگآمیزی دادههای منفی
- مقدار کمترین داده منفی - ارزش
برای منفی ترین داده ها
[-interpolate] - رنگ ها را درون یابی می کند
- بولی، آیا درون یابی شود
[-disp-pos] - نمایش داده های مثبت
- بولی، آیا برای نمایش
[-disp-neg] - نمایش داده های مثبت
- بولی، آیا برای نمایش
[-disp-zero] - نمایش دادهها نزدیکتر به صفر از حداقل برش
- بولی، آیا برای نمایش
[-palette-name] - پالت مورد استفاده را تنظیم کنید
- نام پالت
[-thresholding] - آستانه را تنظیم کنید
- تنظیم آستانه - نمایش مقادیر داخل یا خارج از آستانه
- آستانه پایین تر - آستانه بالایی
فایل حجم اصلی با نسخه اصلاح شده رونویسی شده است.
By
به طور پیش فرض، تمام ستون های فایل حجم با تنظیمات جدید تنظیم می شوند، از
-زیرجلد گزینه ای برای تغییر تنها یک جلد فرعی. تنظیمات نقشه برداری در آن مشخص نشده است
گزینه ها از زیرجلد اول گرفته می شود. را استدلال باید یکی از
به شرح زیر است:
MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE
در استدلال به -palette-name باید یکی از موارد زیر باشد:
PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL نارنجی-زرد خاکستری_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG قرمز-زرد آبی-آبی روشن FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256
در استدلال به آستانه گذاری باید یکی از موارد زیر باشد:
THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL
در استدلال به آستانه گذاری باید یکی از موارد زیر باشد:
THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE
حجم- بسته-نمونه برداری بسته های حجمی صاف و دوباره نمونه برداری کنید
wb_command حجم- بسته-نمونه برداری
- حجم داده های ورودی - حجم برچسب از جایی که
بسته ها در حال حاضر هستند - حجم برچسب جایی که بسته ها باید باشد
- سیگمای هسته گاوسی که در طول نمونه برداری مجدد صاف می شود -
خروجی - حجم خروجی
[-fix-zeros] - مقادیر صفر را به عنوان داده ای در نظر نمی گیرند
[-subvolume] - یک زیرجلد واحد را به عنوان ورودی انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
منطقه داخل هر برچسب را در بستههای کوچک به منطقه از هموار میکند و نمونهبرداری میکند
همان نام برچسب در بسته های جدید. هر وکسل در ناحیه برچسب خروجی اما
خارج از منطقه برچسب ورودی از داده های نزدیک برون یابی خواهد شد. در
-تثبیت صفرها گزینه باعث می شود که هموارسازی از مقدار ورودی استفاده نکند اگر صفر باشد، اما
همچنان یک مقدار صاف شده روی وکسل بنویسید و بعد از هموارسازی کامل می شود
مقادیر باقیمانده صفر را بررسی کنید و آنها را با مقادیر برون یابی پر کنید.
توجه: همه حجم ها باید دارای ابعاد و فاصله یکسان باشند.
برای استفاده از
فضای خروجی متفاوت را ببینید حجم- بسته-نمونه-نمونه-عمومی.
حجم- بسته-نمونه-نمونه-عمومی بسته های حجمی صاف و نمونه برداری مجدد از حجم های مختلف
فضا
wb_command حجم- بسته-نمونه-نمونه-عمومی
- حجم داده های ورودی - حجم برچسب از جایی که
بسته ها در حال حاضر هستند - حجم برچسب جایی که بسته ها باید باشد
- سیگمای هسته گاوسی که در طول نمونه برداری مجدد صاف می شود -
خروجی - حجم خروجی
[-fix-zeros] - مقادیر صفر را به عنوان داده ای در نظر نمی گیرند
[-subvolume] - یک زیرجلد واحد را به عنوان ورودی انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
منطقه داخل هر برچسب را در بستههای کوچک به منطقه از هموار میکند و نمونهبرداری میکند
همان نام برچسب در بسته های جدید. هر وکسل در ناحیه برچسب خروجی اما
خارج از منطقه برچسب ورودی از داده های نزدیک برون یابی خواهد شد. در
-تثبیت صفرها گزینه باعث می شود که هموارسازی از مقدار ورودی استفاده نکند اگر صفر باشد، اما
همچنان یک مقدار صاف شده روی وکسل بنویسید و بعد از هموارسازی کامل می شود
مقادیر باقیمانده صفر را بررسی کنید و آنها را با مقادیر برون یابی پر کنید.
