این دستور wordfindere است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
wordfinder - توالی های بزرگ را با یک یا چند دنباله دیگر مطابقت دهید
خلاصه
کلمه یاب - توالی seqset -توالی seqall [-فایل اطلاعات matrixf] -گپاپن شناور
-gapextend شناور [-عرض عدد صحیح] [-وردلن عدد صحیح] [-تطابق محدود عدد صحیح]
[-محدود کردن عدد صحیح] [-کم تطابق عدد صحیح] [-کم تراز کردن عدد صحیح] -outfile تراز
[-پرونده خطا مجموعه]
کلمه یاب -کمک
شرح
کلمه یاب یک برنامه خط فرمان از EMBOSS ("European Molecular Biology Open
بسته نرم افزاری"). این بخشی از گروه(های) فرمان "Alignment:Local" است.
OPTIONS
ورودی بخش
- توالی seqset
-توالی seqall
-فایل اطلاعات matrixf
این فایل ماتریس امتیازدهی است که هنگام مقایسه توالی ها استفاده می شود. به طور پیش فرض آن است
فایل "EBLOSUM62" (برای پروتئین ها) یا فایل "EDNAFULL" (برای توالی های نوکلئیک). اینها
فایل‌ها در فهرست «داده» نصب EMBOSS یافت می‌شوند.
ضروری بخش
-گپاپن شناور
مقدار پیش‌فرض: @($(acdprotein)؟ 30.0 : 30.0)
-gapextend شناور
مقدار پیش‌فرض: @($(acdprotein)؟ 1.5 : 1.5)
اضافی بخش
-عرض عدد صحیح
مقدار پیش فرض: 16
-وردلن عدد صحیح
مقدار پیش فرض: 6
-تطابق محدود عدد صحیح
-محدود کردن عدد صحیح
-کم تطابق عدد صحیح
-کم تراز کردن عدد صحیح
تولید بخش
-outfile تراز
-پرونده خطا مجموعه
فایل خطا برای نوشتن به مقدار پیش فرض: wordfinder.error
با استفاده از خدمات onworks.net از wordfindere به صورت آنلاین استفاده کنید