حجم خروجی از فضای حجمی بسته های جدید استفاده می کند که نیازی به این کار نیست
در همان فضای حجم ورودی باشد.
-حجم-پست-صاف کننده بسته های صاف در یک حجم به طور جداگانه
wb_command -حجم-پست-صاف کننده
- حجم برای صاف کردن - یک جلد برچسب حاوی
بسته ها برای صاف کردن - سیگمای هسته صاف کننده گاوسی، برحسب میلی متر
- خروجی - حجم خروجی
[-fix-zeros] - مقادیر صفر را به عنوان داده ای در نظر نمی گیرند
[-subvolume] - یک زیرجلد واحد را برای صاف کردن انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
حجم در هر برچسب در جلد برچسب فقط با استفاده از دادههای از هموار میشود
در داخل برچسب معادل صاف کردن حجم در حال اجرا با ROI مطابق با هر کدام
به طور جداگانه برچسب بزنید، سپس حجم های حاصل را اضافه کنید، اما سریعتر.
-کاهش حجم انجام عملیات کاهش در میان حجم های فرعی
wb_command -کاهش حجم
- حجم فایل برای کاهش - اپراتور کاهش برای استفاده
- خروجی - حجم خروجی
[-exclude-outliers] - موارد پرت را از هر سری زمانی بر اساس استاندارد حذف کنید
انحراف - تعداد انحرافات استاندارد کمتر از میانگین به
شامل
- تعداد انحرافات استاندارد بالاتر از میانگین به
شامل
برای هر وکسل، دادهها را در زیر حجمها بهعنوان یک بردار میگیرد و آن را انجام میدهد
کاهش مشخص شده روی آن، قرار دادن نتیجه در حجم خروجی واحد
voxel. اپراتورهای کاهش به شرح زیر است:
MAX: حداکثر مقدار MIN: حداقل مقدار INDEXMAX: شاخص مبتنی بر 1
حداکثر مقدار INDEXMIN: شاخص مبتنی بر 1 از حداقل مقدار SUM: همه مقادیر را اضافه کنید
محصول: همه مقادیر را ضرب کنید MEAN: میانگین داده STDEV: استاندارد
انحراف (مخرج N) SAMPSTDEV: نمونه انحراف استاندارد (N-1
مخرج) VARIANCE: واریانس داده ها MEDIAN: میانه داده ها
MODE: حالت داده COUNT_NONZERO: تعداد عناصر غیر صفر در
داده ها
-حجم-حذف-جزایر جزایر را از یک حجم ROI حذف کنید
wb_command -حجم-حذف-جزایر
- حجم ROI ورودی - خروجی - حجم ROI خروجی
تمام قسمتهای متصل به چهره ROI را پیدا میکند و همه جز بزرگترین آنها را صفر میکند.
- تغییر جهت حجم ترتیب VOXEL یک فایل حجمی را تغییر دهید
wb_command - تغییر جهت حجم
- حجم برای تغییر جهت - جهت گیری مورد نظر
- خارج - حجم تغییر یافته
ترتیب وکسل و فاصله سرصفحه/ اطلاعات مبدا را طوری تغییر می دهد که
ارزش هر نقطه مکانی بدون تغییر است. رشتههای جهتیابی شبیه «LPI» هستند،
که به این معنی است که شاخص اول از چپ به راست، دوم عقب به قدامی است و
سوم پست تر از برتر است. کاراکترهای معتبر عبارتند از:
L از چپ به راست
R راست به چپ
P خلفی به قدامی
یک قدامی به خلفی
من پایین تر از برترم
S برتر از فرودست
-حجم-رویس-از-افراط از EXTREMA MAPS، VOLUME ROI Maps ایجاد کنید
wb_command -حجم-رویس-از-افراط
- حجم ورودی - محدودیت فاصله از مرکز وکسل، بر حسب میلی متر
- خروجی - حجم خروجی
[-gaussian] - به جای ROI مسطح، یک هسته گاوسی تولید کنید
- سیگما برای هسته گاوسی، بر حسب میلی متر
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را برای استفاده انتخاب کنید
- منطقه مورد استفاده
[-overlap-logic] - نحوه رسیدگی به ROIهای همپوشانی، پیش فرض ALLOW
- روش حل همپوشانی ها
[-subvolume] - یک زیر جلد را برای گرفتن گرادیان انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
برای هر مقدار غیر صفر در هر نقشه، یک نقشه با ROI در اطراف آن مکان ایجاد کنید.
اگر -گاوسی گزینه مشخص شده است، سپس هسته های گاوسی نرمال شده خروجی می شوند
به جای ROI. در استدلال به همپوشانی-منطق باید یکی از ALLOW باشد،
نزدیکترین، یا EXCLUDE. ALLOW پیشفرض است و به این معنی است که ROIها درمان میشوند
به طور مستقل و ممکن است همپوشانی داشته باشند. CLOSEST به این معنی است که ROI ممکن است همپوشانی نداشته باشد و این
هیچ ROI حاوی رئوس هایی است که به یک راس بذر متفاوت نزدیکتر هستند. EXCLUDE یعنی
که ROI ها ممکن است همپوشانی نداشته باشند و هر رأسی در محدوده بیش از یک ROI باشد
به هیچ ROI تعلق ندارد.
-حجم-مجموعه-فضا تغییر اطلاعات فضای صدا
wb_command -حجم-مجموعه-فضا
- حجم ورودی - خروجی - حجم خروجی
[-plumb] - تنظیم از طریق ترتیب محور و فاصله / افست
- رشته ای مانند 'XYZ' که مشخص می کند کدام شاخص در امتداد قرار دارد
کدام بعد فضایی
- تغییر در مختصات x از افزایش مربوطه
شاخص
- تغییر در مختصات y از افزایش مربوطه
شاخص
- تغییر در مختصات z از افزایش مربوطه
شاخص
- مختصات x اولین وکسل - مختصات y از
اولین وکسل - مختصات z اولین وکسل
[-sform] - تنظیم از طریق شکل نیفتی
- افزایش مختصات x از افزایش شاخص i
- افزایش مختصات x از افزایش شاخص j - افزایش در
مختصات x از افزایش شاخص k - مختصات x اولین وکسل
- افزایش مختصات y از افزایش شاخص i
- افزایش مختصات y از افزایش شاخص j - افزایش در
مختصات y از افزایش شاخص k - مختصات y اولین وکسل
- افزایش مختصات z از افزایش شاخص i
- افزایش مختصات z از افزایش شاخص j - افزایش در
مختصات z از افزایش شاخص k - مختصات z اولین وکسل
یک کپی از فایل حجم می نویسد، با اطلاعات فاصله به عنوان تغییر کرده است
مشخص شده. هیچ ترتیب مجدد داده های وکسل رخ نمی دهد. دقیقا یکی از -شقق or
شکل دادن باید مشخص شود.
-صاف کننده حجم یک فایل حجمی را صاف کنید
wb_command -صاف کننده حجم
- حجم برای صاف کردن - سیگمای هسته صاف کننده گاوسی،
در میلی متر - خروجی - حجم خروجی
[-roi] - فقط از دادههای درون ROI صاف میشود
- حجم برای استفاده به عنوان ROI
[-fix-zeros] - مقادیر صفر را به عنوان داده ای در نظر نمی گیرند
[-subvolume] - یک زیرجلد واحد را برای صاف کردن انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
هموارسازی گاوسی برای حجم ها.
به طور پیش فرض، همه حجم های فرعی را با هم صاف می کند
بدون ROI، اگر ROI داده شود، فقط وکسل های مثبت در حجم ROI مقادیر خود را دارند
استفاده می شود و تمام وکسل های دیگر روی صفر تنظیم می شوند. صاف کردن یک حجم غیر متعامد خواهد بود
به طور قابل توجهی کندتر باشد، زیرا عملیات را نمی توان از هم جدا کرد
صاف کردن یک بعدی بدون تغییر شکل هسته.
La -تثبیت صفرها گزینه باعث می شود که هموارسازی از یک مقدار ورودی در صورت صفر استفاده نکند،
اما همچنان یک مقدار هموار شده برای وکسل بنویسید. این برای صفرهایی که مفید است
نشان دهنده کمبود اطلاعات است که مانع از کاهش شدت آن می شود
وکسل های نزدیک، در حالی که به صفر یک مقدار برون یابی می دهد.
حجم-آمار آمار فضایی در یک فایل حجمی
wb_command حجم-آمار
- حجم ورودی
[-reduce] - از عملیات کاهش استفاده کنید
- عملیات کاهش
[-percentile] - مقدار را در صدک بدهید
- صدک برای پیدا کردن
[-subvolume] - نمایش خروجی فقط برای یک زیرجلد
- شماره یا نام زیرجلد
[-roi] - فقط داده های داخل یک roi را در نظر بگیرید
- roi، به عنوان یک فایل حجمی
[-match-maps] - هر زیرجلد ورودی از متن مربوطه استفاده می کند
زیر جلد از فایل roi
[-show-map-name] - فهرست و نام نقشه را قبل از هر خروجی چاپ کنید
برای هر زیر جلد از ورودی، یک عدد منفرد چاپ می شود که از
کاهش یا صدک مشخص شده. استفاده کنید -زیرجلد فقط خروجی بدهد
برای یک زیر جلد استفاده کنید -روی فقط داده های یک منطقه را در نظر بگیرید.
دقیقا یکی از -كاهش دادن or -درصد باید مشخص شود.
استدلال به -كاهش دادن گزینه باید یکی از موارد زیر باشد:
MAX: حداکثر مقدار MIN: حداقل مقدار INDEXMAX: شاخص مبتنی بر 1
حداکثر مقدار INDEXMIN: شاخص مبتنی بر 1 از حداقل مقدار SUM: همه مقادیر را اضافه کنید
محصول: همه مقادیر را ضرب کنید MEAN: میانگین داده STDEV: استاندارد
انحراف (مخرج N) SAMPSTDEV: نمونه انحراف استاندارد (N-1
مخرج) VARIANCE: واریانس داده ها MEDIAN: میانه داده ها
MODE: حالت داده COUNT_NONZERO: تعداد عناصر غیر صفر در
داده ها
-volume-tfce TFCE را روی یک فایل حجمی انجام دهید
wb_command -volume-tfce
- میزان صدا برای اجرای TFCE - خروجی - حجم خروجی
[-presmooth] - قبل از اجرای TFCE صدا را صاف کنید
- سیگما برای هسته صاف کننده گاوسی، بر حسب میلی متر
[-roi] - یک منطقه مورد علاقه را برای اجرای TFCE انتخاب کنید
- ناحیه ای برای اجرای TFCE به عنوان حجم
[-parameters] - پارامترها را برای انتگرال TFCE تنظیم کنید
- توان برای حجم خوشه (پیشفرض 0.5) - توان برای مقدار آستانه
(پیش فرض 2.0)
[-subvolume] - یک زیر جلد را انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
افزایش خوشه بدون آستانه روشی برای افزایش ارزش نسبی است
مناطقی که در یک آزمون آستانه استاندارد، خوشه ها را تشکیل می دهند. این هست
با ارزیابی انتگرال از:
e(h، p)^E * h^H * dh
در هر راس p، جایی که h از 0 تا حداکثر مقدار در داده ها متغیر است و e(h،
p) وسعت خوشه حاوی راس p در آستانه h است. منفی
مقادیر به طور مشابه با نفی داده ها، اجرای همان فرآیند و
نفی نتیجه
این روش در: Smith SM، Nichols TE.، "Threshold-free cluster توضیح داده شده است.
افزایش: رسیدگی به مشکلات هموارسازی، وابستگی آستانه و
محلی سازی در استنتاج خوشه ای." Neuroimage. 2009 Jan 1;44(1): 83-98. PMID:
18501637
حجم به سطح نقشه برداری نقشه حجم تا سطح
wb_command حجم به سطح نقشه برداری
- حجم به نقشه داده ها از - سطحی که داده ها را روی آن نقشه برداری کنید
- خروجی - فایل متریک خروجی
[-trilinear] - از درونیابی حجمی سه خطی استفاده کنید
[-Enclosing] - مقدار استفاده از وکسل محصور کننده
[-cubic] - از splines مکعبی استفاده کنید
[-ribbon-constrained] - از الگوریتم نگاشت محدود نواری استفاده کنید
- سطح داخلی روبان - سطح بیرونی
روبان
[-volume-roi] - از حجم roi استفاده کنید
- فایل حجم
[-voxel-subdiv] - تقسیم وکسل در حین تخمین وزن وکسل
- تعداد زیربخش ها، پیش فرض 3
[-output-weights] - وزن وکسل را برای یک راس به یک حجم بنویسید
فایل - عدد راس برای بدست آوردن وزن وکسل، بر اساس 0
- خروجی - حجم برای نوشتن وزن ها
[-myelin-style] - از روش نقشه برداری میلین استفاده کنید
- یک حجم roi از روبان قشری برای این
نیمکره
- فایل متریک با ضخامت قشر مغز - هسته گواسین بر حسب میلی متر
برای وزن دهی وکسل ها در محدوده
[-subvol-select] - یک زیرجلد واحد را برای نقشه انتخاب کنید
- شماره یا نام زیرجلد
شما باید دقیقا یک روش نقشه برداری را مشخص کنید.
وکسل محصور کننده از
مقدار از وکسل راس در داخل قرار دارد، در حالی که trilinear یک خطی سه بعدی را انجام می دهد
درون یابی بر اساس وکسل های بلافاصله در هر طرف راس
موقعیت.
روش نگاشت نواری یک چندوجهی از همسایه های رأس می سازد
هر سطح، و مقدار حجم این چند وجهی را که می افتد، تخمین می زند
در داخل هر وکسل نزدیک، برای استفاده به عنوان وزن برای نمونه برداری. ROI حجم است
مفید برای حذف اثرات حجم جزئی وکسل هایی که سطوح از آن عبور می کنند، و
باعث می شود که نگاشت وکسل هایی را که دارای مقدار مثبت نیستند نادیده بگیرد
ماسک شماره تقسیم بندی مشخص می کند که چگونه مقدار آن را تقریب می کند
با تقسیم هر وکسل به قطعات NxNxN، چند وجهی را قطع می کند و
بررسی اینکه آیا مرکز هر قطعه در داخل چند وجهی است یا خیر. اگر تو داری
وکسل های بسیار بزرگ، اگر در خروجی خود صفر دریافت کردید، آن را افزایش دهید.
روش سبک میلین از بخشی از دستور نگاشت میلین caret5 برای انجام این کار استفاده می کند
نگاشت: برای هر رأس سطح، تمام وکسل ها را نزدیک تر از ضخامت آن بگیرید
راس هایی که در داخل ROI نوار قرار دارند و کمتر از نصف مقدار ضخامت آن فاصله دارند
از راس در امتداد جهت سطح نرمال، و یک گاوسی اعمال کنید
هسته با سیگمای مشخص شده به آنها برای دریافت وزن ها برای استفاده.
حجم-بردار-عملیات یک عملیات برداری بر روی فایل های حجمی انجام دهید
wb_command حجم-بردار-عملیات
- اولین فایل ورودی وکتور - فایل ورودی وکتور دوم
- چه عملیات برداری انجام شود - خروجی - فایل خروجی
[-normalize-a] - بردارهای ورودی اول را عادی می کند
[-normalize-b] - بردارهای ورودی دوم را عادی می کند
[-normalize-output] - عادی سازی بردارهای خروجی (برای نقطه معتبر نیست
تولید - محصول)
[-magnitude] - خروجی بزرگی نتیجه (برای نقطه معتبر نیست
تولید - محصول)
روی دو فایل حجمی (که باید مضربی از 3 داشته باشند) عملیات برداری انجام می دهد
حجم های فرعی). هر یک از ورودی ها ممکن است چندین بردار داشته باشد (بیش از 3
زیرجلدها)، اما نه هر دو (حداقل یکی باید دقیقاً 3 جلد فرعی داشته باشد). در
-اندازه و -Ormalize-output ممکن است گزینه ها با هم یا با هم مشخص نشوند
عملیات DOT. در پارامتر باید یکی از موارد زیر باشد:
نقطه متقاطع اضافه کردن تفریق
-volume-warpfield-resample حجم را با استفاده از وارپفیلد دوباره نمونه کنید
wb_command -volume-warpfield-resample
- حجم برای نمونه گیری مجدد - میدان جنگ برای اعمال
- یک فایل حجمی در فضای حجمی که برای آن می خواهید
تولید
- روش نمونه گیری مجدد - خروجی - حجم خروجی
[-fnirt] - در صورت استفاده از fnirt warpfield باید استفاده شود
- حجم منبع مورد استفاده در هنگام تولید warpfield
یک فایل حجمی را با یک warpfield مجدداً نمونه برداری کنید.
روش های پیشنهادی عبارتند از
CUBIC (مکعب spline) برای بیشتر داده ها، و ENCLOSING_VOXEL برای داده های برچسب. در
پارامتر باید یکی از:
CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR
آمار حجم وزن آمارهای فضایی وزنی روی یک فایل حجمی
wb_command آمار حجم وزن
- حجم ورودی
[-weight-volume] - از وزن های فایل حجمی استفاده کنید
- فایل حجمی حاوی اوزان
[-subvolume] - نمایش خروجی فقط برای یک زیرجلد
- شماره یا نام زیرجلد
[-roi] - فقط داده های داخل یک roi را در نظر بگیرید
- roi، به عنوان یک فایل حجمی
[-match-maps] - هر زیرجلد ورودی از متن مربوطه استفاده می کند
زیر جلد از فایل roi
[-mean] - میانگین وزنی را محاسبه کنید
[-stdev] - محاسبه انحراف استاندارد وزنی
[-sample] - برآورد جمعیت stdev از نمونه
[-percentile] - صدک وزنی را محاسبه کنید
- صدک برای پیدا کردن
[-sum] - جمع وزنی را محاسبه کنید
[-show-map-name] - فهرست و نام نقشه را قبل از هر خروجی چاپ کنید
برای هر زیر جلد از ورودی، یک عدد منفرد چاپ می شود که از
عملیات مشخص شده اگر -وزن حجم مشخص نشده است، حجم هر وکسل است
استفاده شده. استفاده کنید -زیرجلد برای دادن خروجی فقط برای یک زیرجلد. استفاده کنید -روی به
فقط داده های یک منطقه را در نظر بگیرید. دقیقا یکی از -منظور داشتن, -stdev, -درصد
or -جمع باید مشخص شود.
با استفاده از -جمع بدون -وزن حجم معادل ادغام با توجه به
جلد.
-wbsparse-merge-dense فایل های WBSPARSE را در امتداد ابعاد متراکم ادغام کنید
wb_command -wbsparse-merge-dense
- کدام بعد برای ادغام، ROW یا COLUMN - خروجی
- فایل wbsparse خروجی
[-wbsparse] - قابل تکرار - یک فایل wbsparse ورودی را مشخص کنید
- یک فایل wbsparse برای ادغام
فایلهای wbsparse ورودی باید دارای نگاشتهای منطبق در جهت نه باشند
مشخص شده است، و نقشه برداری در امتداد جهت مشخص شده باید مدل های مغز باشد.
فایل-زیپ-صحنه یک فایل صحنه و فایل های داده آن را ZIP کنید
wb_command فایل-زیپ-صحنه
- فایل صحنه برای ساخت فایل فشرده از - نام
پوشه ای که در زمانی که فایل فشرده ایجاد می شود
باز کردن زیپ
- out - فایل فشرده ای که ایجاد خواهد شد
[-base-dir] - دایرکتوری را مشخص کنید که همه فایل های داده در جایی هستند
در داخل، این به ریشه ساختار دایرکتوری zipfile تبدیل می شود
- دایرکتوری
اگر فایل فشرده از قبل وجود داشته باشد، بازنویسی خواهد شد.
If -پایه- کارگردان نیست
مشخص شده، دایرکتوری حاوی فایل صحنه برای دایرکتوری پایه استفاده می شود.
فایل صحنه باید فقط شامل مسیرهای نسبی باشد و هیچ فایل داده ای ممکن است خارج نباشد
دایرکتوری پایه
فایل-zip-spec یک فایل SPEC و فایل های داده آن را ZIP کنید
wb_command فایل-zip-spec
- فایل مشخصات برای افزودن به فایل فشرده - نام
پوشه ای که در زمانی که فایل فشرده ایجاد می شود
باز کردن زیپ
- out - فایل فشرده ای که ایجاد خواهد شد
[-base-dir] - دایرکتوری را مشخص کنید که همه فایل های داده در جایی هستند
در داخل، این به ریشه ساختار دایرکتوری zipfile تبدیل می شود
- دایرکتوری
اگر فایل فشرده از قبل وجود داشته باشد، بازنویسی خواهد شد.
If -پایه- کارگردان نیست
مشخص شده، دایرکتوری حاوی فایل spec برای دایرکتوری پایه استفاده می شود.
فایل مشخصات باید فقط شامل مسیرهای نسبی باشد و هیچ فایل داده ای ممکن است خارج نباشد
دایرکتوری پایه فایلهای صحنه داخل فایلهای مشخصات برای چه فایلهایی بررسی نمیشوند
آنها به آنها ارجاع می دهند، اطمینان حاصل کنید که تمام فایل های داده ای که توسط فایل های صحنه ارجاع می شوند نیز هستند
توسط فایل مشخصات ارجاع داده شده است.
با استفاده از خدمات onworks.net از wb_command به صورت آنلاین استفاده کنید